Homolog FCF1 proteina prerade rRNK je protein koji je kod ljudi kodiran genom FCF1.

FCF1
Identifikatori
AliasiFCF1
Vanjski ID-jeviMGI: 1920986 HomoloGene: 5706 GeneCards: FCF1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 14 (čovjek)
Hrom.Hromosom 14 (čovjek)[1]
Hromosom 14 (čovjek)
Genomska lokacija za FCF1
Genomska lokacija za FCF1
Bend14q24.3Početak74,713,144 bp[1]
Kraj74,738,620 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 12 (miš)
Hrom.Hromosom 12 (miš)[2]
Hromosom 12 (miš)
Genomska lokacija za FCF1
Genomska lokacija za FCF1
Bend12|12 D1Početak85,017,671 bp[2]
Kraj85,030,077 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta small-subunit processome
Jedarce
jedro
nukleoplazma
Biološki proces ribosome biogenesis
rRNA processing
endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_015962
NM_001318508

NM_028632

RefSeq (bjelančevina)

NP_001305437
NP_057046

NP_082908

Lokacija (UCSC)Chr 14: 74.71 – 74.74 MbChr 12: 85.02 – 85.03 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Neokarakterizirani protrini Fcf1 i Fcf2 Saccharomyces cerevisiae, kodirani otvorenim okvirom čitanja YDR339c, odnosno YLR051c, identificirani su u eksperimentu za tandemsko prečišćavanje afiniteta poznatog 40S faktora Faf1p. Većina proteina povezanih s TAP-Faf1p su transaktivni faktori koji su uključeni u preradu pre-rRNK i biogenezu podjedinice 40S, u skladu s prethodno uočenom ulogom Faf1p u sintezi 18S rRNA. Fcf1p i Fcf2p su neophodni i lokaliziraju se u jedarcetu. Iscrpljivanje Fcf1p i Fcf2p dovodi do smanjenja sinteze 18S rRNK, što rezultira deficitom u ribosomskim podjedinicama 40S. Northern blot analiza ukazuje na neefikasnu obradu pre-rRNK na mjestima cijepanja A (0), A (1) i A (2).[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 198 aminokiselina, a molekulska težina 23 370 Da .[7].

1020304050
MGKQKKTRKYATMKRMLSLRDQRLKEKDRLKPKKKEKKDPSALKEREVPQ
HPSCLFFQYNTQLGPPYHILVDTNFINFSIKAKLDLVQSMMDCLYAKCIP
CITDCVMAEIEKLGQKYRVALRIAKDPRFERLPCTHKGTYADDCLVQRVT
QHKCYIVATVDRDLKRRIRKIPGVPIMYISNHRYNIERMPDDYGAPRF
Simboli

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000119616 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021243 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Rempola B, Karkusiewicz I, Piekarska I, Rytka J (Jun 2006). "Fcf1p and Fcf2p are novel nucleolar Saccharomyces cerevisiae proteins involved in pre-rRNA processing". Biochem Biophys Res Commun. 346 (2): 546–54. doi:10.1016/j.bbrc.2006.05.140. PMID 16762320.
  6. ^ "Entrez Gene: FCF1 FCF1 small subunit (SSU) processome component homolog (S. cerevisiae)".
  7. ^ "UniProt, Q9Y324". Pristupljeno 25. 7. 2021.

Dopunska literatura

uredi