FASTKD3
Protein 3 sa domenom kinaze FAST (FASTKD3) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FASTKD3 sa hromosoma 5.[5][6] This protein is part of the Fas-activated serine/threonine kinase domain (FASTKD) containing protein family, which is known for regulating the energy balance of mitochondria under stress.[7][8]
| FASTKD3 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | FASTKD3 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 617530 MGI: 1916827 HomoloGene: 11457 GeneCards: FASTKD3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 5: 7.86 – 7.87 Mb | Chr 13: 68.73 – 68.74 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Aminokiselinska sekvenca
urediDužina polipeptidnog lanca je 662 aminokiseline, а molekulska težina Da. 75.689[9]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MALITLRKNL | YRLSDFQMHR | ALAALKNKPL | NHVHKVVKER | LCPWLCSRQP | ||||
| EPFGVKFHHA | HCKKFHSKNG | NDLHPLGGPV | FSQVSDCDRL | EQNVKNEESQ | ||||
| MFYRRLSNLT | SSEEVLSFIS | TMETLPDTMA | AGALQRICEV | EKKDGDQGLP | ||||
| KEILENSIFQ | ALCFQFEKEP | SQLSNTSLVT | ALQALILLHV | DPQSSLLLNL | ||||
| VAECQNRLRK | GGMEVRNLCI | LGESLITLHS | SGCVTLELII | NQLQGEKLET | ||||
| FTPEDIVALY | RILQACTEKV | DEHQTFLNKI | NNFSLSIVSN | LSPKLISQML | ||||
| TALVVLDQSQ | AFPLIIKLGK | YVVRHVPHFT | NEELRRVLEA | FIYFGHHDTF | ||||
| FTKALEHRVA | AVCLTLDPEV | VCRVMEYCSR | ELILSKPILN | AVAETFVCQT | ||||
| EKFSPRQISA | LMEPFGKLNY | LPPNASALFR | KLENVLFTHF | NYFPPKSLLK | ||||
| LLHSCSLNEC | HPVNFLAKIF | KPLFLQRLQG | KESHLDTLSR | AQLTQLFLAS | ||||
| VLECPFYKGP | KLLPKYQVKS | FLTPCCSLET | PVDSQLYRYV | KIGLTNLLGA | ||||
| RLYFAPKVLT | PYCYTIDVEI | KLDEEGFVLP | STANEDIHKR | IALCIDGPKR | ||||
| FCSNSKHLLG | KEAIKQRHLQ | LLGYQVVQIP | YHEIGMLKSR | RELVEYLQRK | ||||
| LFSQNTVHWL | QE |
Struktura
urediFASTKD3 ima strukturne karakteristike porodice FASTKD, uključujući N-terminalni mitohondrijski ciljni domen i tri C-terminalna domena: dva slična FAST-kinazi (FAST_1 i FAST_2) i RNK-vezujući domen (RAP).[7][8] Mitohondrijski ciljni domen usmjerava FASTKD3 na import u mitohondrije. Iako su funkcije C-terminalnih domena nepoznate, RAP vjerovatno veže RNK tokom trans-splajsinga.[7]
Funkcija
urediKao član porodice FASTKD, FASTKD3 nalazi se u mitohondrijama, kako bi modulirao njihovu energetsku ravnotežu, posebno u uvjetima stresa. Iako je sveprisutno izražen u svim tkivima, FASTKD3 se obilnije pojavljuje u skeletnim i srčanim mišićima, te drugim tkivima obogaćenim mitohondrijama. Predloženo je da FASTKD3 regulira proizvodnju energije, služeći kao protein skele koji okuplja preradu RNK/translaciju i respiratorne komponente.[7]
Klinički značaj
urediDo septembra 2015., nije nađeno da je FASTKD3 povezan sa bilo kojom bolešću.
Interakcije
urediPokazalo se da FASTKD3 ulazi u interakcije sa:
- FASTKD2;
- Proteinima okskidacijskog puta masnih kiselina (ACADVL, ECHS1, HADHA, HADHB, ACAA2);
- Proteinima kataboliznog puta aminokiselina (MCCC1, MCCC2, GLUD1, HIBADH, CPS1);
- Proteinima biosinteze aminokiselina (PYCR1, PYCR2, ALDH18A1, SHMT2, GLS);
- Proteimima TCA-ciklusa (IDH3A, IDH2, SUCLG2, DLST);
- Proteinima lanca ćelijskog disanja (NDUFS1, SDHA, ATP5A1, ETFA, ETFB);
- Peoteinima prerade mitohondrijske RNK (LRPPRC, DHX30, PNPT1); and
- Proteinima mitohhondrijske translacije (TUFM, GFM1, IARS2, MRPS22, TARS2, MRPS2, PTCD1, MTO1, MRPS31).[7]
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124279 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021532 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ UniProt: Q9NYY8
- ^ "Entrez Gene: FAST kinase domains 2".
- ^ a b c d e Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (Oct 2010). "Fast kinase domain-containing protein 3 is a mitochondrial protein essential for cellular respiration". Biochemical and Biophysical Research Communications. 401 (3): 440–6. doi:10.1016/j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.
- ^ a b Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (Jun 2011). "A novel transcription complex that selectively modulates apoptosis of breast cancer cells through regulation of FASTKD2". Molecular and Cellular Biology. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128/MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.
- ^ "UniProt, Q14CZ7" (jezik: engleski). Pristupljeno 15. 10. 2021.
Dopunska kiteratura
uredi- Lai Y, Song M, Hakala K, Weintraub ST, Shiio Y (Nov 2011). "Proteomic dissection of the von Hippel-Lindau (VHL) interactome". Journal of Proteome Research. 10 (11): 5175–82. doi:10.1021/pr200642c. PMC 3208728. PMID 21942715.
- Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (Oct 2010). "Fast kinase domain-containing protein 3 is a mitochondrial protein essential for cellular respiration". Biochemical and Biophysical Research Communications. 401 (3): 440–6. doi:10.1016/j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.
Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.