Čitač FAM47E-STBD1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FAM47E-STBD1 sa hromosoma 4.[3]

FAM47E-STBD1
Identifikatori
AliasiFAM47E-STBD1
Vanjski ID-jeviGeneCards: FAM47E-STBD1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 4 (čovjek)
Hrom.Hromosom 4 (čovjek)[1]
Hromosom 4 (čovjek)
Genomska lokacija za FAM47E-STBD1
Genomska lokacija za FAM47E-STBD1
Bend4q21.1Početak76,251,721 bp[1]
Kraj76,311,129 bp[1]
Ontologija gena
Molekularna funkcija molekularna funkcija
Ćelijska komponenta citoplazma
Biološki proces GO:0022610 biološki proces
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001242939

n/a

RefSeq (bjelančevina)

NP_001130042
NP_001229865
NP_001229868

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 4: 76.25 – 76.31 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 393 aminokiseline, а molekulska težina 45.662 Da.[4].

1020304050
MADRRRRLRPGTLAPVREGVNCRSRCFTKHKNGLKFPTSLHSRQLVFPRK
GLDDFRKGCPPCTGLVTQVPVEGFLPQIYHRAPQLAPKKRQIKLLKEADV
LSKLSPAQQARKAFLEDVEAHLTPHPLALYLNLEEAMPIELLSKVLEVLD
PDRKLEDTWAYCQDTRKGMKEPTKLLKKHSTQVYLGPSKKTSVSNAGQWL
YEEKPHKMDLLHENGPRPGLHENGISDIDEEFILKQFDIDYETKPSHDAL
HTMKLNQVPLELKRSVGLSKLQETEFFQKLGYERKLQKPQNPYKPKWVKM
RYGAWYLNPKLWKKQRVDEPLVDPEVSHKAQEENFKKELQEQEELLADLH
GTVAFKDFILSRGYRTPRFLENMYIGKECKRACNKTPIKRTQA

Funkcija

uredi

Ovaj lokus predstavlja prirodnu transkripciju okvira čitanja između susjednih FAM47E (porodica sa sličnošću sekvence 47, član E) i STBD1 (domen koji vezuje škrob 1) gena na hromosomu 4. Pročitani transkript kodira protein koji dijeli identičnost sekvence sa uzvodnim genskim proizvodom, ali je njegova C-terminalna regija različita zbog pomaka okvira u odnosu na nizvodni gen.[3]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000272414 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ a b "Entrez Gene: FAM47E-STBD1 readthrough".
  4. ^ "UniProt, Q6ZV65" (jezik: engleski). Pristupljeno 26. 10. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.