EVC jest gen kojem je kod ljudi pridružen Ellis-van Creveldov sindrom. Nalazi se na hromosomu 4 i preklapa sa genom CRMP1.[5]

EVC (gen)
Identifikatori
AliasiEVC
Vanjski ID-jeviOMIM: 604831 MGI: 1890596 HomoloGene: 10949 GeneCards: EVC
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 4 (čovjek)
Hrom.Hromosom 4 (čovjek)[1]
Hromosom 4 (čovjek)
Genomska lokacija za EVC (gen)
Genomska lokacija za EVC (gen)
Bend4p16.2Početak5,711,201 bp[1]
Kraj5,814,305 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za EVC (gen)
Genomska lokacija za EVC (gen)
Bend5|5 B3Početak37,446,442 bp[2]
Kraj37,494,238 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001306090
NM_001306092
NM_014556
NM_153717

NM_021292

RefSeq (bjelančevina)

NP_001293019
NP_001293021
NP_714928
NP_001293021.1

NP_067267

Lokacija (UCSC)Chr 4: 5.71 – 5.81 MbChr 5: 37.45 – 37.49 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš
Protein Ellis van Creveldovog sindroma
Gen EVC sa susjedima na kratkom kraku hromosoma 4, regija 4p16
Identifikatori
SimbolEVC
NCBI gen2121
HGNC3497
OMIM604831
RefSeqNM_153717
UniProtP57679
Ostali podaci
LokusHrom. 4 p16
Pretraga za
StruktureSwiss-model
DomeneInterPro

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 992 aminokiseline, а molekulska težina 111.990 Da.[6]

1020304050
MARGGAACKSDARLLLGRDALRPAPALLAPAVLLGAALGLGLGLWLGCRA
GRQRTRHQKDDTQNLLKNLESNAQTPSETGSPSRRRKREVQMSKDKEAVD
ECEPPSNSNITAFALKAKVIYPINQKFRPLADGSSNPSLHENLKQAVLPH
QPVEASPSSSLGSLSQGEKDDCSSSSSVHSATSDDRFLSRTFLRVNAFPE
VLACESVDVDLCIYSLHLKDLLHLDTALRQEKHMMFIQIFKMCLLDLLPK
KKSDDELYQKILSKQEKDLEELEKGLQVKLSNTEMSGAGDSEYITLADVE
KKEREYSEQLIDNMEAFWKQMANIQHFLVDQFKCSSSKARQLMMTLTERM
IAAEGLLCDSQELQALDALERTMGRAHMAKVIEFLKLQVQEETRCRLAAI
SHGLELLAGEGKLSGRQKEELLTQQHKAFWQEAERFSREFVQRGKDLVTA
SLAHQVEGTAKLTLAQEEEQRSFLAEAQPTADPEKFLEAFHEVLERQRLM
QCDLEEEENVRATEAVVALCQELYFSTVDTFQKFVDALFLQTLPGMTGLP
PEECDYLRQEVQENAAWQLGKSNRFRRQQWKLFQELLEQDQQVWMEECAL
SSVLQTHLREDHEGTIRGVLGRLGGLTEESTRCVLQGHDLLLRSALRRLA
LRGNALATLTQMRLSGKKHLLQELREQRALEQGSSQCLDEHQWQLLRALE
ARVLEEASRLEEEAQQTRLQLQQRLLAEAQEVGQLLQQHMECAIGQALLV
HARNAATKSRAKDRDDFKRTLMEAAVESVYVTSAGVSRLVQAYYQQIGRI
MEDHEERKLQHLKTLQGERMENYKLRKKQELSNPSSGSRTAGGAHETSQA
VHQRMLSQQKRFLAQFPVHQQMRLHAQQQQAGVMDLLEAQLETQLQEAEQ
NFISELAALARVPLAESKLLPAKRGLLEKPLRTKRKKPLPQERGDLGVPN
NEDLASGDQTSGSLSSKRLSQQESEAGDSGNSKKMLKRRSNL

Funkcija

uredi

EVC je jedan od dva gena (drugi je EVC2) koji nakon mutacija izazivaju EvC (Ellis-van Creveldov sindrom) kod ljudi i utvrđeno je da djeluje kao pozitivni posrednik za tri ježeve signalne molekule (Hh).[7] Utvrđeno je da miševi s inaktivacijom gena EVC (EVC /) pokazuju slične fizičke karakteristike kao ljudi, kao što su skraćeni udovi i oštećenja zuba.[7] U studiji na 65 osoba pogođenih EvC, mutacije u EVC genu su pronađene kod njih 20, a prvenstveno se pripisuju pomaku okvira koji je rezultirao besmislenim kodonom.[8] Blaže fizičke karakteristike koje nisu u potpunosti povezane s EvC sindromom, poput onih bez očekivanih oralnih deformiteta, također se mogu pripisati mutacijama EVC gena.[9]

Također pogledajte

uredi

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000072840 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029122 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Ruiz-Perez VL, Ide SE, Strom TM, Lorenz B, Wilson D, Woods K, King L, Francomano C, Freisinger P, Spranger S, Marino B, Dallapiccola B, Wright M, Meitinger T, Polymeropoulos MH, Goodship J (mart 2000). "Mutations in a new gene in Ellis-van Creveld syndrome and Weyers acrodental dysostosis". Nature Genetics. 24 (3): 283–6. doi:10.1038/73508. PMID 10700184. S2CID 1391136.
  6. ^ "UniProt, P57679" (jezik: engleski). Pristupljeno 25. 10. 2021.
  7. ^ a b Ruiz-Perez VL, Blair HJ, Rodriguez-Andres ME, Blanco MJ, Wilson A, Liu YN, Miles C, Peters H, Goodship JA (august 2007). "Evc is a positive mediator of Ihh-regulated bone growth that localises at the base of chondrocyte cilia". Development. 134 (16): 2903–12. doi:10.1242/dev.007542. PMID 17660199.
  8. ^ Tompson SW, Ruiz-Perez VL, Blair HJ, Barton S, Navarro V, Robson JL, Wright MJ, Goodship JA (januar 2007). "Sequencing EVC and EVC2 identifies mutations in two-thirds of Ellis-van Creveld syndrome patients". Human Genetics. 120 (5): 663–70. doi:10.1007/s00439-006-0237-7. PMID 17024374. S2CID 28520012.
  9. ^ Ulucan H, Gül D, Sapp JC, Cockerham J, Johnston JJ, Biesecker LG (oktobar 2008). "Extending the spectrum of Ellis van Creveld syndrome: a large family with a mild mutation in the EVC gene". BMC Medical Genetics. 9 (1): 92. doi:10.1186/1471-2350-9-92. PMC 2584628. PMID 18947413.

Vanjski linkovi

uredi