EIF4E1B

EIF4E1B
Identifikatori
Aliasi	EIF4E1B
Vanjski ID-jevi	MGI: 2685119 HomoloGene: 100945 GeneCards: EIF4E1B
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 5 (čovjek)
Kraj	176,646,644 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 13 (miš)
Kraj	54,936,272 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• translation initiation factor activity; • vezivanje sa RNK; • RNA 7-methylguanosine cap binding;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • mRNA cap binding complex; • eukaryotic translation initiation factor 4F complex;
Biološki proces	• translational initiation; • regulation of translation; • Biosinteza bjelančevina;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	253314
	218268
	ENSG00000175766
	ENSMUSG00000074895
	A6NMX2; D6RHE2
	Q3UTA9
	NM_001099408; NM_001375362
	NM_001033269; NM_001039683; NM_001286178; NM_001286179; NM_001286180
	NP_001092878; NP_001362291
	NP_001028441; NP_001034772; NP_001273107; NP_001273108; NP_001273109
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Član 1b faktora 4E porodice proteina eukariotske translacije jest protein koji je kod ljudi kodiran genom EIF4E1B.^[5]

U jednoj studiji iz 2005, polazi se od činjenice da inicijacija translacije u eukariota uključuje regrutiranje iRNK u ribosom koji je kontroliran translacijskim faktorom eIF4E. eIF4E se veže za 5'-m7Gppp-strukturu kape iRNK. Trodimenzijske strukture eIF4E vezane za analoge čepova podsjećaju na "šakaste struktur" u kojima je struktura kape smještena između dva konzervirana ostatka Trp (Trp-56 i Trp-102 iz sapiens eIF4E H. sapiens). Treći konzervirani Trp ostatak (Trp-166 H. sapiens eIF4E) prepoznaje 7-metilni dio kape. Procjena GenBank NR i dbEST baza podataka otkriva da mnogi organizmi kodiraju brojne proteine s homologijom sa eIF4E. Malo se razumije o međusobnim odnosima ovih strukturno povezanih proteina.

Kombinacijom podataka o sekvencama pohranjenim u bazama podataka Genbank identificirane su sekvence koje kodiraju 411 članova porodice eIF4E iz 230 vrsta. Ove sekvence su pohranjene u bazu podataka dostupnu na internetu dizajnirane za poređenje sekvenci članova porodice eIF4E. Većina članova može se grupirati u jednu od tri klase. Pripadnici klase I nose ostatke Trp ekvivalentne Trp-43 i Trp-56 H. sapiens eIF4E i prisutni su u svim eukariotima. Pripadnici klase II imaju zamjene Trp –> Tyr/Phe/Leu i Trp –> Tyr/Phe, u odnosu na Trp-43 i Trp-56 H. sapiens eIF4E, a mogu se identificirati u Metazoama, Viridiplantae i Fungi. Pripadnici klase III posjeduju ostatak Trp ekvivalentan Trp-43 H. sapiens eIF4E, ali nose zamjenu Trp –> Cys/Tyr, u odnosu na Trp-56 H. sapiens eIF4E i mogu se identificirati u Coelomata i Cnidaria. Neki članovi porodice eIF4E iz Protista pokazuju proširenje ili zbijanje u odnosu na prototipske članove porodice eIF4E.

U zaključku se tvrdi da je ekspanzija sekvenciranih cDNK i genomskih DNK iz svih eukariotskih carstava otkrila različite proteine koji su u strukturi povezani sa eIF4E. Evolucijski se čini da je jedan rani gen eIF4E prošao višestruku duplikaciju gena, stvarajući višestruke strukturne klase, tako da više nije moguće predvidjeti funkciju iz primarne aminokiselinske sekvence člana porodice eIF4E. Raznolikost članova porodice eIF4E pruža izvor alternativa o strukturnoj temi eIF4E koje će koristiti analizama strukture/funkcije i dizajnu terapijskog lijeka. ^[6]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 242 aminokiseline, а molekulska težina 27.596 Da.^[7]

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MLAVEVSEAE	GGIREWEEEE	KEEEAAERTP	TGEKSPNSPR	TLLSLRGKAR
TGGPMEVKLE	LHPLQNRWAL	WFFKNDRSRA	WQDNLHLVTK	VDTVEDFWAL
YSHIQLASKL	SSGCDYALFK	DGIQPMWEDS	RNKRGGRWLV	SLAKQQRHIE
LDRLWLETLL	CLIGESFEEH	SREVCGAVVN	IRTKGDKIAV	WTREAENQAG
VLHVGRVYKE	RLGLSPKTII	GYQAHADTAT	KSNSLAKNKF	VV

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000175766 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000074895 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: Eukaryotic translation initiation factor 4E family member 1B". Pristupljeno 1. 1. 2013.
^ Bhavesh Joshi, Kibwe Lee, Dennis L Maeder, Rosemary Jagus (2005): Phylogenetic analysis of eIF4E-family members. BMC Evol Biol, 28 (5):48; pmid: 16191198; pmcid: pmc1260017; doi: 10.1186/1471-2148-5-48
^ "UniProt, A6NMX2" (jezik: engleski). Pristupljeno 14. 10. 2021.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000175766 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000074895 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: Eukaryotic translation initiation factor 4E family member 1B". Pristupljeno 1. 1. 2013.

[6] Bhavesh Joshi, Kibwe Lee, Dennis L Maeder, Rosemary Jagus (2005): Phylogenetic analysis of eIF4E-family members. BMC Evol Biol, 28 (5):48; pmid: 16191198; pmcid: pmc1260017; doi: 10.1186/1471-2148-5-48

[UniProt-7] "UniProt, A6NMX2" (jezik: engleski). Pristupljeno 14. 10. 2021.

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

[6]

[7]