COMMD3-BMI1 je gen koji kod ljudi kodira čitanje proteina COMMD3-BMI1.[5]

COMMD3-BMI1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2H0D, 3RPG, 4R8P

Identifikatori
AliasiCOMMD3-BMI1
Vanjski ID-jeviMGI: 88174 HomoloGene: 3797 GeneCards: COMMD3-BMI1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 10 (čovjek)
Hrom.Hromosom 10 (čovjek)[1]
Hromosom 10 (čovjek)
Genomska lokacija za COMMD3-BMI1
Genomska lokacija za COMMD3-BMI1
Bend10p12.2Početak22,316,388 bp[1]
Kraj22,329,542 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za COMMD3-BMI1
Genomska lokacija za COMMD3-BMI1
Bend2 A3|2 12.9 cMPočetak18,681,829 bp[2]
Kraj18,691,440 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija promoter-specific chromatin binding
RING-like zinc finger domain binding
vezivanje iona metala
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje iona cinka
Ćelijska komponenta citoplazma
kompleks ubikvitin-ligaze
nukleoplazma
PRC1 complex
PcG protein complex
jedro
citosol
nuclear body
Biološki proces GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of fibroblast proliferation
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
segment specification
negative regulation of gene expression, epigenetic
positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity
Regulacija ekspresije gena
histone H2A-K119 monoubiquitination
negative regulation of G0 to G1 transition
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Hematopoeza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001204062

NM_007552

RefSeq (bjelančevina)

NP_001190991
NP_005171

NP_031578

Lokacija (UCSC)Chr 10: 22.32 – 22.33 MbChr 2: 18.68 – 18.69 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 326 aminokiselina, а molekulska težina 36.949[6]

1020304050
MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETS
KYCPICDVQVHKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAA
HPSADAANGSNEDRGEVADEDKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKD
KEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHLRKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPL
KDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQRDGLTNAGELE
SDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQSPHPQFPHISSTMNGTSNSP
SGNHQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG

Funkcija

uredi

Ovaj lokus predstavlja prirodno čitanje transkripcija između susjednih COMM-domena koji sadrži protein 3 i kompleksa polinomnih proteina BMI-1 gena na hromosomu 10. Pročitani transkript proizvodi fuzijski protein koji dijeli identitet sekvence sa svakim pojedinačnim genskim proizvodom.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000269897 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026739 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: COMMD3-BMI1 readthrough". Pristupljeno 5. 10. 2013.
  6. ^ "UniProt, P35226". Pristupljeno 31. 8. 2021.
  7. ^ prema RefSeq, februar 2011.