CCDC151
Protein 151 domena sa upredenom zavojnicom je protein koji je kod ljudi kodiran genom CCDC151.[5]
| CCDC151 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | ODAD3 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 615956 MGI: 1924859 HomoloGene: 16533 GeneCards: ODAD3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 19: 11.42 – 11.44 Mb | Chr 9: 21.9 – 21.91 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
CCDC151 je upredeni aksonemni protein koji osigurava ispravno vezanje spoljašnjih kompleksa dineinskih krakova na mikrotubule, što je potrebno za pravilno ritmiranje cilija
Kloniranje i ekspresija uredi
Pretragom baza podataka za sekvence slične onima u rodu Drosophila Ccdc151, identificiran je mišji i ljudski CCDC151. Ljudski CCDC151 kodira izvedeni protein od 595 aminokiselina sa tri domena sa zavojnicom. U mišjim IMCD3 ćelijama, Ccdc151 je obogaćen na poliovma vretena tokom ćelijske diobe i na baznim tijelima i nepokretnim cilijama nakon diferencijacije. Zebrafish ccdc151 također je lokaliziran na pokretne cilije i bazna tijela.
Pokazano je da se proizvod gena CCDC151 lokalizira na cilijskim aksonemama u ljudskim nosnim respiratornim epitelnim ćelijama. Koristeći analizu reportera, pokazano je da je Ccdc151 eksprimiran u ependimnim ćelijama ventrikulskog sistema u mozgu miša. U mišjim sjemenicima, Ccdc151 je imao snažnu ekspresiju u sjemenskim cjevčicama.
Molekulska genetika uredi
U pet pacijenata iz tri nepovezane porodice s primarnom cilijskom diskinezijom-30 (CILD30), identificirane su dvije različite homozigotne mutacije u genu CCDC151 (E309X) i S419X. Mutacije su pronađene kombiniranim visokopropusnim mapiranjem i sekvenciranjem, kao i analizom veza u jednoj srodničkoj porodici. U ovim porodicama posmatrano je od više od 280 ispitanih CILD osoba, što sugerira da su mutacije CCDC151 rijedak uzrok poremećaja. Pacijentske respiratorne epitelne ćelije pokazale su gubitak proteina CCDC151 i imale su potpuno nepokretne cilije. u usporedbi s kontrolama, u skladu s gubitkom funkcije.
Aksoneme respiratornih cilija imale su nedostatak DNAH5, što ukazuje na gubitak vanjskih krakova dineina, ali normalnu ekspresiju i lokalizacija DNALI1, što ukazuje na to da unutrašnji sklop dinineinskog kraka nije pogođen. CCDC114 i ARMC4 nisu se mogli otkriti u respiratornim epitelnim ćelijamama pacijenata, što sugerira da, za pravilnu aksonemalnu lokalizaciju, ovise o CCDC151. Studije na ćelijama HEK293 i kvascu pokazale su uzajamnu interakciju između divljeg tipa CCDC151 i CCDC114. Nalazi sugeriraju ulogu CCDC151 u sastavljanju vanjskih dineinskih krakova, kao i spajanju vanjskih dineinskih krakova u aksoneme.
Kod dječaka, rođenom u vezi srodnih arapskih roditelja, sa CILD30, identificirana je mutacija E309X u genu CCDC151. Mutacija je pronađena sekvenciranjem cijelog egzomea i odvojena od poremećaja u porodici.
Aminokiselinska sekvenca uredi
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MTSPLCRAAS | ANALPPQDQA | STPSSRVKGR | EASGKPSHLR | GKGTAQAWTP | ||||
| GRSKGGSFHR | GAGKPSVHSQ | VAELHKKIQL | LEGDRKAFFE | SSQWNIKKNQ | ||||
| ETISQLRKET | KALELKLLDL | LKGDEKVVQA | VIREWKWEKP | YLKNRTGQAL | ||||
| EHLDHRLREK | VKQQNALRHQ | VVLRQRRLEE | LQLQHSLRLL | EMAEAQNRHT | ||||
| EVAKTMRNLE | NRLEKAQMKA | QEAEHITSVY | LQLKAYLMDE | SLNLENRLDS | ||||
| MEAEVVRTKH | ELEALHVVNQ | EALNARDIAK | NQLQYLEETL | VRERKKRERY | ||||
| ISECKKRAEE | KKLENERMER | KTHREHLLLQ | SDDTIQDSLH | AKEEELRQRW | ||||
| SMYQMEVIFG | KVKDATGTDE | THSLVRRFLA | QGDTFAQLET | LKSENEQTLV | ||||
| RLKQEKQQLQ | RELEDLKYSG | EATLVSQQKL | QAEAQERLKK | EERRHAEAKD | ||||
| QLERALRAMQ | VAKDSLEHLA | SKLIHITVED | GRFAGKELDP | QADNYVPNLL | ||||
| GLVEEKLLKL | QAQLQGHDVQ | EMLCHIANRE | FLASLEGRLP | EYNTRIALPL | ||||
| ATSKDKFFDE | ESEEEDNEVV | TRASLKIRSQ | KLIESHKKHR | RSRRS |
- Simboli
Klinički značaj uredi
Mutacije u CCDC151 povezane su s primarnom diskinezijom cilija.[6]
Reference uredi
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198003 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039632 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Coiled-coil domain containing 151".
- ^ Alsaadi MM, Erzurumluoglu AM, Rodriguez S, Guthrie PA, Gaunt TR, Omar HZ, Mubarak M, Alharbi KK, Al-Rikabi AC, Day IN (decembar 2014). "Nonsense mutation in coiled-coil domain containing 151 gene (CCDC151) causes primary ciliary dyskinesia". Human Mutation. 35 (12): 1446–8. doi:10.1002/humu.22698. PMC 4489323. PMID 25224326.
Dopunska literatura uredi
- Jerber J, Baas D, Soulavie F, Chhin B, Cortier E, Vesque C, Thomas J, Durand B (februar 2014). "The coiled-coil domain containing protein CCDC151 is required for the function of IFT-dependent motile cilia in animals". Human Molecular Genetics. 23 (3): 563–77. doi:10.1093/hmg/ddt445. PMID 24067530.
Vanjski linkovi uredi
- Lokacija ljudskog genoma CCDC151 i stranica sa detaljima o genu CCDC151 u UCSC Genome Browseru.