AT-bogati protein 4B sa interaktivnim domenom jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ARID4B sa hromosoma 1.[5][6]

ARID4B
Identifikatori
AliasiARID4B
Vanjski ID-jeviOMIM: 609696 MGI: 2137512 HomoloGene: 12847 GeneCards: ARID4B
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za ARID4B
Genomska lokacija za ARID4B
Bend1q42.3Početak235,131,634 bp[1]
Kraj235,328,219 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za ARID4B
Genomska lokacija za ARID4B
Bend13 A1|13 5.29 cMPočetak14,237,817 bp[2]
Kraj14,374,188 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
histone deacetylase activity
molekularna funkcija
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta citoplazma
nukleoplazma
jedro
ćelijska komponenta
Biološki proces regulation of gene expression by genetic imprinting
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
establishment of Sertoli cell barrier
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
histone H4-K20 trimethylation
transcription, DNA-templated
histone H3-K9 trimethylation
Spermatogeneza
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
histone deacetylation
GO:0022610 biološki proces
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001206794
NM_016374
NM_031371

NM_194262
NM_198122

RefSeq (bjelančevina)

NP_001193723
NP_057458
NP_112739

NP_919238
NP_937755

Lokacija (UCSC)Chr 1: 235.13 – 235.33 MbChr 13: 14.24 – 14.37 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.312 aminokiselina, a molekulska 147.809 težina Da.[7]

1020304050
MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVE
VQDDHIKGPLKVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKT
LRRSSLCLKGERHFAESETLDQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIP
EEESSSSSSDEDEDDRKQIDELLGKVVCVDYISLDKKKALWFPALVVCPD
CSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVHEITSDTAPKPDAVLKQAFE
QALEFHKSRTIPANWKTELKEDSSSSEAEEEEEEEDDEKEKEDNSSEEEE
EIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKL
GGFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSA
NIEFQMALPEKVVNKQCKECENVKEIKVKEENETEIKEIKMEEERNIIPR
EEKPIEDEIERKENIKPSLGSKKNLLESIPTHSDQEKEVNIKKPEDNENL
DDKDDDTTRVDESLNIKVEAEEEKAKSGDETNKEEDEDDEEAEEEEEEEE
EEEDEDDDDNNEEEEFECYPPGMKVQVRYGRGKNQKMYEASIKDSDVEGG
EVLYLVHYCGWNVRYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNKLDKEKD
KDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNPSPEMVSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEI
TSILNGLQASESSAEDSEQEDERGAQDMDNNGKEESKIDHLTNNRNDLIS
KEEQNSSSLLEENKVHADLVISKPVSKSPERLRKDIEVLSEDTDYEEDEV
TKKRKDVKKDTTDKSSKPQIKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEEKAKNKE
SLCMENSSNSSSDEDEEETKAKMTPTKKYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSE
VAEKRIKLLNNSDERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQWPKKTLKELFSDSDTE
AAASPPHPAPEEGVAEESLQTVAEEESCSPSVELEKPPPVNVDSKPIEEK
TVEVNDRKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPESPSSVTVTEGSRQQSSVTVSEP
LAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSPAGFDASVSSSS
SNQPEPEHPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNNKKKGKGT
NSSDSEELSAGESITKSQPVKSVSTGMKSHSTKSPARTQSPGKCGKNGDK
DPDLKEPSNRLPKVYKWSFQMSDLENMTSAERITILQEKLQEIRKHYLSL
KSEVASIDRRRKRLKKKERESAATSSSSSSPSSSSITAAVMLTLAEPSMS
SASQNGMSVECR

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira protein sa sekvencom sličnosti sa retinoblastom-vezujućim proteinom-1. Kodirani protein je podjedinica histon-deacetilaza-ovisnog SIN3A transkripcijskog korepresorskog kompleksa, koji funkcioniše u različitim ćelijskim procesima, uključujući proliferaciju ćelija, diferencijaciju, apoptozu, onkogenezu i određivanje ćelijske sudbine Genski proizvod prepoznaje antitijelo IgG izolirano od raka dojke pacijenta i čini se da je molekulski marker povezan sa širokim spektrom ljudskih maligniteta. Karakterizirane su alternativne transkripcijske prerađene varijante koje kodiraju različite izoforme.[6]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000054267 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039219 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Cao J, Gao T, Stanbridge EJ, Irie R (Aug 2001). "RBP1L1, a retinoblastoma-binding protein-related gene encoding an antigenic epitope abundantly expressed in human carcinomas and normal testis". J Natl Cancer Inst. 93 (15): 1159–65. doi:10.1093/jnci/93.15.1159. PMID 11481388.
  6. ^ a b "Entrez Gene: ARID4B AT rich interactive domain 4B (RBP1-like)".
  7. ^ "UniProt, Q4LE39" (jezik: en.). Pristupljeno 7. 12. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi