Upalni alotransplantni faktor 1 ili upalni alograftni faktor 1 ili upalni alokalemski faktor 1, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom AIF1L.[5][6]

AIF1L
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2JJZ, 2VTG

Identifikatori
AliasiAIF1L
Vanjski ID-jeviMGI: 1919598 HomoloGene: 12863 GeneCards: AIF1L
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za AIF1L
Genomska lokacija za AIF1L
Bend9q34.12-q34.13Početak131,096,476 bp[1]
Kraj131,123,152 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za AIF1L
Genomska lokacija za AIF1L
Bend2|2 BPočetak31,840,151 bp[2]
Kraj31,863,454 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija calcium ion binding
actin filament binding
actin binding
vezivanje iona metala
Ćelijska komponenta citoplazma
actin cytoskeleton
ruffle membrane
ćelijska membrana
projekcija ćelije
Egzosom
citoskelet
membrana
focal adhesion
Mikronit
GO:0009327 makromolekulani kompleks
Biološki proces actin filament bundle assembly
ruffle assembly
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001002260
NM_001185095
NM_001185096
NM_031426

NM_145144

RefSeq (bjelančevina)

NP_001172024
NP_001172025
NP_113614

NP_660126

Lokacija (UCSC)Chr 9: 131.1 – 131.12 MbChr 2: 31.84 – 31.86 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 150 aminokiselina, а molekulska težina 17.068 Da.[7]

1020304050
MSGELSNRFQGGKAFGLLKARQERRLAEINREFLCDQKYSDEENLPEKLT
AFKEKYMEFDLNNEGEIDLMSLKRMMEKLGVPKTHLEMKKMISEVTGGVS
DTISYRDFVNMMLGKRSAVLKLVMMFEGKANESSPKPVGPPPERDIASLP

Funkcija

uredi

AIF1L je protein koji veže aktin i promovira povezivanje aktina. Ne može vezati kalcij niti ovisiti o njegovoj funkciji.[8] Ima pristrasnu ekspresiju u bubrezima (RPKM 130.1), slezeni (RPKM 121.3) i osam drugih tkiva.[9]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000126878 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001864 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B, Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs". Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
  6. ^ "Entrez Gene: C9orf58 chromosome 9 open reading frame 58".
  7. ^ "UniProt, Q9BQI0". Pristupljeno 5. 9. 2021.
  8. ^ "Aif1l - Allograft inflammatory factor 1-like - Mus musculus (Mouse) - Aif1l gene & protein". www.uniprot.org (jezik: engleski). Pristupljeno 3. 12. 2017.
  9. ^ "AIF1L allograft inflammatory factor 1 like [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 3. 12. 2017.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi