ZNF426

Protein 426 cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZNF426.

ZNF426
Identifikatori
Aliasi	ZNF426
Vanjski ID-jevi	MGI: 1920248 HomoloGene: 23435 GeneCards: ZNF426
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 19 (čovjek) Bend 19p13.2 Početak 9,523,223 bp Kraj 9,538,645 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 9 (miš) Bend 9 A3|9 7.55 cM Početak 20,379,845 bp Kraj 20,404,042 bp
Ontologija gena Molekularna funkcija • vezivanje sa DNK • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • vezivanje iona metala • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Ćelijska komponenta • intracellular anatomical structure • jedro Biološki proces • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	79088	235028
Ensembl	ENSG00000130818	ENSMUSG00000059475
UniProt	Q9BUY5	Q8R1D1
RefSeq (mRNK)	NM_001300883 NM_024106 NM_001318055 NM_001318056	NM_001110309 NM_146221 NM_001310742
RefSeq (bjelančevina)	NP_001287812 NP_001304984 NP_001304985 NP_077011	NP_001103779 NP_001297671 NP_666333
Lokacija (UCSC)	Chr 19: 9.52 – 9.54 Mb	Chr 9: 20.38 – 20.4 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MAAADLSHGH		YLSGDPVCLH		EEKTPAGRIV		ADCLTDCYQD		SVTFDDVAVD
FTQEEWTLLD		STQRSLYSDV		MLENYKNLAT		VGGQIIKPSL		ISWLEQEESR
TVQGGVLQGW		EMRLETQWSI		LQQDFLRGQT		SIGIQLEGKH		NGRELCDCEQ
CGEVFSEHSC		LKTHVRTQST		GNTHDCNQYG		KDFLTLCEKT		STGEKLSEFN
QSEKIFSLTP		NIVYQRTSTQ		EKSFECSHCG		KSFINESYLQ		AHMRTHNGEK
LYEWRNYGPG		FIDSTSLSVL		IETLNAKKPY		KCKECGKGYR		YPAYLSIHMR
THTGEKPYEC		KECGKAFNYS		NSFQIHGRTH		TGEKPYVCKE		CGKAFTQYSG
LSMHVRSHSG		DKPYECKECG		KSFLTSSRLI		QHIRTHTGEK		PFVCVECGKA
FAVSSNLSGH		LRTHTEEKAC		ECKICGKVFG		YPSCLNNHMR		THSAQKPYTC
KECGKAFNYS		THLKIHMRIH		TGEKPYECKQ		CGKAFSHSSS		FQIHERTHTG
EKPYECKECG		KAFTCSSSFR		IHEKTHTEEK		PYKCQQCGKA		YSHPRSLRRH
EQIH

Funkcije

Kaposi sarkom-asocirani herpesvirus (KSHV) može se iz latencije reaktivirati virusnim proteinom RTA. Protein kojeg kodira ovaj gen je transkripcijski represor cinkovog prsta koji u interakciji s RTA modulira reaktivaciju KSHV-a posredovanu RTA-om. Iako kodirani protein može potisnuti reaktivaciju KSHV, RTA može inducirati degradaciju ovog proteina putem puta ubikvitin-proteasoma, kako bi se prevladala represija. Za ovaj gen pronađeno je nekoliko varijanti transkripta koji kodiraju različite izoforme.

Interakcije

Pokazalo se da proteini cinkovog prsta ulaze u interakciju s nukleinskim kiselinama i imaju različite funkcije. Domen cinkovog prsta je konzervirani motiv aminokiselinske sekvence koji sadrži po dva posebno postavljena cisteina i histidina, koji su uključeni u koordinaciju cinka. Proteini povezani sa Kruppelom čine jednu porodicu proteina cinkovih prstiju. Pogledajte ZFP93 (MIM 604749) za dodatne informacije o proteinima cinkovih prstiju, prema OMIM-u.