Protein 426 cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZNF426.[5]

ZNF426
Identifikatori
AliasiZNF426
Vanjski ID-jeviMGI: 1920248 HomoloGene: 23435 GeneCards: ZNF426
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za ZNF426
Genomska lokacija za ZNF426
Bend19p13.2Početak9,523,223 bp[1]
Kraj9,538,645 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za ZNF426
Genomska lokacija za ZNF426
Bend9 A3|9 7.55 cMPočetak20,379,845 bp[2]
Kraj20,404,042 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
metal ion binding
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta intracellular anatomical structure
Jedro
Biološki proces GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001300883
NM_024106
NM_001318055
NM_001318056

NM_001110309
NM_146221
NM_001310742

RefSeq (bjelančevina)

NP_001287812
NP_001304984
NP_001304985
NP_077011

NP_001103779
NP_001297671
NP_666333

Lokacija (UCSC)Chr 19: 9.52 – 9.54 MbChr 9: 20.38 – 20.4 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš
Aminokiselinska sekvenca
Simboli
1020304050
MAAADLSHGHYLSGDPVCLHEEKTPAGRIVADCLTDCYQDSVTFDDVAVD
FTQEEWTLLDSTQRSLYSDVMLENYKNLATVGGQIIKPSLISWLEQEESR
TVQGGVLQGWEMRLETQWSILQQDFLRGQTSIGIQLEGKHNGRELCDCEQ
CGEVFSEHSCLKTHVRTQSTGNTHDCNQYGKDFLTLCEKTSTGEKLSEFN
QSEKIFSLTPNIVYQRTSTQEKSFECSHCGKSFINESYLQAHMRTHNGEK
LYEWRNYGPGFIDSTSLSVLIETLNAKKPYKCKECGKGYRYPAYLSIHMR
THTGEKPYECKECGKAFNYSNSFQIHGRTHTGEKPYVCKECGKAFTQYSG
LSMHVRSHSGDKPYECKECGKSFLTSSRLIQHIRTHTGEKPFVCVECGKA
FAVSSNLSGHLRTHTEEKACECKICGKVFGYPSCLNNHMRTHSAQKPYTC
KECGKAFNYSTHLKIHMRIHTGEKPYECKQCGKAFSHSSSFQIHERTHTG
EKPYECKECGKAFTCSSSFRIHEKTHTEEKPYKCQQCGKAYSHPRSLRRH
EQIH

Funkcije uredi

Kaposi sarkom-asocirani herpesvirus (KSHV) može se iz latencije reaktivirati virusnim proteinom RTA. Protein kojeg kodira ovaj gen je transkripcijski represor cinkovog prsta koji u interakciji s RTA modulira reaktivaciju KSHV-a posredovanu RTA-om. Iako kodirani protein može potisnuti reaktivaciju KSHV, RTA može inducirati degradaciju ovog proteina putem puta ubikvitin-proteasoma, kako bi se prevladala represija. Za ovaj gen pronađeno je nekoliko varijanti transkripta koji kodiraju različite izoforme.

Interakcije uredi

Pokazalo se da proteini cinkovog prsta ulaze u interakciju s nukleinskim kiselinama i imaju različite funkcije. Domen cinkovog prsta je konzervirani motiv aminokiselinske sekvence koji sadrži po dva posebno postavljena cisteina i histidina, koji su uključeni u koordinaciju cinka. Proteini povezani sa Kruppelom čine jednu porodicu proteina cinkovih prstiju. Pogledajte ZFP93 (MIM 604749) za dodatne informacije o proteinima cinkovih prstiju, prema OMIM-u.[5]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000130818 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059475 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: Zinc finger protein 426". Pristupljeno 28. 1. 2016.

Vanjski linkovi uredi