Wikipedia

ZNF398

Protein cinkovog prsta 398 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ZNF398.[5]

ZNF398
Identifikatori
AliasiZNF398
Vanjski ID-jeviMGI: 1917856 HomoloGene: 12358 GeneCards: ZNF398
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za ZNF398
Genomska lokacija za ZNF398
Bend7q36.1Početak149,126,416 bp[1]
Kraj149,183,042 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za ZNF398
Genomska lokacija za ZNF398
Bend6|6 B2.3Početak47,812,595 bp[2]
Kraj47,850,471 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija• vezivanje sa DNK
• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
• vezivanje iona metala
• nucleic acid binding
• GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta• intracellular anatomical structure
• jedro
Biološki proces• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• transcription, DNA-templated
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

57541

272347

Ensembl

ENSG00000197024

ENSMUSG00000062519

UniProt

Q8TD17

n/a

RefSeq (mRNK)

NM_020781
NM_170686

NM_027477
NM_173034

RefSeq (bjelančevina)

NP_065832
NP_733787

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 7: 149.13 – 149.18 MbChr 6: 47.81 – 47.85 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 642 aminokiseline, а molekulska težina 71.311 Da.[6]

1020304050
MAEAAPAPTSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAV
QAIERKVEIHSRRLLHLEGRTGTAEKKLASCEKTVTELGNQLEGKWAVLG
TLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSI
YFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLISMDYAINQPDVLSQIQPEGE
HNTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQVGAPPESKES
DVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKS
QQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGK
NLSQDMLLTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASETPPTC
PHCARTFTHPSRLTYHLRVHNSTERPFPCPDCPKRFADQARLTSHRRAHA
SERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSALIR
HQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFIR
KHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDP
SGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira člana porodice Kruppel proteina C2H2-tipa trankripcijskog faktora cinkovog prsta. Kodirani protein djeluje kao transkripcijski aktivator. Za ovaj gen su identificirane dvije varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme. Opisane su i druge varijante transkripta, ali njihova puna sekvenca nije utvrđena.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197024 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062519 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Zinc finger protein 398". Pristupljeno 29. 2. 2016.
  6. ^ "UniProt, Q8TD17" (jezik: engleski). Pristupljeno 29. 9. 2021.

Dopunska literatura

uredi
Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=ZNF398&oldid=3511381"