Protein 208 cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZNF208.[5]

ZNF208
Identifikatori
AliasiZNF208
Vanjski ID-jeviOMIM: 603977 MGI: 1917477 HomoloGene: 133818 GeneCards: ZNF208
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za ZNF208
Genomska lokacija za ZNF208
Bend19p12Početak21,932,958 bp[1]
Kraj22,010,949 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za ZNF208
Genomska lokacija za ZNF208
Bend7|7 B3Početak39,167,190 bp[2]
Kraj39,189,844 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
vezivanje iona cinka
vezivanje iona metala
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta intracellular anatomical structure
jedro
Biološki proces GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001329971
NM_001329972
NM_001329973
NM_001329974
NM_007153

NM_001004139

RefSeq (bjelančevina)

NP_001316900
NP_001316901
NP_001316902
NP_001316903
NP_009084

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 19: 21.93 – 22.01 MbChr 7: 39.17 – 39.19 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Funkcija

uredi

Proteini cinkovog prsta (ZNF-ovi), kao što je ZNF208, vežu DNK i tako reguliraju transkripciju. Većina ZNF-ova sadrže konzervirane motive C2H2 i klasificirani su kao cinkovi prsti tipa Kruppel. Konzervirani motiv proteina, nazvan Kruppel-pridruženi boks domen (KRAB), posreduje interakcije protein-protein (Eichler et al., 1998 PubMed 9724325]). Pogledajte ZNF91 (MIM 603971) za daljnje informacije o ZNF-ima.

Aminokiselinski sastav

uredi
Simboli
1020304050
MGSLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAAFKP
DLIIFLEEGKESWNMKRHEMVEESPVICSHFAQDLWPEQGIEDSFQKVIL
RRYEKCGHENLHLKIGYTNVDECKVHKEGYNKLNQSLTTTQSKVFQRGKY
ANVFHKCSNSNRHKIRHTGKKHLQCKEYVRSFCMLSHLSQHKRIYTRENS
YKCEEGGKAFNWSSTLTYYKSAHTGEKPYRCKECGKAFSKFSILTKHKVI
HTGEKSYKCEECGKAFNQSAILTKHKIIHTGEKPNKCEECGKAFSKVSTL
TTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKVSTLITHKAIHAGEKPYKCKECGKAF
SKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCE
ECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGE
TPYKCEECGKGFSMFSILTKHKVIHNGEKPYKCEECDKATHAGEKPYKCE
ECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGE
KPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNQSAILIKHK
RIHTGEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKTFIKVS
TLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGK
AFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSVLTKHKVIHTGEKPYK
CEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKHKRIHT
DEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTK
HKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSM
FSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKTHAGEKFYKCEAC
GKAYKSSSTLSYHKKIHTEEKPYKYEECGKGFSTFSILTKHKVIHTGEKP
YKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECDKAFSWPSSLTEHKAT
HAGEKPYKCEECGKAFSWPSRLTEHKATHAGEEPYKCEECGKAFNWSSNL
MEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAY
KWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKCE
ECGKAYKWPSTLRYHKKIHTGEKPYKCEECGKAFSTFSILTKHKVIHTGE
KPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKIHTGEKL

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160321 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000068959 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Zinc finger protein 208". Pristupljeno 28. 1. 2016.

Vanjski linkovi

uredi