Protein 180 cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZNF180.[5]

ZNF180
Identifikatori
AliasiZNF180
Vanjski ID-jeviOMIM: 606740 MGI: 1923701 HomoloGene: 8306 GeneCards: ZNF180
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za ZNF180
Genomska lokacija za ZNF180
Bend19q13.31Početak44,474,428 bp[1]
Kraj44,500,524 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za ZNF180
Genomska lokacija za ZNF180
Bend7|7 A3Početak23,781,349 bp[2]
Kraj23,807,138 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje iona metala
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta intracellular anatomical structure
jedro
Biološki proces GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001278508
NM_001278509
NM_001288759
NM_001288760
NM_001288761

NM_001288762
NM_001291633
NM_013256

NM_001045486
NM_001289634
NM_001289637
NM_001289640
NM_001289641

NM_172483

RefSeq (bjelančevina)
NP_001265437
NP_001265438
NP_001275688
NP_001275689
NP_001275690

NP_001275691
NP_001278562
NP_037388

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 19: 44.47 – 44.5 MbChr 7: 23.78 – 23.81 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinski sastav

uredi
Simboli
1020304050
MRACAGSTREAGSGAQDLSTLLCLEESMEEQDEKPPEPPKACAQDSFLPQ
EIIIKVEGEDTGSLTIPSQEGVNFKIVTVDFTREEQGTWNPAQRTLDRDV
ILENHRDLVSWDLATAVGKKDSTSKQRIFDEEPANGVKIERFTRDDPWLS
SCEEVDDCKDQLEKQQEKQEILLQEVAFTQRKAVIHERVCKSDETGEKSG
LNSSLFSSPVIPIRNHFHKHVSHAKKWHLNAAVNSHQKINENETLYENNE
CGKPPQSIHLIQFTRTQTKDKCYGFSDRIQSFCHGTPLHIHEKIHGGGKT
FDFKECGQVLNPKISHNEQQRIPFEESQYKCSETSHSSSLTQNMRNNSEE
KPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVSHQ
RTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSY
KLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGK
SFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYE
CSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHT
GEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIV
HQRTHTGEKPFTCIQCGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN

Funkcija

uredi

Pokazalo se da proteini cinkovog prsta ulaze u interakciju sa nukleinskim kiselinama i da imaju različite funkcije. Domen cinkov prst je konzervirani aminokiselinski motiv sekvence, koji sadrži dva posebno postavljene cisteine i dva histidina, uključena u koordinaciju cinka. Proteini koji su povezani sa Kruppelom čine jednu porodicu proteina cinkovih prstiju. Pogledajte MIM 604749 za dodatne informacije o proteinima cinkovih prstiju.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000167384 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000057101 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Zinc finger protein 180". Pristupljeno 29. 1. 2016.

Vanjski linkovi

uredi