Cinkov prst i homeoboksni protein 3 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZHX3.[5][6]

ZHX3
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2DA5, 2DN0

Identifikatori
AliasiZHX3
Vanjski ID-jeviOMIM: 609598 MGI: 2444772 HomoloGene: 9000 GeneCards: ZHX3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za ZHX3
Genomska lokacija za ZHX3
Bend20q12Početak41,178,448 bp[1]
Kraj41,317,672 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za ZHX3
Genomska lokacija za ZHX3
Bend2|2 H2Početak160,590,628 bp[2]
Kraj160,714,918 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
vezivanje sa DNK
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
protein homodimerization activity
GO:0001106 transcription corepressor activity
vezivanje iona metala
protein heterodimerization activity
nucleic acid binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta jedro
nukleoplazma
Biološki proces Ćelijska diferencijacija
positive regulation of osteoblast differentiation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_015035

NM_177263

RefSeq (bjelančevina)

NP_055850

NP_796237

Lokacija (UCSC)Chr 20: 41.18 – 41.32 MbChr 2: 160.59 – 160.71 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira člana porodice cinkovih prstiju i homeoboksova (ZHX). Kodirani protein sadrži dva cinkova prsta tipa C2H2 i pet homeodomena i čini imer sa sobom ili sa članom porodice cinkovih prstiju i homeoboksova 1. U jedru, dimerizirani protein djeluje u interakciji s A podjedinicom sveprisutnog jedarnog faktora transkripcionog faktora-Y i može funkcionirati kao transkripcijski represor.[6]

Ontologija

uredi
Molekulska funkcija
  • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204
  • aktivnost transkripcijskog faktora koji veže DNK
  • vezanje DNK
  • GO: 0001948 vezanje za proteine
  • aktivnost homodimerizacije proteina
  • GO: 0001106 aktivnost transpresorskog korepresora
  • vezanje metalnih Iona
  • aktivnost heterodimerizacije proteina
  • vezanje nukleinske kiseline
  • vezanje DNK za regulatorno područje transkripcije RNK-polimeraze II specifično
  • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201
  • aktivnost transkripcionog faktora koji veže DNK, specifična za RNK-polimerazu II
Ćelijska komponenta
Biološki proces

Izvori: Amigo / QuickGO

Aminokiselinska sekvenca

uredi
Simboli
1020304050
MASKRKSTTPCMIPVKTVVLQDASMEAQPAETLPEGPQQDLPPEASAASS
EAAQNPSSTDGSTLANGHRSTLDGYLYSCKYCDFRSHDMTQFVGHMNSEH
TDFNKDPTFVCSGCSFLAKTPEGLSLHNATCHSGEASFVWNVAKPDNHVV
VEQSIPESTSTPDLAGEPSAEGADGQAEIIITKTPIMKIMKGKAEAKKIH
TLKENVPSQPVGEALPKLSTGEMEVREGDHSFINGAVPVSQASASSAKNP
HAANGPLIGTVPVLPAGIAQFLSLQQQPPVHAQHHVHQPLPTAKALPKVM
IPLSSIPTYNAAMDSNSFLKNSFHKFPYPTKAELCYLTVVTKYPEEQLKI
WFTAQRLKQGISWSPEEIEDARKKMFNTVIQSVPQPTITVLNTPLVASAG
NVQHLIQAALPGHVVGQPEGTGGGLLVTQPLMANGLQATSSPLPLTVTSV
PKQPGVAPINTVCSNTTSAVKVVNAAQSLLTACPSITSQAFLDASIYKNK
KSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKVTGLSTREVRKWFSDRRYHCR
NLKGSRAMIPGDHSSIIIDSVPEVSFSPSSKVPEVTCIPTTATLATHPSA
KRQSWHQTPDFTPTKYKERAPEQLRALESSFAQNPLPLDEELDRLRSETK
MTRREIDSWFSERRKKVNAEETKKAEENASQEEEEAAEDEGGEEDLASEL
RVSGENGSLEMPSSHILAERKVSPIKINLKNLRVTEANGRNEIPGLGACD
PEDDESNKLAEQLPGKVSCKKTAQQRHLLRQLFVQTQWPSNQDYDSIMAQ
TGLPRPEVVRWFGDSRYALKNGQLKWYEDYKRGNFPPGLLVIAPGNRELL
QDYYMTHKMLYEEDLQNLCDKTQMSSQQVKQWFAEKMGEETRAVADTGSE
DQGPGTGELTAVHKGMGDTYSEVSENSESWEPRVPEASSEPFDTSSPQAG
RQLETD

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174306 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000035877 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Ishikawa K, Nagase T, Nakajima D, Seki N, Ohira M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (Feb 1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. VIII. 78 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Res. 4 (5): 307–13. doi:10.1093/dnares/4.5.307. PMID 9455477.
  6. ^ a b "Entrez Gene: ZHX3 zinc fingers and homeoboxes 3".

Dopunska literatura

uredi