ZC3HAV1

ZC3HAV1
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	2X5Y, 4X52
Identifikatori
Aliasi	ZC3HAV1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 607312 MGI: 1926031 HomoloGene: 10585 GeneCards: ZC3HAV1
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 7 (čovjek)
Kraj	139,132,122 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 6 (miš)
Kraj	38,331,538 bp
Obrazac RNK ekspresije
	Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• vezivanje iona metala; • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • vezivanje sa RNK; • cadherin binding; • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity; • NAD+ binding; • protein ADP-ribosylase activity;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • jedro; • citosol;
Biološki proces	• positive regulation of interferon-alpha production; • immune system process; • response to virus; • positive regulation of mRNA catabolic process; • negative regulation of viral genome replication; • positive regulation of RIG-I signaling pathway; • defense response to virus; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • Urođeni imunski sistem; • positive regulation of interferon-beta production; • protein poly-ADP-ribosylation; • protein ADP-ribosylation;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	56829
	78781
	ENSG00000105939
	ENSMUSG00000029826
	Q7Z2W4
	Q3UPF5
	NM_020119; NM_024625; NM_001363491
	NM_028421; NM_028864; NM_001347122
	NP_064504; NP_078901; NP_001350420
	NP_001334051; NP_082697; NP_083140
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

WEE2-antisens RNK 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom WEE2-AS1.^[5]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 902 aminokiseline, а molekulska težina 101.431 Da.^[6]

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MADPEVCCFI	TKILCAHGGR	MALDALLQEI	ALSEPQLCEV	LQVAGPDRFV
VLETGGEAGI	TRSVVATTRA	RVCRRKYCQR	PCDNLHLCKL	NLLGRCNYSQ
SERNLCKYSH	EVLSEENFKV	LKNHELSGLN	KEELAVLLLQ	SDPFFMPEIC
KSYKGEGRQQ	ICNQQPPCSR	LHICDHFTRG	NCRFPNCLRS	HNLMDRKVLA
IMREHGLNPD	VVQNIQDICN	SKHMQKNPPG	PRAPSSHRRN	MAYRARSKSR
DRFFQGSQEF	LASASASAER	SCTPSPDQIS	HRASLEDAPV	DDLTRKFTYL
GSQDRARPPS	GSSKATDLGG	TSQAGTSQRF	LENGSQEDLL	HGNPGSTYLA
SNSTSAPNWK	SLTSWTNDQG	ARRKTVFSPT	LPAARSSLGS	LQTPEAVTTR
KGTGLLSSDY	RIINGKSGTQ	DIQPGPLFNN	NADGVATDIT	STRSLNYKST
SSGHREISSP	RIQDAGPASR	DVQATGRIAD	DADPRVALVN	DSLSDVTSTT
SSRVDDHDSE	EICLDHLCKG	CPLNGSCSKV	HFHLPYRWQM	LIGKTWTDFE
HMETIEKGYC	NPGIHLCSVG	SYTINFRVMS	CDSFPIRRLS	TPSSVTKPAN
SVFTTKWIWY	WKNESGTWIQ	YGEEKDKRKN	SNVDSSYLES	LYQSCPRGVV
PFQAGSRNYE	LSFQGMIQTN	IASKTQKDVI	RRPTFVPQWY	VQQMKRGPDH
QPAKTSSVSL	TATFRPQEDF	CFLSSKKYKL	SEIHHLHPEY	VRVSEHFKAS
MKNFKIEKIK	KIENSELLDK	FTWKKSQMKE	EGKLLFYATS	RAYVESICSN
NFDSFLHETH	ENKYGKGIYF	AKDAIYSHKN	CPYDAKNVVM	FVAQVLVGKF
TEGNITYTSP	PPQFDSCVDT	RSNPSVFVIF	QKDQVYPQYV	IEYTEDKACV
IS

Funkcija

U jednoj studiji iz 2020., konstatirano je da dugolančane nekodirajuće RNK (lncRNK) utiču na aterosklerozu, regulirajući fiziološke i patološke procese endotelnih ćelija. Međutim, uloga lncRNA WEE2 antisens RNK 1 (WEE2 AS1) u obliteranskoj arteriosklerozi (ASO) nije u potpunosti shvaćena. Ova je studija istraživala je funkciju lncRNK WEE2 AS1 u endotelnim ćelijama ljudskih krvnih sudova. Rezultati su pokazali da je lncRNK WEE2 AS1 značajno povišena u uzorcima tkiva plazme i arterija kod pacijenata sa ASO, u poređenju sa zdravim kontrolnim osobma. Nalazi fluorescentne hibridizacije in situ sugerirali su da je lncRNK WEE2 AS1 eksprimirana u citoplazmi i jedrima primarnih ljudskih endotelnih ćelija iz pupčane vene (HUVEC).

Rezultati testa za prebrojavanje ćelija 8, sugerirali su da je nokdauniranje lncRNA WEE2 AS1 značajno poboljšalo održivost HUVEC -a, dok je prekomjerna ekspresija lncRNK WEE2 AS1 inhibirala održivost HUVEC-a u usporedbi s negativnim kontrolnim skupinama. Nadalje, analiza ćelijskoog ciklusa protočnom citometrijom pokazala je da je nokdauniranje lncRNK WEE2 AS1 značajno smanjilo udio ćelija u G0/G1 fazi i značajno povećalo njihov udio u G2/M fazi u usporedbi s negativnom kontrolnom skupinom. Međutim, prekomjerna ekspresija lncRNK WEE2 AS1 nije imala značajan uticaj na distribuciju ćelijskog ciklusa u usporedbi s negativnom kontrolnom skupinom.

Rezultati Western blot-a pokazali su da je nokdaun lncRNK WEE2 AS1 značajno smanjio nivoe ekspresije fosforilirane ciklin-zavisne kinaze 1, WEE1 homologa 2 i mijelinskog transkripcijskog faktora 1, ali je povećao nivo ekspresije diobe 25B ćelijskog ciklusa u usporedbi s negativnom kontrolnom grupom. Prekomjerna ekspresija lncRNA WEE2 AS1 pokazala je suprotan učinak na ekspresiju proteina. Zajedno, ova studija sugerirala je da je lncRNK WEE2 AS1 značajno regulirana u ASO -u i da može poslužiti u regulaciji održivosti vaskularnih endotelnih ćelija.

Daljnje istraživanje lncRNK WEE2 AS1 moglo bi proširiti sadašnje razumijevanje molekulnog mehanizma u osnovi ASO-a i pomoći u identifikaciji specifičnih sondi i precizno ciljanih lijekova za dijagnostiku i liječenje ASO.^[7]

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105939 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029826 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: WEE2 antisense RNA 1". Pristupljeno 11. 12. 2016.
^ "UniProt, Q7Z2W4" (jezik: engleski). Pristupljeno 30. 9. 2021.
^ Baohong Jiang, Rui Wang, Zefei Lin, Jieyi Ma, Jin Cui, Mian Wang, Ruiming Liu, Weibin Wu, Chunxiang Zhang, Wen Li, Shenming Wang (2020): Antisense long non coding RNA WEE2 AS1 regulates human vascular endothelial cell viability via cell cycle G2/M transition in arteriosclerosis obliterans. Mol Med Rep, 22(6):5069-5082; pmid: 33174040; pmcid: pmc7646961; doi: 10.3892/mmr.2020.11625

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105939 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029826 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: WEE2 antisense RNA 1". Pristupljeno 11. 12. 2016.

[UniProt-6] "UniProt, Q7Z2W4" (jezik: engleski). Pristupljeno 30. 9. 2021.

[7] Baohong Jiang, Rui Wang, Zefei Lin, Jieyi Ma, Jin Cui, Mian Wang, Ruiming Liu, Weibin Wu, Chunxiang Zhang, Wen Li, Shenming Wang (2020): Antisense long non coding RNA WEE2 AS1 regulates human vascular endothelial cell viability via cell cycle G2/M transition in arteriosclerosis obliterans. Mol Med Rep, 22(6):5069-5082; pmid: 33174040; pmcid: pmc7646961; doi: 10.3892/mmr.2020.11625

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

[6]

[7]