UTF1

Transkripcijski faktor 1 nediferenciranih embrionskih ćelija je protein koji je kod ljudi kodiran genom UTF1. UTF1, prvi put prijavljen 1998., eksprimira se u pluripotentnim ćelijama uključujući embrionske matične ćelije i ćelije embrionskog karcinoma. Nakon diferencijacije, njegova ekspresija brzo se smanjuje. UTF1 protein je lokaliziran u ćelijskom jedru , gdje funkcionira za regulaciju pluripotentnog stanja hromatina i pufera iRNK, promoviranjem razgradnje iRNK.

UTF1
Identifikatori
Aliasi	UTF1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 604130 MGI: 1276125 HomoloGene: 48226 GeneCards: UTF1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 10 (čovjek) Bend 10q26.3 Početak 133,230,217 bp Kraj 133,231,558 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 7 (miš) Bend 7|7 F4 Početak 139,523,702 bp Kraj 139,525,025 bp
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001105 transcription coactivator activity • HMG box domain binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • jedro Biološki proces • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	8433	22286
Ensembl	ENSG00000171794	ENSMUSG00000047751
UniProt	Q5T230	Q6J1H4
RefSeq (mRNK)	NM_003577	NM_009482
RefSeq (bjelančevina)	NP_003568	NP_033508
Lokacija (UCSC)	Chr 10: 133.23 – 133.23 Mb	Chr 7: 139.52 – 139.53 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aberantna ekspresija UTF1 zabilježena je i u ćelijama raka grlića maternice, gdje UTF1 genski promotor gubi metilaciju i postaje abnormalno eksprimiran u usporedbi s normalnim ćelijama vrata maternice.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 341 aminokiselina, а molekulska težina 36.439 Da.

10		20		30		40		50
MLLRPRRPPP		LAPPAPPSPA		SPDPEPRTPG		DAPGTPPRRP		ASPSALGELG
LPVSPGSAQR		TPWSARETEL		LLGTLLQPAV		WRALLLDRRQ		ALPTYRRVSA
ALAQQQVRRT		PAQCRRRYKF		LKDKFREAHG		QPPGPFDEQI		RKLMGLLGDN
GRKRPRRRSP		GSGRPQRARR		PVPNAHAPAP		SEPDATPLPT		ARDRDADPTW
TLRFSPSPPK		SADASPAPGS		PPAPAPTALA		TCIPEDRAPV		RGPGSPPPPP
AREDPDSPPG		RPEDCAPPPA		APPSLNTALL		QTLGHLGDIA		NILGPLRDQL
LTLNQHVEQL		RGAFDQTVSL		AVGFILGSAA		AERGVLRDPC		Q

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin