TNF-alfa inducirani protein 8 sličan proteinu 2 (TNFAIP8L2 ili TIPE2) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TNFAIP8L2 sa hromosoma 1. Eksprimiran je prvenstveno u tipovima ljudskih mijeloidnih ćelija i služi kao regulator imunskee kontrolne tačke upala i metabolizma.[5]

TNFAIP8L2
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3F4M

Identifikatori
AliasiTNFAIP8L2
Vanjski ID-jeviOMIM: 612112 MGI: 1917019 HomoloGene: 56998 GeneCards: TNFAIP8L2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za TNFAIP8L2
Genomska lokacija za TNFAIP8L2
Bend1q21.3Početak151,156,649 bp[1]
Kraj151,159,749 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 3 (miš)
Hrom.Hromosom 3 (miš)[2]
Hromosom 3 (miš)
Genomska lokacija za TNFAIP8L2
Genomska lokacija za TNFAIP8L2
Bend3|3 F2.1Početak95,046,832 bp[2]
Kraj95,049,671 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoplazma
Biološki proces Urođeni imunski sistem
negative regulation of T cell activation
negative regulation of inflammatory response
immune system process
regulation of apoptotic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_024575

NM_027206

RefSeq (bjelančevina)

NP_078851

NP_081482

Lokacija (UCSC)Chr 1: 151.16 – 151.16 MbChr 3: 95.05 – 95.05 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 184 aminokiseline, a molekulska težina 20.556 Da.[6]

1020304050
MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYT
HSRPQAQRVIKDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQKLRQGAMT
ALSFGEVDFTFEAAVLAGLLTECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHF
SDPGLLTALYGPDFTQHLGKICDGLRKLLDEGKL

Struktura

uredi

Kristalna struktura TIPE2 otkriva da sadrži veliku, hidrofobnu centralnu šupljinu koja je spremna za vezivanje kofaktora.[7]

Funkcija

uredi

TNFAIP8L2 je član porodice TNFAIP8 (protein 8 izazvan faktorom nekroze tumora-α ili TIPE) koji funkcionišu kao transferni proteini za drugoglasničke lipide PIP2 i PIP3. Ostala tri člana porodice su TNFAIP8, TNFAIP8L1 i TNFAIP8L3.[8]

Klinički značaj

uredi

TIPE2 djeluje kao negativan regulator imunskog sistema.[5][9] Podreguliran je kod pacijenata sa infektivnim i autoimunskim bolestima, a djeluje i kao tumorski supresor kod nekoliko tipova raka.[10] Njegov nokaut dovodi do leukocitoze i sistemskih upalnih poremećaja kod miševa.[8][11]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163154 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000013707 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Li T, Wang W, et al. (maj 2018). "Genome-wide analysis reveals TNFAIP8L2 as an immune checkpoint regulator of inflammation and metabolism". Molecular Immunology. 99: 154–162. doi:10.1016/j.molimm.2018.05.007. PMC 5995464. PMID 29787979.
  6. ^ "UniProt, Q6P589" (jezik: engleski). Pristupljeno 19. 12. 2021.
  7. ^ Zhang X, Wang J, Fan C, Li H, Sun H, Gong S, Chen YH, Shi Y (januar 2009). "Crystal structure of TIPE2 provides insights into immune homeostasis". Nature Structural & Molecular Biology. 16 (1): 89–90. doi:10.1038/nsmb.1522. PMID 19079267. S2CID 11111978.
  8. ^ a b Goldsmith JR, Chen YH (juni 2017). "Regulation of inflammation and tumorigenesis by the TIPE family of phospholipid transfer proteins". Cellular & Molecular Immunology. 14 (6): 482–487. doi:10.1038/cmi.2017.4. PMC 5719143. PMID 28287114.
  9. ^ Sun H, Gong S, et al. (2008). "TIPE2, a negative regulator of innate and adaptive immunity that maintains immune homeostasis". Cell. 133 (3): 415–26. doi:10.1016/j.cell.2008.03.026. PMC 2398615. PMID 18455983.
  10. ^ Li Z, Jia W, Niu J, Zhang L (februar 2018). "Understanding the roles of negative immune regulator TIPE2 in different diseases and tumourigenesis". Histology and Histopathology. 33 (9): 919–928. doi:10.14670/HH-11-977. PMID 29480508.
  11. ^ Lou Y, Liu S (oktobar 2011). "The TIPE (TNFAIP8) family in inflammation, immunity, and cancer". Molecular Immunology. 49 (1–2): 4–7. doi:10.1016/j.molimm.2011.08.006. PMID 21924498.