THADA
Tiroidnom adenomu pridruženi protein jest protein koji je kod ljudi kodiran genom THADA sa hromosoma 2.[5]
Amiokiselininska sekvenca uredi
Dužina polipeptidnog lanca je 1.953 aminokiseline, a molekulska težina 219.607 Da.[6]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MGVKKKKEMQ | VAALTICHQD | LETLKSFADV | EGKNLASLLL | HCVQLTDGVS | ||||
| QIHYIKQIVP | LLEKADKNGM | CDPTIQSCLD | ILAGIYLSLS | LKNPLKKVLA | ||||
| SSLNSLPDFF | LPEAMHRFTS | RLQEELNTTD | LYSYRKVTDN | ISSCMENFNL | ||||
| GRASVNNLLK | NVLHFLQKSL | IEILEENRKC | AGNHIIQTQL | MNDLLVGIRV | ||||
| SMMLVQKVQD | FQGNLWKTSD | SPIWQNMCGL | LSIFTKVLSD | DDLLQTVQST | ||||
| SGLAIILFIK | TMFHPSEKIP | HLISSVLLRS | VDCTSVPEWF | MSSCRSLCCG | ||||
| DISQSAVLFL | CQGTLAMLDW | QNGSMGRSGE | ALLLDTAHVL | FTLSSQIKEP | ||||
| TLEMFLSRIL | ASWTNSAIQV | LESSSPSLTD | SLNGNSSIVG | RLLEYVYTHW | ||||
| EHPLDALRHQ | TKIMFKNLLQ | MHRLTVEGAD | FVPDPFFVEL | TESLLRLEWH | ||||
| IKGKYTCLGC | LVECIGVEHI | LAIDKTIPSQ | ILEVMGDQSL | VPYASDLLET | ||||
| MFRNHKSHLK | SQTAESSWID | QWHETWVSPL | LFILCEGNLD | QKSYVIDYYL | ||||
| PKLLSYSPES | LQYMVKILQT | SIDAKTGQEQ | SFPSLGSCNS | RGALGALMAC | ||||
| LRIARAHGHL | QSATDTWENL | VSDARIKQGL | IHQHCQVRID | TLGLLCESNR | ||||
| STEIVSMEEM | QWIQFFITYN | LNSQSPGVRQ | QICSLLKKLF | CRIQESSQVL | ||||
| YKLEQSKSKR | EPENELTKQH | PSVSLQQYKN | FMSSICNSLF | EALFPGSSYS | ||||
| TRFSALTILG | SIAEVFHVPE | GRIYTVYQLS | HDIDVGRFQT | LMECFTSTFE | ||||
| DVKILAFDLL | MKLSKTAVHF | QDSGKLQGLF | QAALELSTST | KPYDCVTASY | ||||
| LLNFLIWQDA | LPSSLSAYLT | QQVACDNGDR | PAAVVERNTL | MVIKCLMENL | ||||
| EEEVSQAENS | LLQAAAAFPM | YGRVHCITGA | LQKLSLNSLQ | LVSEWRPVVE | ||||
| KLLLMSYRLS | TVVSPVIQSS | SPEGLIPMDT | DSESASRLQM | ILNEIQPRDT | ||||
| NDYFNQAKIL | KEHDSFDMKD | LNASVVNIDT | STEIKGKEVK | TCDVTAQMVL | ||||
| VCCWRSMKEV | ALLLGMLCQL | LPMQPVPESS | DGLLTVEQVK | EIGDYFKQHL | ||||
| LQSRHRGAFE | LAYTGFVKLT | EVLNRCPNVS | LQKLPEQWLW | SVLEEIKCSD | ||||
| PSSKLCATRR | SAGIPFYIQA | LLASEPKKGR | MDLLKITMKE | LISLAGPTDD | ||||
| IQSTVPQVHA | LNILRALFRD | TRLGENIIPY | VADGAKAAIL | GFTSPVWAVR | ||||
| NSSTLLFSAL | ITRIFGVKRA | KDEHSKTNRM | TGREFFSRFP | ELYPFLLKQL | ||||
| ETVANTVDSD | MGEPNRHPSM | FLLLLVLERL | YASPMDGTSS | ALSMGPFVPF | ||||
| IMRCGHSPVY | HSREMAARAL | VPFVMIDHIP | NTIRTLLSTL | PSCTDQCFRQ | ||||
| NHIHGTLLQV | FHLLQAYSDS | KHGTNSDFQH | ELTDITVCTK | AKLWLAKRQN | ||||
| PCLVTRAVYI | DILFLLTCCL | NRSAKDNQPV | LESLGFWEEV | RGIISGSELI | ||||
| TGFPWAFKVP | GLPQYLQSLT | RLAIAAVWAA | AAKSGERETN | VPISFSQLLE | ||||
| SAFPEVRSLT | LEALLEKFLA | AASGLGEKGV | PPLLCNMGEK | FLLLAMKENH | ||||
| PECFCKILKI | LHCMDPGEWL | PQTEHCVHLT | PKEFLIWTMD | IASNERSEIQ | ||||
| SVALRLASKV | ISHHMQTCVE | NRELIAAELK | QWVQLVILSC | EDHLPTESRL | ||||
| AVVEVLTSTT | PLFLTNPHPI | LELQDTLALW | KCVLTLLQSE | EQAVRDAATE | ||||
| TVTTAMSQEN | TCQSTEFAFC | QVDASIALAL | ALAVLCDLLQ | QWDQLAPGLP | ||||
| ILLGWLLGES | DDLVACVESM | HQVEEDYLFE | KAEVNFWAET | LIFVKYLCKH | ||||
| LFCLLSKSGW | RPPSPEMLCH | LQRMVSEQCH | LLSQFFRELP | PAAEFVKTVE | ||||
| FTRLRIQEER | TLACLRLLAF | LEGKEGEDTL | VLSVWDSYAE | SRQLTLPRTE | ||||
| AAC |
Funkcija uredi
Kako bi identificirali genetičke faktore koji se odnose na podložnost raku štitnjače, u jednoj studiji iz 2009., usvojili su pristup gena kandidata. Proučavali su označene i pretpostavljene funkcionalne jednonukleotidne polimorfizme (SNP) u genima uključenim u diferencijaciju i proliferaciju ćelija štitnjače, te u genima za koje je utvrđeno da su različito eksprimirani u karcinomu štitnjače.
Genotipizirano je ukupno 768 SNP-ova u 97 gena u španskoj seriji od 615 slučajeva i 525 kontrola, od kojih je prva činila najveću kolekciju pacijenata sa ovom patologijom iz jedne populacije koja je proučavana do sada. SNP-ovi u LD bloku, koji obuhvata cijeli gen FOXE1, pokazali su najjači dokaz povezanosti s osjetljivošću na papilni karcinom štitnjače. Ova povezanost potvrđena je u drugoj fazi studije koja je uključivala nezavisnu italijansku seriju od 482 pacijenta i 532 kontrolne skupine. Najjači rezultati asocijacije uočeni su za rs1867277: OR[po-alelu] = 1,49; 95%CI = 1,30 –1,70; P = 5,9x10 (x –9). Funkcionalni testovi rs1867277 (NM_004473.3:c.-283G>A) u okviru FOXE1 5' UTR sugeriraju da ova varijanta transkripta utiče na transkripciju FOXE1. Testovi vezanja DNK pokazali su da je, isključivo, sekvenca koja sadrži alel A regrutovala faktore transkripcije USF1/USF2, dok su oba alela formirala kompleks u kojem su učestvovali DREAM/CREB/alphaCREM.
Studije transfekcije pokazale su alelno zavisnu regulaciju transkripcije FOXE1. Predlažen je model regulacije FOXE1 koji ovisi o genotipu rs1867277, što ukazuje da je ovaj SNP uzročna varijanta u osjetljivosti na rak štitnjače. Ti rezultati predstavljali su prvo funkcionalno objašnjenje za povezanost koju je identificirala analiza cjelokupnog genoma (GWAS) i na taj način razjašnjavaju mehanizam podložnosti karcinomu štitnjače. Oni također potvrđuju efikasnost pristupa gena kandidata u GWAS eri.[7]
Reference uredi
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000115970 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024251 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Thyroid adenoma associated". Pristupljeno 10. 6. 2013.
- ^ "UniProt, Q6YHU6" (jezik: engleski). Pristupljeno 15. 11. 2021.
- ^ Iñigo Landa, Sergio Ruiz-Llorente, Cristina Montero-Conde, Lucía Inglada-Pérez, Francesca Schiavi, Susanna Leskelä, Guillermo Pita, Roger Milne, Javier Maravall, Ignacio Ramos, Víctor Andía, Paloma Rodríguez-Poyo, Antonino Jara-Albarrán, Amparo Meoro, Cristina del Peso, Luis Arribas, Pedro Iglesias, Javier Caballero, Joaquín Serrano, Antonio Picó, Francisco Pomares, Gabriel Giménez, Pedro López-Mondéjar, Roberto Castello, Isabella Merante-Boschin, Maria-Rosa Pelizzo, Didac Mauricio, Giuseppe Opocher, Cristina Rodríguez-Antona, Anna González-Neira, Xavier Matías-Guiu, Pilar Santisteban, Mercedes Robledo (2009): The variant rs1867277 in FOXE1 gene confers thyroid cancer susceptibility through the recruitment of USF1/USF2 transcription factors. PLoS Genet, 5(9):e1000637; pmid: 19730683; pmcid: pmc2727793; doi: 10.1371/journal.pgen.1000637