T-ćelijski leukemijski/limfomski protein 1B je protein koji je kod ljudi kodiran genom TCL1B.[3][4]

TCL1B
Identifikatori
AliasiTCL1B
Vanjski ID-jeviOMIM: 603769 HomoloGene: 81735 GeneCards: TCL1B
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 14 (čovjek)
Hrom.Hromosom 14 (čovjek)[1]
Hromosom 14 (čovjek)
Genomska lokacija za TCL1B
Genomska lokacija za TCL1B
Bend14q32.13Početak95,686,426 bp[1]
Kraj95,692,628 bp[1]
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein kinase binding
protein serine/threonine kinase activator activity
Ćelijska komponenta GO:0009327 makromolekulani kompleks
Biološki proces positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation
positive regulation of protein serine/threonine kinase activity
positive regulation of cell population proliferation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_199206
NM_004918

n/a

RefSeq (bjelančevina)

NP_004909

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 14: 95.69 – 95.69 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

PCR analizom hibridnog radijacijskog panela, Pekarsky et al. (1999) mapirali su gen TCL1B na hromosomu 14, sekvenca 14q32.1. Analiza pulsnog polja pozitivnog BAC klona otkrila je da se gen TCL1B nalazi približno 16 kb centromerno od gena TCL1A. Profili ekspresije dva gena su vrlo slični: oba su eksprimirana na vrlo niskim nivoima u normalnoj koštanoj srži i limfocitima periferne krvi, ali se aktiviraju u leukemiji T-ćelija, preuređenjem regije 14q32.1. Dakle, translokacije i inverzije na 14q32.1 u malignostima T-ćelija uključuju dva onkogena.[5] Hallas et al. (1999) predstavili su analizu kloniranja, mapiranja i ekspresije lokusa TCL1/Tcl1 kod ljudi i miševa. Otkrili su da osim TCL1A i TCL1B, ljudski lokus sadrži dva dodatna gena, TNG1 i TNG2, koji kodiraju proteine sa 141, odnosno 110 aminokiselina. Njihovi profili ekspresije bili su vrlo slični profilima TCL1A i TCL1B.[6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 128 aminokiselina, a molekulska težina 14.846 Da.[7].

1020304050
MASEASVRLGVPPGRLWIQRPGIYEDEEGRTWVTVVVRFNPSRREWARAS
QGSRYEPSITVHLWQMAVHTRELLSSGQMPFSQLPAVWQLYPGRKYRAAD
SSFWEIADHGQIDSMEQLVLTYQPERKD
Simboli

Kloniranje i ekspresija

uredi

TCL1A onkogen na poziciji 14q32.1 uključen je u razvoj leukemije T-ćelija. Njegova ekspresija u ovim leukemijama aktivira se hromosomskim translokacijama i inverzijama na 14q32.1. Pretražujući EST bazu podataka za sekvence homologne TCL1A i MTCP1, član porodice gena TCL1 koji se nalazi na Xq28 i aktivira se u rijetkim slučajevima zrele T-ćelijske leukemije sa (X;14) translokacijom, Pekarsky et al. (1999) izolirali su TCL1B, novog člana porodice gena TCL1. cDNK sa približno 1,2 kb TCL1B kodira 14-kD protein, koji sadrži 128 aminokiselina i pokazuje 60% sličnosti sekvence s proteinom TCL1A. Hallas et al. (1999) okarakterizirali su mišji lokus Tcl1a i pronašli pet gena homolognih ljudskom TCL1B. Pet proteina Tcl1b imali su veličine od 117 do 123 aminokiseline i bili su slični 65–80%, ali su pokazali samo 30–40% sličnosti s ljudskim TCL1B. Sve mišje Tcl1b i Tcl1a iRNK bile su prisutne u mišjim oocitima i dvoćelijskim embrionima, ali rijetko u različitim tkivima odraslih i limfoidnim ćelijskim linijama. Ovi podaci ukazuju na sličnu ili komplementarnu funkciju ovih proteina u ranoj embriogenezi.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000213231 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ Pekarsky Y, Hallas C, Isobe M, Russo G, Croce CM (maj 1999). "Abnormalities at 14q32.1 in T cell malignancies involve two oncogenes". Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (6): 2949–51. doi:10.1073/pnas.96.6.2949. PMC 15875. PMID 10077617.
  4. ^ "Entrez Gene: TCL1B T-cell leukemia/lymphoma 1B".
  5. ^ Pekarsky, Y., Hallas, C., Isobe, M., Russo, G., Croce, C. M. Abnormalities at 14q32.1 in T cell malignancies involve two oncogenes. Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 2949-2951, 1999. PubMed: 10077617
  6. ^ Hallas, C., Pekarsky, Y., Itoyama, T., Varnum, J., Bichi, R., Rothstein, J. L., Croce, C. M. Genomic analysis of human and mouse TCL1 loci reveals a complex of tightly clustered genes. Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 14418-14423, 1999. PubMed: 10588720
  7. ^ "UniProt, O95988". Pristupljeno 11. 9. 2017.

Dopunska literatura

uredi