TCL1B

TCL1B
Identifikatori
Aliasi	TCL1B
Vanjski ID-jevi	OMIM: 603769 HomoloGene: 81735 GeneCards: TCL1B
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 14 (čovjek)
Kraj	95,692,628 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• protein kinase binding; • protein serine/threonine kinase activator activity;
Ćelijska komponenta	• GO:0009327 makromolekulani kompleks;
Biološki proces	• positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity; • positive regulation of cell population proliferation;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	9623
	n/a
	ENSG00000213231
	n/a
	O95988
	n/a
	NM_199206; NM_004918
	n/a
	NP_004909
	n/a
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

T-ćelijski leukemijski/limfomski protein 1B je protein koji je kod ljudi kodiran genom TCL1B.^[3]^[4]

PCR analizom hibridnog radijacijskog panela, Pekarsky et al. (1999) mapirali su gen TCL1B na hromosomu 14, sekvenca 14q32.1. Analiza pulsnog polja pozitivnog BAC klona otkrila je da se gen TCL1B nalazi približno 16 kb centromerno od gena TCL1A. Profili ekspresije dva gena su vrlo slični: oba su eksprimirana na vrlo niskim nivoima u normalnoj koštanoj srži i limfocitima periferne krvi, ali se aktiviraju u leukemiji T-ćelija, preuređenjem regije 14q32.1. Dakle, translokacije i inverzije na 14q32.1 u malignostima T-ćelija uključuju dva onkogena.^[5] Hallas et al. (1999) predstavili su analizu kloniranja, mapiranja i ekspresije lokusa TCL1/Tcl1 kod ljudi i miševa. Otkrili su da osim TCL1A i TCL1B, ljudski lokus sadrži dva dodatna gena, TNG1 i TNG2, koji kodiraju proteine sa 141, odnosno 110 aminokiselina. Njihovi profili ekspresije bili su vrlo slični profilima TCL1A i TCL1B.^[6]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 128 aminokiselina, a molekulska težina 14.846 Da.^[7].

10	20	30	40	50
MASEASVRLG	VPPGRLWIQR	PGIYEDEEGR	TWVTVVVRFN	PSRREWARAS
QGSRYEPSIT	VHLWQMAVHT	RELLSSGQMP	FSQLPAVWQL	YPGRKYRAAD
SSFWEIADHG	QIDSMEQLVL	TYQPERKD

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija

TCL1A onkogen na poziciji 14q32.1 uključen je u razvoj leukemije T-ćelija. Njegova ekspresija u ovim leukemijama aktivira se hromosomskim translokacijama i inverzijama na 14q32.1. Pretražujući EST bazu podataka za sekvence homologne TCL1A i MTCP1, član porodice gena TCL1 koji se nalazi na Xq28 i aktivira se u rijetkim slučajevima zrele T-ćelijske leukemije sa (X;14) translokacijom, Pekarsky et al. (1999) izolirali su TCL1B, novog člana porodice gena TCL1. cDNK sa približno 1,2 kb TCL1B kodira 14-kD protein, koji sadrži 128 aminokiselina i pokazuje 60% sličnosti sekvence s proteinom TCL1A. Hallas et al. (1999) okarakterizirali su mišji lokus Tcl1a i pronašli pet gena homolognih ljudskom TCL1B. Pet proteina Tcl1b imali su veličine od 117 do 123 aminokiseline i bili su slični 65–80%, ali su pokazali samo 30–40% sličnosti s ljudskim TCL1B. Sve mišje Tcl1b i Tcl1a iRNK bile su prisutne u mišjim oocitima i dvoćelijskim embrionima, ali rijetko u različitim tkivima odraslih i limfoidnim ćelijskim linijama. Ovi podaci ukazuju na sličnu ili komplementarnu funkciju ovih proteina u ranoj embriogenezi.

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000213231 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Pekarsky Y, Hallas C, Isobe M, Russo G, Croce CM (maj 1999). "Abnormalities at 14q32.1 in T cell malignancies involve two oncogenes". Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (6): 2949–51. doi:10.1073/pnas.96.6.2949. PMC 15875. PMID 10077617.
^ "Entrez Gene: TCL1B T-cell leukemia/lymphoma 1B".
^ Pekarsky, Y., Hallas, C., Isobe, M., Russo, G., Croce, C. M. Abnormalities at 14q32.1 in T cell malignancies involve two oncogenes. Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 2949-2951, 1999. PubMed: 10077617
^ Hallas, C., Pekarsky, Y., Itoyama, T., Varnum, J., Bichi, R., Rothstein, J. L., Croce, C. M. Genomic analysis of human and mouse TCL1 loci reveals a complex of tightly clustered genes. Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 14418-14423, 1999. PubMed: 10588720
^ "UniProt, O95988". Pristupljeno 11. 9. 2017.

Dopunska literatura

Pekarsky Y, Hallas C, Croce CM (2001). "The role of TCL1 in human T-cell leukemia". Oncogene. 20 (40): 5638–43. doi:10.1038/sj.onc.1204596. PMID 11607815.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Laine J, Künstle G, Obata T, Noguchi M (2002). "Differential regulation of Akt kinase isoforms by the members of the TCL1 oncogene family". J. Biol. Chem. 277 (5): 3743–51. doi:10.1074/jbc.M107069200. PMID 11707444.
Laine J, Künstle G, Obata T, et al. (2000). "The protooncogene TCL1 is an Akt kinase coactivator". Mol. Cell. 6 (2): 395–407. doi:10.1016/S1097-2765(00)00039-3. PMID 10983986.
Saitou M, Sugimoto J, Hatakeyama T, et al. (2000). "Identification of the TCL6 genes within the breakpoint cluster region on chromosome 14q32 in T-cell leukemia". Oncogene. 19 (23): 2796–802. doi:10.1038/sj.onc.1203604. PMID 10851082.
Sugimoto J, Hatakeyama T, Narducci MG, et al. (1999). "Identification of the TCL1/MTCP1-like 1 (TML1) gene from the region next to the TCL1 locus". Cancer Res. 59 (10): 2313–7. PMID 10344735.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000213231 - Ensembl, maj 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid10077617-3] Pekarsky Y, Hallas C, Isobe M, Russo G, Croce CM (maj 1999). "Abnormalities at 14q32.1 in T cell malignancies involve two oncogenes". Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (6): 2949–51. doi:10.1073/pnas.96.6.2949. PMC 15875. PMID 10077617.

[entrez-4] "Entrez Gene: TCL1B T-cell leukemia/lymphoma 1B".

[5] Pekarsky, Y., Hallas, C., Isobe, M., Russo, G., Croce, C. M. Abnormalities at 14q32.1 in T cell malignancies involve two oncogenes. Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 2949-2951, 1999. PubMed: 10077617

[6] Hallas, C., Pekarsky, Y., Itoyama, T., Varnum, J., Bichi, R., Rothstein, J. L., Croce, C. M. Genomic analysis of human and mouse TCL1 loci reveals a complex of tightly clustered genes. Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 14418-14423, 1999. PubMed: 10588720

[UniProt-7] "UniProt, O95988". Pristupljeno 11. 9. 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]

[5]

[6]

[7]