Mali integralni membranski protein (SMIM) 20 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SMIM20 sa hromosoma 4.[5] SMIM20 djeluje kao prohormon na peptidni hormon feniksin koji je prvi put otkriven 2013. godine u senzornim ganglijama glodara.[6]

SMIM20
Identifikatori
AliasiSMIM20
Vanjski ID-jeviOMIM: 617465 MGI: 1913528 HomoloGene: 82612 GeneCards: SMIM20
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 4 (čovjek)
Hrom.Hromosom 4 (čovjek)[1]
Hromosom 4 (čovjek)
Genomska lokacija za SMIM20
Genomska lokacija za SMIM20
Bend4p15.2Početak25,861,830 bp[1]
Kraj25,929,813 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za SMIM20
Genomska lokacija za SMIM20
Bend5|5 C1Početak53,424,425 bp[2]
Kraj53,435,882 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta membrana
integral component of membrane
mitohondrija
mitochondrial inner membrane
Biološki proces mitochondrial cytochrome c oxidase assembly
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001145432
NM_001394130

NM_001145433

RefSeq (bjelančevina)

NP_001138904

NP_001138905

Lokacija (UCSC)Chr 4: 25.86 – 25.93 MbChr 5: 53.42 – 53.44 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 67 aminokiselina, а molekulska težina 7.702 Da.[7]

1020304050
MSRNLRTALIFGGFISLIGAAFYPIYFRPLMRLEEYKKEQAINRAGIVQE
DVQPPGLKVWSDPFGRK

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000250317 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000061461 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Small integral membrane protein 20". Pristupljeno 5. 2. 2014.
  6. ^ Neuroscience. 2013 Oct 10;250:622-31. doi: 10.1016 Yosten, G. L., Lyu, R. M., Hsueh, A. J., Avsian‐Kretchmer, O., Chang, J. K., Tullock, C. W., ... & Samson, W. K. (2013). A novel reproductive peptide, phoenixin. Journal of neuroendocrinology, 25(2), 206-215.
  7. ^ "UniProt, Q8N5G0" (jezik: engleski). Pristupljeno 31. 10. 2021.