Surfaktantni protein C (SP-C) jedan je od plućnih surfaktantnih proteina. To je membranski protein koji je kod ljudi kodiran genom SFTPC.[5][6][7]

SFTPC
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2YAD

Identifikatori
AliasiSFTPC
Vanjski ID-jeviOMIM: 178620 MGI: 109517 HomoloGene: 2271 GeneCards: SFTPC
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 8 (čovjek)
Hrom.Hromosom 8 (čovjek)[1]
Hromosom 8 (čovjek)
Genomska lokacija za SFTPC
Genomska lokacija za SFTPC
Bend8p21.3Početak22,156,913 bp[1]
Kraj22,164,479 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 14 (miš)
Hrom.Hromosom 14 (miš)[2]
Hromosom 14 (miš)
Genomska lokacija za SFTPC
Genomska lokacija za SFTPC
Bend14 D2|14 36.32 cMPočetak70,758,389 bp[2]
Kraj70,761,521 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje identičnih proteina
Ćelijska komponenta extracellular region
clathrin-coated endocytic vesicle
lamellar granule
endoplasmic reticulum membrane
multivesicular body lumen
Vanćelijsko
Biološki proces respiratory gaseous exchange by respiratory system
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001172357
NM_001172410
NM_003018
NM_001317778
NM_001317779

NM_001317780

NM_011359

RefSeq (bjelančevina)
NP_001165828
NP_001165881
NP_001304707
NP_001304708
NP_001304709

NP_003009

NP_035489

Lokacija (UCSC)Chr 8: 22.16 – 22.16 MbChr 14: 70.76 – 70.76 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 197 aminokiselina, а molekulska težina 21.053 Da.[8]

1020304050
MDVGSKEVLMESPPDYSAAPRGRFGIPCCPVHLKRLLIVVVVVVLIVVVI
VGALLMGLHMSQKHTEMVLEMSIGAPEAQQRLALSEHLVTTATFSIGSTG
LVVYDYQQLLIAYKPAPGTCCYIMKIAPESIPSLEALNRKVHNFQMECSL
QAKPAVPTSKLGQAEGRDAGSAPSGGDPAFLGMAVNTLCGEVPLYYI

Struktura

uredi
N-terminalni propeptidni surfaktantni protein C
 
Svinjski SP-C koji korespondira sa ljudskim zrelim oblikom
Identifikatori
SimbolSP_C-Propep

SFTPC 197-aminokiselinski protein sastavljen od dvije polovine: jedinstvenog N-terminalnog propeptidnog domena i C-terminalnog BRICHOS domena. Propeptidni domen dužine oko 100 aa zapravo ne sadrži samo cijepani dio, već i zreli peptid. Može se dalje razgraditi na 23-aminokiselinski spiralni transmembranski propeptid, zreli izlučeni SP-C (24-58) i linker (59-89) koji se povezuje s domenom BRICHOS.[9]

Propeptid plućnog surfaktanta C ima N-terminalni alfa-heliksni segment čija je predložena funkcija bila stabilizacija proteinske strukture, budući da se zreli peptid može nepovratno transformirati iz svoje nativne alfa-heliksne strukture u agregate beta-listova i formirati amiloidna vlakna. Također je prijavljeno da tačan unutarćelijski promet proSP-C zavisi od propeptida.[10]

Struktura BRICHOS domena je riješena. Mutacije u ovom domenu također dovode do amiloidnih vlakana sačinjenih od zrelog peptida, što ukazuje na šaperonsku aktivnost.[9]

Klinički značaj

uredi

Mutacije su povezane s disfunkcijom metabolizma surfaktanta tip 2.

Ljudi i životinje rođeni bez SP-C imaju tendenciju razvoja progresivne intersticijske bolesti pluća.

Rekombinantni SP-C koristi se u Venticuteu, vještačkom surfaktantu za pluća.

Opisan je postupak masovne proizvodnje analoga zvanog rSP-C33Le, fuzijom sa spidroinom.[11]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000168484 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022097 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Keller A, Eistetter HR, Voss T, Schäfer KP (juli 1991). "The pulmonary surfactant protein C (SP-C) precursor is a type II transmembrane protein". The Biochemical Journal. 277 ( Pt 2) (Pt 2): 493–9. doi:10.1042/bj2770493. PMC 1151261. PMID 1859376.
  6. ^ Johansson H, Nordling K, Weaver TE, Johansson J (juli 2006). "The Brichos domain-containing C-terminal part of pro-surfactant protein C binds to an unfolded poly-val transmembrane segment". The Journal of Biological Chemistry. 281 (30): 21032–9. doi:10.1074/jbc.M603001200. PMID 16709565.
  7. ^ "Entrez Gene: SFTPC surfactant, pulmonary-associated protein C".
  8. ^ "UniProt, P11686" (jezik: engleski). Pristupljeno 21. 9. 2021.
  9. ^ a b Willander H, Askarieh G, Landreh M, Westermark P, Nordling K, Keränen H, et al. (februar 2012). "High-resolution structure of a BRICHOS domain and its implications for anti-amyloid chaperone activity on lung surfactant protein C". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (7): 2325–9. Bibcode:2012PNAS..109.2325W. doi:10.1073/pnas.1114740109. PMC 3289314. PMID 22308375.
  10. ^ Li J, Liepinsh E, Almlén A, Thyberg J, Curstedt T, Jörnvall H, Johansson J (mart 2006). "Structure and influence on stability and activity of the N-terminal propeptide part of lung surfactant protein C". The FEBS Journal. 273 (5): 926–35. doi:10.1111/j.1742-4658.2006.05124.x. PMID 16478467. S2CID 1231483.
  11. ^ Kronqvist N, Sarr M, Lindqvist A, Nordling K, Otikovs M, Venturi L, et al. (maj 2017). "Efficient protein production inspired by how spiders make silk". Nature Communications. 8 (1): 15504. Bibcode:2017NatCo...815504K. doi:10.1038/ncomms15504. PMC 5457526. PMID 28534479.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi
Ovaj članak uključuje tekst iz javnog domena Pfam i InterPro: IPR015091