SEPT3

(Preusmjereno sa SEPTIN3)

Neuronski-specifični septin-3 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SEPT3 sa hromosoma 22.[5]

SEPT3
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3SOP, 4Z51, 4Z54

Identifikatori
AliasiSEPTIN3
Vanjski ID-jeviOMIM: 608314 MGI: 1345148 HomoloGene: 99740 GeneCards: SEPTIN3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 22 (čovjek)
Hrom.Hromosom 22 (čovjek)[1]
Hromosom 22 (čovjek)
Genomska lokacija za SEPT3
Genomska lokacija za SEPT3
Bend22q13.2Početak41,969,475 bp[1]
Kraj41,998,221 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 15 (miš)
Hrom.Hromosom 15 (miš)[2]
Hromosom 15 (miš)
Genomska lokacija za SEPT3
Genomska lokacija za SEPT3
Bend15|15 E1Početak82,153,003 bp[2]
Kraj82,178,775 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
GTP binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje identičnih proteina
molekularna funkcija
GO:0006184 GTPase activity
GO:0032947 molecular adaptor activity
Ćelijska komponenta citoplazma
međućelijske veze
sinapsa
citoskelet
septin ring
microtubule cytoskeleton
septin complex
septin filament array
neuron projection
presynaptic cytoskeleton
presynapse
Biološki proces ćelijski ciklus
Ćelijska dioba
mitotic cytokinesis
septin ring assembly
cilium assembly
cytoskeleton-dependent cytokinesis
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_145734
NM_019106
NM_145733
NM_001363845

NM_011889
NM_001358836
NM_001358837
NM_001368642
NM_001368643

NM_001368644
NM_001368645
NM_001368646
NM_001368647
NM_001368784
NM_001368785

RefSeq (bjelančevina)

NP_061979
NP_663786
NP_001350774

NP_036019
NP_001345765
NP_001345766

Lokacija (UCSC)Chr 22: 41.97 – 42 MbChr 15: 82.15 – 82.18 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 358 aminokiselina, a molekulska težina 40.704 Da.[5]

1020304050
MSKGLPETRTDAAMSELVPEPRPKPAVPMKPMSINSNLLGYIGIDTIIEQ
MRKKTMKTGFDFNIMVVGQSGLGKSTLVNTLFKSQVSRKASSWNREEKIP
KTVEIKAIGHVIEEGGVKMKLTVIDTPGFGDQINNENCWEPIEKYINEQY
EKFLKEEVNIARKKRIPDTRVHCCLYFISPTGHSLRPLDLEFMKHLSKVV
NIIPVIAKADTMTLEEKSEFKQRVRKELEVNGIEFYPQKEFDEDLEDKTE
NDKIRQESMPFAVVGSDKEYQVNGKRVLGRKTPWGIIEVENLNHCEFALL
RDFVIRTHLQDLKEVTHNIHYETYRAKRLNDNGGLPPGEGLLGTVLPPVP
ATPCPTAE

Funkcija

uredi

Ovaj gen pripada septinskoj porodici GTPaza. Članovi ove porodice su potrebni za citokinezu. Ekspresija je pojačana retinoinskom kiselinom u ljudskoj teratokarcinomskoj ćelijskoj liniji. Specifična funkcija ovog gena nije utvrđena. Alternativna prerada ovog gena rezultira višestrukim varijantama transkripta.[5]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100167 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022456 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c "Entrez Gene: SEPT3 septin 3".

Dopunska literatura

uredi