E3 ubikvitin-proteinska ligaza RNF34 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom RNF34.[5][6]

RNF34
Identifikatori
AliasiRNF34
Vanjski ID-jeviOMIM: 608299 MGI: 2153340 HomoloGene: 11839 GeneCards: RNF34
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za RNF34
Genomska lokacija za RNF34
Bend12q24.31Početak121,400,083 bp[1]
Kraj121,430,623 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za RNF34
Genomska lokacija za RNF34
Bend5|5 FPočetak122,988,111 bp[2]
Kraj123,009,354 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje iona metala
phosphatidylinositol phosphate binding
p53 binding
ubiquitin protein ligase binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
GO:0050372 aktivnost sa transferazom ubikvitina
aktivnost sa transferazom
Ćelijska komponenta citoplazma
Endomembranski sistem
jedro
membrana
ćelijska membrana
nuclear speck
nukleoplazma
citosol
nuclear body
Biološki proces negative regulation of signal transduction by p53 class mediator
negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor signaling pathway
protein K48-linked ubiquitination
negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis
GO:0097285 apoptoza
regulation of oxygen metabolic process
cellular response to cold
protein ubiquitination
proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
ubiquitin-dependent protein catabolic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_194271
NM_001256858
NM_025126
NM_001394208

NM_030564

RefSeq (bjelančevina)

NP_001243787
NP_079402
NP_919247

NP_085041

Lokacija (UCSC)Chr 12: 121.4 – 121.43 MbChr 5: 122.99 – 123.01 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein kodiran ovim genom sadrži RINF prst, motiv za koji se zna da je uključen u interakcije protein-protein i protein-DNK. Ovaj protein stupa u interakciju s DNAJA3/hTid-1, koji je protein DnaJ, za koji se izvještava da funkcionira kao modulator apoptoze. Pokazalo se da pretjerana ekspresija ovog gena u HeLa ćelijama daje otpornost na apoptozu induciranu TNF-alfa, što ukazuje na anti-apoptotičku funkciju ovog proteina. Ovaj protein se može cijepati kaspazom-3 tokom indukcije apoptoze. Prijavljene su i alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 372 aminokiseline, a molekulska težina 41.641 Da.[7]

1020304050
MKAGATSMWASCCGLLNEVMGTGAVRGQQSAFAGATGPFRFTPNPEFSTY
PPAATEGPNIVCKACGLSFSVFRKKHVCCDCKKDFCSVCSVLQENLRRCS
TCHLLQETAFQRPQLMRLKVKDLRQYLILRNIPIDTCREKEDLVDLVLCH
HGLGSEDDMDTSSLNSSRSQTSSFFTRSFFSNYTAPSATMSSFQGELMDG
DQTSRSGVPAQVQSEITSANTEDDDDDDDEDDDDEEENAEDRNPGLSKER
VRASLSDLSSLDDVEGMSVRQLKEILARNFVNYSGCCEKWELVEKVNRLY
KENEENQKSYGERLQLQDEEDDSLCRICMDAVIDCVLLECGHMVTCTKCG
KRMSECPICRQYVVRAVHVFKS
Simboli

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000170633 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029474 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Sasaki S, Nakamura T, Arakawa H, Mori M, Watanabe T, Nagawa H, Croce CM (Jul 2002). "Isolation and characterization of a novel gene, hRFI, preferentially expressed in esophageal cancer". Oncogene. 21 (32): 5024–30. doi:10.1038/sj.onc.1205627. PMID 12118383.
  6. ^ a b "Entrez Gene: RNF34 ring finger protein 34".
  7. ^ "UniProt, Q969K3". Pristupljeno 14. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi