Ras-pridruženi protein 5 sa domenom jest protein koji je kod ljudi kodiran genom RASSF5 ili F5 sa hromosoma 1.[5][6][7]

RASSF5
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4LGD, 4OH8

Identifikatori
AliasiRASSF5
Vanjski ID-jeviOMIM: 607020 MGI: 1926375 HomoloGene: 10296 GeneCards: RASSF5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za RASSF5
Genomska lokacija za RASSF5
Bend1q32.1Početak206,507,531 bp[1]
Kraj206,589,448 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za RASSF5
Genomska lokacija za RASSF5
Bend1 E4|1 56.91 cMPočetak131,104,147 bp[2]
Kraj131,172,995 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje iona metala
vezivanje identičnih proteina
Ćelijska komponenta citoplazma
Mikrotubula
citoskelet
jedro
Biološki proces GO:0007243 intracellular signal transduction
positive regulation of protein ubiquitination
GO:0072468 Transdukcija signala
negative regulation of cell population proliferation
regulation of protein localization to nucleus
GO:0097285 apoptoza
regulation of apoptotic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_182665
NM_031437
NM_182663
NM_182664

NM_018750
NM_001311094
NM_001313731

RefSeq (bjelančevina)

NP_872604
NP_872605
NP_872606

NP_001298023
NP_001300660
NP_061220

Lokacija (UCSC)Chr 1: 206.51 – 206.59 MbChr 1: 131.1 – 131.17 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 418 aminokiselina, a molekulska težina 47.090 Da.[8]

1020304050
MAMASPAIGQRPYPLLLDPEPPRYLQSLSGPELPPPPPDRSSRLCVPAPL
STAPGAREGRSARRAARGNLEPPPRASRPARPLRPGLQQRLRRRPGAPRP
RDVRSIFEQPQDPRVPAERGEGHCFAELVLPGGPGWCDLCGREVLRQALR
CTNCKFTCHPECRSLIQLDCSQQEGLSRDRPSPESTLTVTFSQNVCKPVE
ETQRPPTLQEIKQKIDSYNTREKNCLGMKLSEDGTYTGFIKVHLKLRRPV
TVPAGIRPQSIYDAIKEVNLAATTDKRTSFYLPLDAIKQLHISSTTTVSE
VIQGLLKKFMVVDNPQKFALFKRIHKDGQVLFQKLSIADRPLYLRLLAGP
DTEVLSFVLKENETGEVEWDAFSIPELQNFLTILEKEEQDKIQQVQKKYD
KFRQKLEEALRESQGKPG

Funkcija

uredi

Ovaj gen je član porodice pridružene domenu Ras. Djeluje kao supresor tumora i inaktivira se kod raznih vrsta raka. Kodirani protein se lokalizira na centrosome i mikrotubule i povezuje se s GTP-aktiviranim oblicima Ras, Rap1 i nekoliko drugih malih GTPaza sličnih Ras. Protein reguliše adheziju limfocita i potiskuje rast ćelija kao odgovor na aktivirani Rap1 ili Ras. Za ovaj gen nađene su višestruke varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[7]

Interakcije

uredi

Pokazalo se da RASSF5 ima interakcije sa RRAS,[9] RAP2A,[9] MRAS[9] i RASSF1.[9]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000266094 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026430 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Yao R, Wang Y, You M (Apr 2002). "Chromosome mapping and sequence variation of the murine Ras effector gene Nore1". Cytogenetics and Cell Genetics. 95 (1–2): 126–8. doi:10.1159/000057035. PMID 11978988. S2CID 26933977.
  6. ^ Tommasi S, Dammann R, Jin SG, Zhang XF, Avruch J, Pfeifer GP (Apr 2002). "RASSF3 and NORE1: identification and cloning of two human homologues of the putative tumor suppressor gene RASSF1". Oncogene. 21 (17): 2713–20. doi:10.1038/sj.onc.1205365. PMID 11965544.
  7. ^ a b "Entrez Gene: RASSF5 Ras association (RalGDS/AF-6) domain family 5".
  8. ^ "UniProt, Q8WWW0" (jezik: engleski). Pristupljeno 17. 12. 2021.
  9. ^ a b c d Ortiz-Vega S, Khokhlatchev A, Nedwidek M, Zhang XF, Dammann R, Pfeifer GP, Avruch J (Feb 2002). "The putative tumor suppressor RASSF1A homodimerizes and heterodimerizes with the Ras-GTP binding protein Nore1". Oncogene. 21 (9): 1381–90. doi:10.1038/sj.onc.1205192. PMID 11857081.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi