PCYOX1
PCBP1 antisens RNK 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom PCBP1-AS1 sa hromosoma 2.[5]
Amiokiselininska sekvenca
urediDužina polipeptidnog lanca je 505 aminokiselina, a molekulska težina 56.640 Da.[6]
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGRVVAELVS | SLLGLWLLLC | SCGCPEGAEL | RAPPDKIAII | GAGIGGTSAA | ||||
YYLRQKFGKD | VKIDLFEREE | VGGRLATMMV | QGQEYEAGGS | VIHPLNLHMK | ||||
RFVKDLGLSA | VQASGGLLGI | YNGETLVFEE | SNWFIINVIK | LVWRYGFQSL | ||||
RMHMWVEDVL | DKFMRIYRYQ | SHDYAFSSVE | KLLHALGGDD | FLGMLNRTLL | ||||
ETLQKAGFSE | KFLNEMIAPV | MRVNYGQSTD | INAFVGAVSL | SCSDSGLWAV | ||||
EGGNKLVCSG | LLQASKSNLI | SGSVMYIEEK | TKTKYTGNPT | KMYEVVYQIG | ||||
TETRSDFYDI | VLVATPLNRK | MSNITFLNFD | PPIEEFHQYY | QHIVTTLVKG | ||||
ELNTSIFSSR | PIDKFGLNTV | LTTDNSDLFI | NSIGIVPSVR | EKEDPEPSTD | ||||
GTYVWKIFSQ | ETLTKAQILK | LFLSYDYAVK | KPWLAYPHYK | PPEKCPSIIL | ||||
HDRLYYLNGI | ECAASAMEMS | AIAAHNAALL | AYHRWNGHTD | MIDQDGLYEK | ||||
LKTEL |
Funkcija
urediU jednom istraživanju iz 2017. , identificirani su skupovi funkcionalno povezanih dugolančanih nekodirajućih RNK (lncRNA) i iRNK i procijenivan značaj lncRNK u mreži lncRNK-iRNK. Sroveli su ponderiranu analizu mreže koekspresije gena i analizu obogaćivanja da identifciraju funkcionalne module koekspresiranih lncRNK i iRNK u monojedarnim ćelijama periferne krvi 43 žene. Identificirali su sedam modula i pronašli lokus lncRNK u svakom modulu. Četiri od sedam modula imala su značajna obogaćenja genske ontologije. Neke od čvorišnih lncRNK (npr. SSX8, UCA1, HOXA-AS2, STARD4-AS1 i PCBP1-AS1) imaju poznate funkcije povezane s bolestima kao što su kanceri. U zaključku se navodi da su pokazali da lncRNK mogu imati važnu ulogu u modulima koekspresije lncRNK-iRNK.[7]
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000116005 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029998 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: PCBP1 antisense RNA 1". Pristupljeno 30. 7. 2018.
- ^ "UniProt, Q9UHG3" (jezik: engleski). Pristupljeno 14. 11. 2021.
- ^ Xing-Bo Mo, Long-Fei Wu, Xiao-Wei Zhu , Wei Xia , Lan Wang , Pei He, Peng-Fei Bing, Xin Lu, Yong-Hong Zhang , Fei-Yan Deng , Shu-Feng Lei (2017): Identification and evaluation of lncRNA and mRNA integrative modules in human peripheral blood mononuclear cells.Epigenomics, 9(7): 943-954; pmid: 28621149; doi: 10.2217/epi-2016-0178