Nukleolusni protein 6 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NOL6.[5][6][7]

NOL6
Identifikatori
AliasiNOL6
Vanjski ID-jeviOMIM: 611532 MGI: 2140151 HomoloGene: 41505 GeneCards: NOL6
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za NOL6
Genomska lokacija za NOL6
Bend9p13.3Početak33,461,353 bp[1]
Kraj33,473,930 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 4 (miš)
Hrom.Hromosom 4 (miš)[2]
Hromosom 4 (miš)
Genomska lokacija za NOL6
Genomska lokacija za NOL6
Bend4|4 A5Početak41,114,427 bp[2]
Kraj41,124,455 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta kondenzovani nuklearni hromosom
small-subunit processome
Jedarce
mitohondrija
jedro
CURI complex
hromosom
UTP-C complex
nukleoplazma
Biološki proces tRNA export from nucleus
rRNA processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_139235
NM_022917
NM_130793

NM_139236
NM_139237

RefSeq (bjelančevina)

NP_075068
NP_631981

NP_631982

Lokacija (UCSC)Chr 9: 33.46 – 33.47 MbChr 4: 41.11 – 41.12 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.146 aminokiselina, а molekulska težina 127.593 Da.[8]

1020304050
MGPAPAGEQLRGATGEPEVMEPALEGTGKEGKKASSRKRTLAEPPAKGLL
QPVKLSRAELYKEPTNEELNRLRETEILFHSSLLRLQVEELLKEVRLSEK
KKDRIDAFLREVNQRVVRVPSVPETELTDQAWLPAGVRVPLHQVPYAVKG
CFRFLPPAQVTVVGSYLLGTCIRPDINVDVALTMPREILQDKDGLNQRYF
RKRALYLAHLAHHLAQDPLFGSVCFSYTNGCHLKPSLLLRPRGKDERLVT
VRLHPCPPPDFFRPCRLLPTKNNVRSAWYRGQSPAGDGSPEPPTPRYNTW
VLQDTVLESHLQLLSTILSSAQGLKDGVALLKVWLRQRELDKGQGGFTGF
LVSMLVVFLVSTRKIHTTMSGYQVLRSVLQFLATTDLTVNGISLCLSSDP
SLPALADFHQAFSVVFLDSSGHLNLCADVTASTYHQVQHEARLSMMLLDS
RADDGFHLLLMTPKPMIRAFDHVLHLRPLSRLQAACHRLKLWPELQDNGG
DYVSAALGPLTTLLEQGLGARLNLLAHSRPPVPEWDISQDPPKHKDSGTL
TLGLLLRPEGLTSVLELGPEADQPEAAKFRQFWGSRSELRRFQDGAIREA
VVWEAASMSQKRLIPHQVVTHLLALHADIPETCVHYVGGPLDALIQGLKE
TSSTGEEALVAAVRCYDDLSRLLWGLEGLPLTVSAVQGAHPVLRYTEVFP
PTPVRPAFSFYETLRERSSLLPRLDKPCPAYVEPMTVVCHLEGSGQWPQD
AEAVQRVRAAFQLRLAELLTQQHGLQCRATATHTDVLKDGFVFRIRVAYQ
REPQILKEVQSPEGMISLRDTAASLRLERDTRQLPLLTSALHGLQQQHPA
FSGVARLAKRWVRAQLLGEGFADESLDLVAAALFLHPEPFTPPSSPQVGF
LRFLFLVSTFDWKNNPLFVNLNNELTVEEQVEIRSGFLAARAQLPVMVIV
TPQDRKNSVWTQDGPSAQILQQLVVLAAEALPMLEKQLMDPRGPGDIRTV
FRPPLDIYDVLIRLSPRHIPRHRQAVDSPAASFCRGLLSQPGPSSLMPVL
GYDPPQLYLTQLREAFGDLALFFYDQHGGEVIGVLWKPTSFQPQPFKASS
TKGRMVMSRGGELVMVPNVEAILEDFAVLGEGLVQTVEARSERWTV

Funkcija

uredi

Jedarce je gusta subjedarna membranska organela koja se okuplja oko klastera gena rRNK i funkcionira u biogenezi ribosoma. Ovaj gen kodira jedarčani protein povezan s RNK koji je visoko konzerviran među vrstama. Tretman permeabiliziranih ćrlija Rnazama pokazuje da je nukleolusna lokalizacija ovisna o RNK. Daljnje studije ukazuju da je protein povezan s biogenezom ribosoma kroz interakciju s primarnim transkriptima pre-rRNK. Na ovom mjestu postoji alternativna prerada i identificirane su dvije prerađene varijante koje kodiraju različite izoforme.[7]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165271 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028430 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Utama B, Kennedy D, Ru K, Mattick JS (Mar 2002). "Isolation and characterization of a new nucleolar protein, Nrap, that is conserved from yeast to humans". Genes Cells. 7 (2): 115–32. doi:10.1046/j.1356-9597.2001.00507.x. PMID 11895476. S2CID 21385000.
  6. ^ Bernstein KA, Gallagher JE, Mitchell BM, Granneman S, Baserga SJ (Dec 2004). "The small-subunit processome is a ribosome assembly intermediate". Eukaryot Cell. 3 (6): 1619–26. doi:10.1128/EC.3.6.1619-1626.2004. PMC 539036. PMID 15590835.
  7. ^ a b "Entrez Gene: NOL6 nucleolar protein family 6 (RNA-associated)".
  8. ^ "UniProt, Q9H6R4". Pristupljeno 10. 9. 2021.

Dopunska literatura

uredi