NLRP9, skraćelica za porodicu nukleotidnovezujućih oligomerizacijskih receptora sa proteinom 9, je unutarćelijski protein koji se javlja u jajnicima, sjemenicima, oocitima i preimplantacijskim embrionima sisara sisara koji je vjerovatno uključen u reprodukcijskke procese. To jest protein koji je kod ljudi kodiran genom sa q kraka hromosoma 19.[5][6][7] Također je poznat kao NALP9, NOD6, PAN12 i CLR19.1, i jedan je od 14 pirinskih domena koji sadrže članove porodice NOD-sličnih citoplazmatskih receptora.

NLRP9
Identifikatori
AliasiNLRP9
Vanjski ID-jeviOMIM: 609663 MGI: 2675377 HomoloGene: 18530 GeneCards: NLRP9
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za NLRP9
Genomska lokacija za NLRP9
Bend19q13.42Početak55,708,438 bp[1]
Kraj55,738,402 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za NLRP9
Genomska lokacija za NLRP9
Bend7|7 A3Početak19,725,390 bp[2]
Kraj19,807,231 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija ATP binding
nucleotide binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoplazma
Inflamasom
Biološki proces positive regulation of interleukin-18 production
defense response to virus
Piroptoza
immune system process
inflammatory response
Urođeni imunski sistem
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_176820

NM_194058

RefSeq (bjelančevina)

NP_789790

NP_918947

Lokacija (UCSC)Chr 19: 55.71 – 55.74 MbChr 7: 19.73 – 19.81 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 991 aminokiselina, a molekulska težina 113.312 Da.

1020304050
MAESFFSDFGLLWYLKELRKEEFWKFKELLKQPLEKFELKPIPWAELKKA
SKEDVAKLLDKHYPGKQAWEVTLNLFLQINRKDLWTKAQEEMRNKLNPYR
KHMKETFQLIWEKETCLHVPEHFYKETMKNEYKELNDAYTAAARRHTVVL
EGPDGIGKTTLLRKVMLDWAEGNLWKDRFTFVFFLNVCEMNGIAETSLLE
LLSRDWPESSEKIEDIFSQPERILFIMDGFEQLKFNLQLKADLSDDWRQR
QPMPIILSSLLQKKMLPESSLLIALGKLAMQKHYFMLRHPKLIKLLGFSE
SEKKSYFSYFFGEKSKALKVFNFVRDNGPLFILCHNPFTCWLVCTCVKQR
LERGEDLEINSQNTTYLYASFLTTVFKAGSQSFPPKVNRARLKSLCALAA
EGIWTYTFVFSHGDLRRNGLSESEGVMWVGMRLLQRRGDCFAFMHLCIQE
FCAAMFYLLKRPKDDPNPAIGSITQLVRASVVQPQTLLTQVGIFMFGIST
EEIVSMLETSFGFPLSKDLKQEITQCLESLSQCEADREAIAFQELFIGLF
ETQEKEFVTKVMNFFEEVFIYIGNIEHLVIASFCLKHCQHLTTLRMCVEN
IFPDDSGCISDYNEKLVYWRELCSMFITNKNFQILDMENTSLDDPSLAIL
CKALAQPVCKLRKLIFTSVYFGHDSELFKAVLHNPHLKLLSLYGTSLSQS
DIRHLCETLKHPMCKIEELILGKCDISSEVCEDIASVLACNSKLKHLSLV
ENPLRDEGMTLLCEALKHSHCALERLMLMYCCLTSVSCDSISEVLLCSKS
LSLLDLGSNALEDNGVASLCAALKHPGCSIRELWLMGCFLTSDSCKDIAA
VLICNGKLKTLKLGHNEIGDTGVRQLCAALQHPHCKLECLGLQTCPITRA
CCDDIAAALIACKTLRSLNLDWIALDADAVVVLCEALSHPDCALQMLGLH
KSGFDEETQKILMSVEEKIPHLTISHGPWIDEEYKIRGVLL

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000185792 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060508 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Dalbiès-Tran R, Papillier P, Pennetier S, Uzbekova S, Monget P (august 2005). "Bovine mater-like NALP9 is an oocyte marker gene". Mol. Reprod. Dev. 71 (4): 414–21. doi:10.1002/mrd.20298. PMID 15892040. S2CID 33157680.
  6. ^ Ponsuksili S, Brunner RM, Goldammer T, et al. (mart 2006). "Bovine NALP5, NALP8, and NALP9 genes: assignment to a QTL region and the expression in adult tissues, oocytes, and preimplantation embryos". Biol. Reprod. 74 (3): 577–84. doi:10.1095/biolreprod.105.045096. PMID 16339045.
  7. ^ Tian X, Pascal G, Monget P (2009). "Evolution and functional divergence of NLRP genes in mammalian reproductive systems". BMC Evol. Biol. 9: 202. doi:10.1186/1471-2148-9-202. PMC 2735741. PMID 19682372.

Dopunska literatura

uredi

Šablon:Nukleotidnovezujući oligomerizacijski receptori