NLRP8, skraćenica za porodicu NOD-likih receptora pirinskog domena sa proreinom 8, je unutarćelijski protein koji se eksprimira u jajnicima, sjemenicima ipreimplantcijskim embrionima sisara. To jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NLRP8 sa q kraka hromosoma 19.[3][4] Također je poznat kao NALP8, NOD16, PAN4 i CLR19.2, i jedan je od 14 pirinskih domena koji sadrže članove porodice NOD-u sličnih citoplazmatskih receptora.

NLRP8
Identifikatori
AliasiNLRP8
Vanjski ID-jeviOMIM: 609659 HomoloGene: 82360 GeneCards: NLRP8
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za NLRP8
Genomska lokacija za NLRP8
Bend19q13.43Početak55,947,832 bp[1]
Kraj55,988,629 bp[1]
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
ATP binding
molekularna funkcija
Ćelijska komponenta citoplazma
ćelijska komponenta
Biološki proces neuron death
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_176811
NM_001317000

n/a

RefSeq (bjelančevina)

NP_001303929
NP_789781

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 19: 55.95 – 55.99 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.048 aminokiselina, a molekulska težina 119.430 Da.[3]

1020304050
MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSH
EELQRFKQLLLTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDV
TSNIFAIMNCDKMCVVVRREINAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKI
RRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQGVHRHEEYLPCLLLPKRPQG
RQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCAFYFHCQEVNQ
TTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPS
LVTLPGFNTMEKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCW
MVCSGLKQQMERGNNLTQSCPNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQ
LEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLDQTGVTAFLGMSILRRIAGEE
DHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQRLIASPRGSKS
YLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLK
RCQYLHEVELTVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFA
TNDKLEVLTMTNSVLGPPFLKALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQD
LIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLCRVLRSPRCRLQCLRLEDCLA
TPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQLERLSIENCN
LTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
LVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKN
PDCTLQILELENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILT
LCEAFSSQKKREEVIFCIPAWTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000179709 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ a b Ponsuksili S, Brunner RM, Goldammer T, et al. (mart 2006). "Bovine NALP5, NALP8, and NALP9 genes: assignment to a QTL region and the expression in adult tissues, oocytes, and preimplantation embryos". Biol. Reprod. 74 (3): 577–84. doi:10.1095/biolreprod.105.045096. PMID 16339045.
  4. ^ Tian X, Pascal G, Monget P (2009). "Evolution and functional divergence of NLRP genes in mammalian reproductive systems". BMC Evol. Biol. 9: 202. doi:10.1186/1471-2148-9-202. PMC 2735741. PMID 19682372.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkocvi

uredi

Šablon:NOD- receptori