NLRP6, skraćeno za NOD-liki receptor porodice pirinski domen sa proteinom 6, je unutarćelijski protein koji ima ulogu u imunskom sistemu. Također je poznat kao NALP6, PYPAF5, PAN3 i CLR11.4, i jedan je od 14 pirinskih domena koji sadrže članove porodice receptora sličnih NOD receptor za prepoznavanje uzoraka. Kao i kod nekoliko drugih receptora sličnih NOD-u, uloga NLRP6 u imunosti povezana je sa njegovom sposobnošću da reguliše aktivnost kaspaze-1 i NF-κB.To jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NLRP6 sa hromosoma 11.[5]

NLRP6
Identifikatori
AliasiNLRP6
Vanjski ID-jeviOMIM: 609650 MGI: 2141990 HomoloGene: 15881 GeneCards: NLRP6
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za NLRP6
Genomska lokacija za NLRP6
Bend11p15.5Početak278,407 bp[1]
Kraj285,388 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za NLRP6
Genomska lokacija za NLRP6
Bend7|7 F5Početak140,500,815 bp[2]
Kraj140,509,105 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
vasopressin receptor activity
ATP binding
Ćelijska komponenta citoplazma
Jedarna membrana
membrana
ćelijska membrana
Inflamasom
jedro
Biološki proces response to bacterium
immune system process
Zarastanje rana
regulation of mucus secretion
negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
negative regulation of immune response
regulation of autophagy
negative regulation of toll-like receptor signaling pathway
negative regulation of inflammatory response to antigenic stimulus
regulation of inflammatory response
negative regulation of MAPK cascade
negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade
Urođeni imunski sistem
inflammatory response
G protein-coupled receptor signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001276700
NM_138329

NM_001081389
NM_133946

RefSeq (bjelančevina)

NP_001263629
NP_612202

NP_598707

Lokacija (UCSC)Chr 11: 0.28 – 0.29 MbChr 7: 140.5 – 140.51 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 892 aminokiseline, a molekulska težina 98.768 Da.[5]

1020304050
MDQPEAPCSSTGPRLAVARELLLAALEELSQEQLKRFRHKLRDVGPDGRS
IPWGRLERADAVDLAEQLAQFYGPEPALEVARKTLKRADARDVAAQLQER
RLQRLGLGSGTLLSVSEYKKKYREHVLQLHARVKERNARSVKITKRFTKL
LIAPESAAPEEAMGPAEEPEPGRARRSDTHTFNRLFRRDEEGRRPLTVVL
QGPAGIGKTMAAKKILYDWAAGKLYQGQVDFAFFMPCGELLERPGTRSLA
DLILDQCPDRGAPVPQMLAQPQRLLFILDGADELPALGGPEAAPCTDPFE
AASGARVLGGLLSKALLPTALLLVTTRAAAPGRLQGRLCSPQCAEVRGFS
DKDKKKYFYKYFRDERRAERAYRFVKENETLFALCFVPFVCWIVCTVLRQ
QLELGRDLSRTSKTTTSVYLLFITSVLSSAPVADGPRLQGDLRNLCRLAR
EGVLGRRAQFAEKELEQLELRGSKVQTLFLSKKELPGVLETEVTYQFIDQ
SFQEFLAALSYLLEDGGVPRTAAGGVGTLLRGDAQPHSHLVLTTRFLFGL
LSAERMRDIERHFGCMVSERVKQEALRWVQGQGQGCPGVAPEVTEGAKGL
EDTEEPEEEEEGEEPNYPLELLYCLYETQEDAFVRQALCRFPELALQRVR
FCRMDVAVLSYCVRCCPAGQALRLISCRLVAAQEKKKKSLGKRLQASLGG
GSSSQGTTKQLPASLLHPLFQAMTDPLCHLSSLTLSHCKLPDAVCRDLSE
ALRAAPALTELGLLHNRLSEAGLRMLSEGLAWPQCRVQTVRVQLPDPQRG
LQYLVGMLRQSPALTTLDLSGCQLPAPMVTYLCAVLQHQGCGLQTLSLAS
VELSEQSLQELQAVKRAKPDLVITHPALDGHPQPPKELISTF

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174885 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038745 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Grenier JM, Wang L, Manji GA, et al. (oktobar 2002). "Functional screening of five PYPAF family members identifies PYPAF5 as a novel regulator of NF-kappaB and caspase-1". FEBS Lett. 530 (1–3): 73–8. doi:10.1016/S0014-5793(02)03416-6. PMID 12387869. S2CID 25023390.

Dopunska literatura

uredi

Šablon:NOD-liki receptori