LANCL1

LANCL1
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	3E6U, 3E73
Identifikatori
Aliasi	LANCL1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 604155 MGI: 1336997 HomoloGene: 4417 GeneCards: LANCL1
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 2 (čovjek)
Kraj	210,477,652 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 1 (miš)
Kraj	67,078,031 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• SH3 domain binding; • low-density lipoprotein particle receptor binding; • vezivanje iona cinka; • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • G protein-coupled receptor activity; • vezivanje iona metala; • glutathione binding; • catalytic activity; • glutathione transferase activity; • aktivnost sa transferazom;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • integral component of plasma membrane; • membrana; • ćelijska membrana;
Biološki proces	• G protein-coupled receptor signaling pathway; • regulation of neuron apoptotic process; • regulation of oxidative stress-induced neuron death;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	10314
	14768
	ENSG00000115365
	ENSMUSG00000026000
	O43813
	O89112
	NM_001136574; NM_001136575; NM_006055
	NM_001190984; NM_001190985; NM_021295
	NP_001130046; NP_001130047; NP_006046
	NP_001177913; NP_001177914; NP_067270
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

LanC-liki protein 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom LANCL1 sa hromosoma 2.^[5]

Amiokiselininska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 399 aminokiselina, a molekulska težina 45.283 Da.^[6]

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MAQRAFPNPY	ADYNKSLAEG	YFDAAGRLTP	EFSQRLTNKI	RELLQQMERG
LKSADPRDGT	GYTGWAGIAV	LYLHLYDVFG	DPAYLQLAHG	YVKQSLNCLT
KRSITFLCGD	AGPLAVAAVL	YHKMNNEKQA	EDCITRLIHL	NKIDPHAPNE
MLYGRIGYIY	ALLFVNKNFG	VEKIPQSHIQ	QICETILTSG	ENLARKRNFT
AKSPLMYEWY	QEYYVGAAHG	LAGIYYYLMQ	PSLQVSQGKL	HSLVKPSVDY
VCQLKFPSGN	YPPCIGDNRD	LLVHWCHGAP	GVIYMLIQAY	KVFREEKYLC
DAYQCADVIW	QYGLLKKGYG	LCHGSAGNAY	AFLTLYNLTQ	DMKYLYRACK
FAEWCLEYGE	HGCRTPDTPF	SLFEGMAGTI	YFLADLLVPT	KARFPAFEL

Funkcija

Ovaj gen kodira slabo povezan periferni membranski protein povezan s proteinima porodice LanC povezanim s bakterijskom membranom uključenim u biosintezu antimikrobnih peptida. Ovaj protein može imati ulogu peptidne komponente koja modificira enzim u eukariotskim ćelijama. Ranije se smatrao članom natporodice G-proteinspregnutih receptora, ali je sada u porodici LanC. Identificirano je više alternativno prerađenih varijanti, koje kodiraju isti protein.

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000115365 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026000 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: LanC like 1". Pristupljeno 20. 4. 2016.
^ "UniProt, O43813" (jezik: engleski). Pristupljeno 17. 11. 2021.

Dopunska literatura

Zhang W, Wang L, Liu Y, Xu J, Zhu G, Cang H, Li X, Bartlam M, Hensley K, Li G, Rao Z, Zhang XC (2009). "Structure of human lanthionine synthetase C-like protein 1 and its interaction with Eps8 and glutathione". Genes Dev. 23 (12): 1387–92. doi:10.1101/gad.1789209. PMC 2701572. PMID 19528316.

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000115365 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026000 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: LanC like 1". Pristupljeno 20. 4. 2016.

[UniProt-6] "UniProt, O43813" (jezik: engleski). Pristupljeno 17. 11. 2021.

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

[6]