Katepsin C

CTSC
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	4OEM, 1K3B, 2DJF, 2DJG, 3PDF, 4CDC, 4CDD, 4CDE, 4CDF, 4OEL
Identifikatori
Aliasi	CTSC, CPPI, DPP-I, DPP1, DPPI, HMS, JP, JPD, PALS, PDON1, PLS, katepsin C
Vanjski ID-jevi	OMIM: 602365 MGI: 109553 HomoloGene: 1373 GeneCards: CTSC
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 11 (čovjek)
Kraj	88,359,684 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 7 (miš)
Kraj	87,960,096 bp
Obrazac RNK ekspresije
	Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• peptidase activator activity involved in apoptotic process; • phosphatase binding; • cysteine-type peptidase activity; • chaperone binding; • protein self-association; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • vezivanje identičnih proteina; • chloride ion binding; • cysteine-type endopeptidase activity; • serine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity;
Ćelijska komponenta	• Golđijev aparat; • endoplasmic reticulum lumen; • membrana; • Endoplazmatski retikulum; • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle; • Lizozom; • Egzosom; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane; • Golđijeva membrana; • extracellular region; • Vanćelijsko; • nukleoplazma; • centrosom; • azurophil granule lumen; • intracellular membrane-bounded organelle; • collagen-containing extracellular matrix; • citoplazma;
Biološki proces	• GO:0010260 Starenje; • positive regulation of proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • positive regulation of apoptotic signaling pathway; • response to organic substance; • Proteoliza; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • COPII vesicle coating; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 Imuni odgovor; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • T cell mediated cytotoxicity; • GO:0097285 apoptoza; • neutrophil degranulation; • negative regulation of myelination; • positive regulation of microglial cell activation;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	1075
	13032
	ENSG00000109861
	ENSMUSG00000030560
	P53634
	P97821
	NM_148170; NM_001114173; NM_001814
	NM_009982; NM_001311790
	NP_001107645; NP_001805; NP_680475
	NP_001298719; NP_034112
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Katepsin C (CTSC) – poznat i kao dipeptidil peptidaza I (DPP-I) – je lizosomna egzocistein proteaza koja pripada familiji C1 peptidaza.^[5]^[6]^[7]^[8]^[9]

Kod čovjeka, kodirana je sa CTSC gena.^[10]^[11]

Funkcija uredi

Katepsin C se javlja kao centralni koordinator aktivacije mnogih serin proteaza u imuno/upalnim ćelijama. Katepsin C katalizira eksciziju dipeptida iz N-kraja proteinske i peptidne podloge, osim ako (1) je blokirana amino grupa N-kraja, (2) mjesto cijepanja na obje strane prolinskog ostatka ili je (3) ostatak N-kraja lizin ili arginin ili (4) struktura peptida ili proteina sprečava dalje razlaganje iz N-kraja

Struktura uredi

U cDNK kodiranju pacova, čovjeka, miša, goveda, psa, klonirana su dva shistosoma (kategorirana) katepsina Cs, koji pokazuju da je enzim vrlo očuvan. Za ljudski i pacovski katepsin C, cDNK kodira prekursor (prepro-katepsin C) koji se sastoji od signalnih peptida od 24 ostatka, pro-regije 205 (pacovski katepsin C ) ili 206 (ljudski katepsin C) ostataka i katalitske domene od 233 ostatka koji sadrže katalitske ostatke, te da ima 30-40% identičnih sekvenci zrelih aminokiselina papaina i niz drugih katepsina, uključujući i katepsine B, H, K i L i S.^[12]

Prevedeni prepro-katepsin C se obrađuje u zreli oblik u najmanje četiri podjele lanca polipeptida. Ovaj signalni peptid je uklonjen tokom translokacija ili lučenjem pro-enzima (pro-katepsina C) i velikog proregijskog fragmenta fragmenta N-kraja (poznat i kao domena isključenja), koji se zadržava u zrelom enzimu, odvojen od katalitiske domene ekscizijom (isijecanjem) nezrele pro-regija C-kraja, što se zove aktiviranje peptida. U rascjepu katalitske domene stvaraju se teški lanac od oko 164 ostatka i lahki, od oko 69 ostataka.

Za razliku od drugih članova papainske porodice, zreli katepsin C sastoji se od četiri podjedinice, od kojih je svaka sastavljen od N-kraja proregionskog fragmenta, teškoh i lahkog lanca. Pro-regije fragment i teškog lanca su glikozilirani. ^[13]^[14]^[15]

Također pogledajte uredi

Reference uredi

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000109861 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030560 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Cornish-Bowden A. (2004): Fundamentals of enzyme kinetics, 3rd Ed. Portland Press. ISBN 9781855781580; ISBN 1855781581.
^ Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6.
^ Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-1-8.
^ Graeme K. Hunter G. K. (2000): Vital Forces. The discovery of the molecular basis of life. Academic Press, London, ISBN 0-12-361811-8.
^ Nelson D. L., Michael M. Cox M. M. (2013): Lehninger Principles of Biochemistry. W. H. Freeman, 2013.ISBN 978-1-4641-0962-1.
^ "Entrez Gene: CTSC cathepsin C".
^ Paris A., Strukelj B., Pungercar J., Renko M., Dolenc I., Turk V. (august 1995). "Molecular cloning and sequence analysis of human preprocathepsin C". FEBS Letters. 369 (2–3): 326–30. doi:10.1016/0014-5793(95)00777-7. PMID 7649281.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)
^ Kominami E, Ishido K, Muno D, Sato N (juli 1992). "Primarna struktura i distribuciju tkiva katepsin C". Biological Chemistry Hoppe-Seyler. 373 (7): 367–73. doi:10.1515/bchm3.1992.373.2.367. PMID 1515062.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link).
^ Hola-Jamriska L, Tort JF, Dalton JP, Day SR, Fan J, Aaskov J, Brindley PJ (august 1998). "Cathepsin C from Schistosoma japonicum--cDNA encoding the preproenzyme and its phylogenetic relationships". European Journal of Biochemistry / FEBS. 255 (3): 527–34. doi:10.1046/j.1432-1327.1998.2550527.x. PMID 9738890.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)
^ Kominami E, Ishido K, Muno D, Sato N (juli 1992). "The primary structure and tissue distribution of cathepsin C". Biological Chemistry Hoppe-Seyler. 373 (7): 367–73. doi:10.1515/bchm3.1992.373.2.367. PMID 1515062.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)
^ Turk D, Janjić V, Stern I, Podobnik M, Lamba D, Dahl SW, Lauritzen C, Pedersen J, Turk V, Turk B (decembar 2001). "Structure of human dipeptidyl peptidase I (cathepsin C): exclusion domain added to an endopeptidase framework creates the machine for activation of granular serine proteases". The EMBO Journal. 20 (23): 6570–82. doi:10.1093/emboj/20.23.6570. PMC 125750. PMID 11726493.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)

Vanjski linkovi uredi

Cathepsin na Wikimedia Commonsu.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000109861 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030560 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[5] Cornish-Bowden A. (2004): Fundamentals of enzyme kinetics, 3rd Ed. Portland Press. ISBN 9781855781580; ISBN 1855781581.

[6] Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6.

[7] Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-1-8.

[8] Graeme K. Hunter G. K. (2000): Vital Forces. The discovery of the molecular basis of life. Academic Press, London, ISBN 0-12-361811-8.

[9] Nelson D. L., Michael M. Cox M. M. (2013): Lehninger Principles of Biochemistry. W. H. Freeman, 2013.ISBN 978-1-4641-0962-1.

[entrez-10] "Entrez Gene: CTSC cathepsin C".

[pmid7649281-11] Paris A., Strukelj B., Pungercar J., Renko M., Dolenc I., Turk V. (august 1995). "Molecular cloning and sequence analysis of human preprocathepsin C". FEBS Letters. 369 (2–3): 326–30. doi:10.1016/0014-5793(95)00777-7. PMID 7649281.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)

[pmid1515062-12] Kominami E, Ishido K, Muno D, Sato N (juli 1992). "Primarna struktura i distribuciju tkiva katepsin C". Biological Chemistry Hoppe-Seyler. 373 (7): 367–73. doi:10.1515/bchm3.1992.373.2.367. PMID 1515062.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link).

[pmid9738890-13] Hola-Jamriska L, Tort JF, Dalton JP, Day SR, Fan J, Aaskov J, Brindley PJ (august 1998). "Cathepsin C from Schistosoma japonicum--cDNA encoding the preproenzyme and its phylogenetic relationships". European Journal of Biochemistry / FEBS. 255 (3): 527–34. doi:10.1046/j.1432-1327.1998.2550527.x. PMID 9738890.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)

[14] Kominami E, Ishido K, Muno D, Sato N (juli 1992). "The primary structure and tissue distribution of cathepsin C". Biological Chemistry Hoppe-Seyler. 373 (7): 367–73. doi:10.1515/bchm3.1992.373.2.367. PMID 1515062.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)

[pmid11726493-15] Turk D, Janjić V, Stern I, Podobnik M, Lamba D, Dahl SW, Lauritzen C, Pedersen J, Turk V, Turk B (decembar 2001). "Structure of human dipeptidyl peptidase I (cathepsin C): exclusion domain added to an endopeptidase framework creates the machine for activation of granular serine proteases". The EMBO Journal. 20 (23): 6570–82. doi:10.1093/emboj/20.23.6570. PMC 125750. PMID 11726493.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[1]

[2]

[3]

[4]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]