GTPBP4

Jedarcetov GTP-vezujući protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom GTPBP4.

GTPBP4
Identifikatori
Aliasi	GTPBP4
Vanjski ID-jevi	MGI: 1916487 HomoloGene: 7100 GeneCards: GTPBP4
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 10 (čovjek) Bend 10p15.3 Početak 988,434 bp Kraj 1,019,932 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 13 (miš) Bend 13|13 A1 Početak 9,016,367 bp Kraj 9,046,119 bp
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • GO:0006184 GTPase activity • vezivanje sa RNK Ćelijska komponenta • citoplazma • Golđijev aparat • Jedarna membrana • membrana • Jedarce • perinuklearno područje citoplazme • jedro • citosol Biološki proces • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • ribosome biogenesis • negative regulation of cell-cell adhesion • protein stabilization • negative regulation of DNA replication • negative regulation of protein ubiquitination • negative regulation of cell migration • osteoblast differentiation • negative regulation of collagen binding • negative regulation of cell population proliferation • maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	23560	69237
Ensembl	ENSG00000107937	ENSMUSG00000021149
UniProt	Q9BZE4	Q99ME9
RefSeq (mRNK)	NM_012341	NM_027000
RefSeq (bjelančevina)	NP_036473	NP_081276
Lokacija (UCSC)	Chr 10: 0.99 – 1.02 Mb	Chr 13: 9.02 – 9.05 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 634 aminokiseline, а molekulska težina 73.964 Da.

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MAHYNFKKIT		VVPSAKDFID		LTLSKTQRKT		PTVIHKHYQI		HRIRHFYMRK
VKFTQQNYHD		RLSQILTDFP		KLDDIHPFYA		DLMNILYDKD		HYKLALGQIN
IAKNLVDNVA		KDYVRLMKYG		DSLYRCKQLK		RAALGRMCTV		IKRQKQSLEY
LEQVRQHLSR		LPTIDPNTRT		LLLCGYPNVG		KSSFINKVTR		ADVDVQPYAF
TTKSLFVGHM		DYKYLRWQVV		DTPGILDHPL		EDRNTIEMQA		ITALAHLRAA
VLYVMDLSEQ		CGHGLREQLE		LFQNIRPLFI		NKPLIVVANK		CDVKRIAELS
EDDQKIFTDL		QSEGFPVIET		STLTEEGVIK		VKTEACDRLL		AHRVETKMKG
NKVNEVLNRL		HLAIPTRRDD		KERPPFIPEG		VVARRKRMET		EESRKKRERD
LELEMGDDYI		LDLQKYWDLM		NLSEKHDKIP		EIWEGHNIAD		YIDPAIMKKL
EELEKEEELR		TAAGEYDSVS		ESEDEEMLEI		RQLAKQIREK		KKLKILESKE
KNTQGPRMPR		TAKKVQRTVL		EKEMRSLGVD		MDDKDDAHYA		VQARRSRSIT
RKRKREDSAP		PSSVARSGSC		SRTPRDVSGL		RDVKMVKKAK		TMMKNAQKKM
NRLGKKGEAD		RHVFDMKPKH		LLSGKRKAGK		KDRR

Funkcija

GTPaze funkcioniraju kao molekulni prekidači koji se mogu prebacivati između dva stanja: aktivno, kada je GTP vezan, i neaktivno, kada je vezan BDP. 'Aktivno' obično znači da molekula djeluje kao signal za pokretanje drugih događaja u ćeliji. Kad se vanćelijski ligand veže za G-protein spregnuti receptor, receptor mijenja svoju konformaciju i uključuje trimerne G-proteine, koji se povezuju s njim, izazivajući ih da izbace svoj BDP i zamijene ga GTP-om. Prekidač se isključuje kada G-protein hidrolizira svoj vezani GTP, pretvarajući ga nazad u BDP. No, prije nego što se to dogodi, aktivni protein ima priliku difundirati dalje od receptora i prenositi svoju poruku na duži period do svog nizvodnog cilja.

Dopunska literatura

• Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
• Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2003). "Functional proteomic analysis of human nucleolus". Mol. Biol. Cell. 13 (11): 4100–9. doi:10.1091/mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
• Lee H, Kim D, Dan HC, et al. (2007). "Identification and characterization of putative tumor suppressor NGB, a GTP-binding protein that interacts with the neurofibromatosis 2 protein". Mol. Cell. Biol. 27 (6): 2103–19. doi:10.1128/MCB.00572-06. PMC 1820506. PMID 17210637.
• Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.