GSDMB

Gasdermin B jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GSDMB sa hromosoma 17.

GSDMB
Identifikatori
Aliasi	GSDMB
Vanjski ID-jevi	OMIM: 611221 HomoloGene: 88856 GeneCards: GSDMB
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 17 (čovjek) Bend 17q21.1 Početak 39,904,595 bp Kraj 39,919,854 bp
Ontologija gena Molekularna funkcija • molekularna funkcija • phosphatidylserine binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-4-phosphate binding Ćelijska komponenta • citoplazma • citosol • ćelijska membrana • membrana • ćelijska komponenta Biološki proces • GO:0010703, GO:0010702 programirana ćelijska smrt • GO:0022610 biološki proces • Piroptoza Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	55876	n/a
Ensembl	ENSG00000073605	n/a
UniProt	Q8TAX9	n/a
RefSeq (mRNK)	NM_001042471 NM_001165958 NM_001165959 NM_018530 NM_001369402	n/a
RefSeq (bjelančevina)	NP_001035936 NP_001159430 NP_001159431 NP_061000 NP_001356331	n/a
Lokacija (UCSC)	Chr 17: 39.9 – 39.92 Mb	n/a
PubMed pretraga		n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 411 aminokiselina, a molekulska težina 46.786 Da.

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MFSVFEEITR		IVVKEMDAGG		DMIAVRSLVD		ADRFRCFHLV		GEKRTFFGCR
HYTTGLTLMD		ILDTDGDKWL		DELDSGLQGQ		KAEFQILDNV		DSTGELIVRL
PKEITISGSF		QGFHHQKIKI		SENRISQQYL		ATLENRKLKR		ELPFSFRSIN
TRENLYLVTE		TLETVKEETL		KSDRQYKFWS		QISQGHLSYK		HKGQREVTIP
PNRVLSYRVK		QLVFPNKETM		SAGLDIHFRG		KTKSFPEGKS		LGSEDSRNMK
EKLEDMESVL		KDLTEEKRKD		VLNSLAKCLG		KEDIRQDLEQ		RVSEVLISGE
LHMEDPDKPL		LSSLFNAAGV		LVEARAKAIL		DFLDALLELS		EEQQFVAEAL
EKGTLPLLKD		QVKSVMEQNW		DELASSPPDM		DYDPEARILC		ALYVVVSILL
ELAEGPTSVS		S

Funkcija

Ovaj gen kodira člana porodice proteina koji sadrži gasderminski domen. Drugi geni iz porodice gasdermina uključeni su u regulaciju apoptoze u epitelnim ćelijama i povezani su sa rakom. Za ovaj gen je pronađeno više varijanti transkripta koje kodiraju različite izoforme. Opisane su dodatne varijante, ali one su kandidati za besmisleno posredovano raspadanje iRNK (NMD) i malo je vjerovatno da će kodirati proteine.

Dopunska literatura

• Katoh M, Katoh M (2004). "Evolutionary recombination hotspot around GSDML-GSDM locus is closely linked to the oncogenomic recombination hotspot around the PPP1R1B-ERBB2-GRB7 amplicon". Int. J. Oncol. 24 (4): 757–63. doi:10.3892/ijo.24.4.757. PMID 15010812.

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.