FAM114A2 otvoreni okvir čitanja 3 hromosoma 5 jest gen na koji kod ljudi kodira protein FAM114A2. Funkcija proteina nije dobro poznata. FAM114A2 je, međutim, visoko konzerviran kod sisara s homolozima i u gljiva i u biljaka.

FAM114A2
Identifikatori
AliasiFAM114A2
Vanjski ID-jeviMGI: 1917629 HomoloGene: 10270 GeneCards: FAM114A2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za FAM114A2
Genomska lokacija za FAM114A2
Bend5q33.2Početak153,990,148 bp[1]
Kraj154,038,936 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za FAM114A2
Genomska lokacija za FAM114A2
Bend11|11 B1.3Početak57,373,819 bp[2]
Kraj57,409,443 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija purine nucleotide binding
Ćelijska komponenta ćelijska komponenta
Biološki proces GO:0022610 biološki proces
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_018691
NM_001317993
NM_001317994
NM_001317995

NM_001168667
NM_001168668
NM_026342

RefSeq (bjelančevina)

NP_001304922
NP_001304923
NP_001304924
NP_061161

NP_001162138
NP_001162139
NP_080618

Lokacija (UCSC)Chr 5: 153.99 – 154.04 MbChr 11: 57.37 – 57.41 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 505 aminokiselina, а molekulska težina 55.468 Da.[5]

1020304050
MSDKDDIETPLLTEAAPILEDGNCEPAKNSESVDQGAKPESKSEPVVSTR
KRPETKPSSDLETSKVLPIQDNVSKDVPQTRWGYWGSWGKSILSSASATV
ATVGQGISNVIEKAETSLGIPGPSEISTEVKYVAGETNAKENENSSPVAG
AFGVFSTISTAVQSTGKSVISGGLDALEFIGKKTMDVIAEGDPGFKRTKG
LMNRNATLSQVLREAKEKEEIRTSNEVTVETDKKTHYGLLFDEFQGLSHL
EALEMLSQESEIKVKSILNSLSGEELETLKVELEQLKETFSLAEFCEEEE
EEKKGDEDFTKDITELFSQLHVSSKPEKLARARNTAHEWIRKSLTKPLAE
NEEGEKQSEAENTEQVNKNSIEDIHAFAIRSLAELTACSIELFHKTAALV
LHGRKQEVTAIERSQTLSQMTIVLCKELSSLSKEFTTCLTTAGVKEMADV
LNPLITAVFLEASNSASYIQDAFQLLLPVLEISLIENKIESHRHELQGQK
PLLEH

Gen uredi

Gen FAM114A2 nalazi se na hromosomu 5, sekvenca 5q31–33).[6] Ovaj gen ima 14 egzona koji se protežu kroz njegovu sekvencu. Kodirajuća sekvenca duga je 2.886 baznih parova sa 5 'UTR od 94 bazna para i 3' UTR od 1.273 parova baza.[7] Elsprimira se na visokim nivoima u većini ljudskih tkiva.[6] Također je izrazito eksprimira i u tkivima ljudskog mozga.[8]

Protein uredi

Protein FAM114A2 dug je 505 aminokiselina[7] sa molekulskom težinom od 55,5 kdal i izoelektričnom tačkom od 4,66.[9] It is predicted to stay in the nucleus after translation [10] Postoje dokazi da c5orf3 stupa u interakciju s drugim proteinom nepoznate funkcije iz hromosoma 5, c5orf4.[11] Smatra se da ovaj protein uključuje P-petlju [12] što ukazuje na ulogu u vezanju ATP i/ili GTP.[13]

Vrsta Pristupni broj Identitet
Macaca mulatta XM_001102467 78,1%
Pan troglodytes XM_518045 89,7%
Bos taurus NP_001033166 85,6%
Pongo abelii XM_002816109 87,8%
Mus musculus NM_026342.3 79%
Callithrix jacchus XP_002744467 94,7%

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000055147 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020523 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "UniProt, Q9NRY5" (jezik: engleski). Pristupljeno 13. 10. 2021.
  6. ^ a b FAM114A2 Gene - GeneCards | F1142 Protein | F1142 Antibody
  7. ^ a b Homo sapiens family with sequence similarity 114, member A2 (FAM114A2) - Nucleotide - NCBI
  8. ^ Allen Brain Atlas: http://human.brain-map.org/search?type=mi Arhivirano 18. 8. 2011. na Wayback Machine
  9. ^ Biology workbench: http://seqtool.sdsc.edu/CGI/BW.cgi# Arhivirano 11. 8. 2003. na Wayback Machine!
  10. ^ PSORT WWW Server
  11. ^ STRING: http://string-db.org/newstring_cgi/show_network_section.pl.
  12. ^ "STRING: Functional protein association networks".
  13. ^ Saraste M, Sibbald PR, Wittinghofer A (novembar 1990). "The P-loop--a common motif in ATP- and GTP-binding proteins". Trends Biochem. Sci. 15 (11): 430–4. doi:10.1016/0968-0004(90)90281-f. PMID 2126155.

Dopunska literatura uredi

Vanjski linkovi uredi