Cisteinom bogati protein 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom CRIP2.[5][6][7][8]

CRIP2
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2CU8

Identifikatori
AliasiCRIP2
Vanjski ID-jeviOMIM: 601183 MGI: 1915587 HomoloGene: 135666 GeneCards: CRIP2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 14 (čovjek)
Hrom.Hromosom 14 (čovjek)[1]
Hromosom 14 (čovjek)
Genomska lokacija za CRIP2
Genomska lokacija za CRIP2
Bend14q32.33Početak105,472,962 bp[1]
Kraj105,480,162 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 12 (miš)
Hrom.Hromosom 12 (miš)[2]
Hromosom 12 (miš)
Genomska lokacija za CRIP2
Genomska lokacija za CRIP2
Bend12 F1|12 61.57 cMPočetak113,103,856 bp[2]
Kraj113,109,126 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje iona metala
vezivanje iona cinka
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta cell cortex
Biološki proces positive regulation of cell population proliferation
Hematopoeza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001270837
NM_001270841
NM_001312

NM_024223
NM_001347443

RefSeq (bjelančevina)

NP_001257766
NP_001257770
NP_001303

NP_001334372
NP_077185

Lokacija (UCSC)Chr 14: 105.47 – 105.48 MbChr 12: 113.1 – 113.11 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Tsui et al. (1996) locirali su gen CRIP2 na hromosomsku poziciju 14q32, primjenom fluorescentne in situ hibridizacije (FISH).[9] Analizom somatskih hibridnih ćelija i FISH-metoda, Karim et al. (1996) mapirali su gen CRIP2 na poziciji 14q32.3.[10] CRIP2 i usko povezani CRIP1 su proteini bogati cisteinom i sadrže po dva LIM-domena. Visoko su eksprimirani tokom kardiovaskularnog razvoja i djeluju na premošćavanje faktora serumskog odgovora i GATA i stimuliraju ciljne gene glatkih mišića.[11]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 208 aminokiselina, a molekulska težina 22.493 Da.[12].

1020304050
MASKCPKCDKTVYFAEKVSSLGKDWHKFCLKCERCSKTLTPGGHAEHDGK
PFCHKPCYATLFGPKGVNIGGAGSYIYEKPLAEGPQVTGPIEVPAARAEE
RKASGPPKGPSRASSVTTFTGEPNTCPRCSKKVYFAEKVTSLGKDWHRPC
LRCERCGKTLTPGGHAEHDGQPYCHKPCYGILFGPKGVNTGAVGSYIYDR
DPEGKVQP
Simboli

Kloniranje i ekspresija

uredi

Skriningom niske strogosti ljudske biblioteke cDNK tankog crijeva cDNK bogatim cisteinom (CRIP1) cDNK, gorepomenuti Karim et al (1996) izolirali su cDNK koja kodira CRIP2, koju su nazvali ESP1/CRP2. cDNK predviđa protein od 208 aminokiselina koji sadrži dva LIM-domena. CRIP2 dijeli 93% identiteta aminokiselinske sekvence sa svojim homologom kod pacova, zvanim Esp1 ili Crp2. Northern blot analiza pokazala je široko rasprostranjenu tkivnu ekspresiju CRIP2 iRNK od 1,3 kb, s najvišim nivoom ekspresije u srcu. Također otkrivena je o druga kRNK u sjemenicima, od 1,7 kb.

Tsui et al. (1996) klonirali su cDNK ljudskog srca koja kodira CRIP2 i nazvali je CRP2. CRIP2 je 38%, odnosno 35% identičan proteinima CSRP1 i CSRP3.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000182809 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000006356 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Tsui SK, Chan PP, Cheuk CW, Liew CC, Waye MM, Fung KP, Lee CY (Feb 1997). "A novel cDNA encoding for a LIM domain protein located at human chromosome 14q32 as a candidate for leukemic translocation". Biochem Mol Biol Int. 39 (4): 747–54. PMID 8843343.
  6. ^ Karim MA, Ohta K, Egashira M, Jinno Y, Niikawa N, Matsuda I, Indo Y (januar 1996). "Human ESP1/CRP2, a member of the LIM domain protein family: characterization of the cDNA and assignment of the gene locus to chromosome 14q32.3". Genomics. 31 (2): 167–76. doi:10.1006/geno.1996.0028. PMID 8824798.
  7. ^ Huber A, Neuhuber WL, Klugbauer N, Ruth P, Allescher HD (Mar 2000). "Cysteine-rich protein 2, a novel substrate for cGMP kinase I in enteric neurons and intestinal smooth muscle". J Biol Chem. 275 (8): 5504–11. doi:10.1074/jbc.275.8.5504. PMID 10681529.
  8. ^ "Entrez Gene: CRIP2 cysteine-rich protein 2".
  9. ^ Tsui, S. K. W., Chan, P. P. K., Cheuk, C. W., Liew, C. C., Waye, M. M. Y., Fung, K. P., Lee, C. Y. A novel cDNA encoding for a LIM domain protein located at human chromosome 14q32 as a candidate for leukemic translocation. Biochem. Molec. Biol. Int. 39: 747-754, 1996. PubMed: 8843343
  10. ^ Karim, M. A., Ohta, K., Egashira, M., Jinno, Y., Niikawa, N., Matsuda, I., Indo, Y. Human ESP1/CRP2, a member of the LIM domain protein family: characterization of the cDNA and assignment of the gene locus to chromosome 14q32.3. Genomics 31: 167-176, 1996. PubMed: 8824798
  11. ^ Chang DF, Belaguli NS, Iyer D, Roberts WB, Wu SP, Dong XR, Marx JG, Moore MS, Beckerle MC, Majesky MW, Schwartz RJ (januar 2003). "Cysteine-rich LIM-only proteins CRP1 and CRP2 are potent smooth muscle differentiation cofactors". Dev. Cell. 4 (1): 107–18. doi:10.1016/S1534-5807(02)00396-9. PMID 12530967.
  12. ^ "UniProt, P52943". Pristupljeno 22. 7. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi