CLCN porodica gena hloridnih kanala ovisnih o naponu sastoji se od devet članova (CLCN1-7, Ka i Kb) koji pokazuju prilično različite funkcionalne karakteristike, dok dijele značajnu homologiju sekvence. Protein kodiran ovim genom reguliše električnu ekscitabilnost membrane skeletnih mišića. Kod ljudi, gen CLCN nalazi se na hromosomu 7. Mutacije ovog gena uzrokuju dva oblika nasljednih poremećaja ljudskih mišića: recesivnu generaliziranu miotonia congenita (Becker) i dominantnu miotoniju (Thomsen).).[5]

CLCN1
Identifikatori
AliasiCLCN1
Vanjski ID-jeviOMIM: 118425 MGI: 88417 HomoloGene: 63 GeneCards: CLCN1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za CLCN1
Genomska lokacija za CLCN1
Bend7q34Početak143,316,111 bp[1]
Kraj143,352,083 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za CLCN1
Genomska lokacija za CLCN1
Bend6 B2.1|6 20.57 cMPočetak42,263,619 bp[2]
Kraj42,292,690 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein homodimerization activity
voltage-gated ion channel activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
chloride channel activity
voltage-gated chloride channel activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
membrana
ćelijska membrana
integral component of plasma membrane
chloride channel complex
Sarkolema
Biološki proces Mišićna kontrakcija
regulation of ion transmembrane transport
chloride transmembrane transport
ion transport
ion transmembrane transport
neuronal action potential propagation
chloride transport
transmembrane transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_000083

NM_013491
NM_001363712

RefSeq (bjelančevina)

NP_000074

NP_038519
NP_001350641

Lokacija (UCSC)Chr 7: 143.32 – 143.35 MbChr 6: 42.26 – 42.29 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 988 aminokiselina, a molekulska težina 108.626 Da.[5]

1020304050
MEQSRSQQRGGEQSWWGSDPQYQYMPFEHCTSYGLPSENGGLQHRLRKDA
GPRHNVHPTQIYGHHKEQFSDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQ
DCIHRLGQVVRRKLGEDGIFLVLLGLLMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSY
AQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCHLISPQAVGSGIPEMKTILRG
VVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVLSKFM
SVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVR
NYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPA
FAAIGICCGLLGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFV
IASFTFPPGMGQFMAGELMPREAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWI
HPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGE
IMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVSTAVICFELT
GQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSK
YTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLG
SVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGA
PPGRPESFAFVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPG
HKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPE
EIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGLHLAY
VTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAP
PSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGE
LEELELVESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL

Funkcija

uredi

Protein hloridnog kanala skeletnih mišića (CLCN1) je protein koji je kod ljudi kodiran genom CLCN1.[6] Mutacije u ovom proteinu uzrokuju poremećaj zvani myotonia congenita.

CLCN1 je kritičan za normalnu funkciju ćelija skeletnih mišića. Da bi se tijelo moglo normalno kretati, skeletni mišići moraju se napregnuti (kontrahirati) i opustiti na koordiniran način. Kontrakcija i relaksacija mišića kontrolišu se protokom iona u i iz mišićnih ćelija. CLCN1 formira ionski kanal koji kontrolira protok negativno nabijenih hloridnih iona u ove ćelije. Glavna funkcija ovog kanala je da stabilizuje električni naboj ćelija, omogućavajući mišićima da se normalno kontrahuju.

Kod ljudi s kongenitalnom miotonijom, zbog mutacije u CLCN1, ionski kanal propušta premalo kloridnih iona u ćeliju. Ovaj nedostatak hloridnih iona uzrokuje produžene kontrakcije mišića, koje su obilježje miotonija.

Također pogledajte

uredi

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000188037 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029862 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: CLCN1 chloride channel 1, skeletal muscle (Thomsen disease, autosomal dominant)".
  6. ^ Koch MC, Steinmeyer K, Lorenz C, Ricker K, Wolf F, Otto M, Zoll B, Lehmann-Horn F, Grzeschik KH, Jentsch TJ (Sep 1992). "The skeletal muscle chloride channel in dominant and recessive human myotonia". Science. 257 (5071): 797–800. Bibcode:1992Sci...257..797K. doi:10.1126/science.1379744. PMID 1379744.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.