CCDC25

Protein sa upredenom zavojnicom–25 (CCDC25) je ljudski protein čija funkcija još uvijek nije jasno određena.

CCDC25
Identifikatori
Aliasi	CCDC25
Vanjski ID-jevi	MGI: 1914429 HomoloGene: 6645 GeneCards: CCDC25
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 8 (čovjek) Bend 8p21.1 Početak 27,733,316 bp Kraj 27,772,653 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 14 (miš) Bend 14|14 D1 Početak 66,074,751 bp Kraj 66,104,056 bp
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	55246	67179
Ensembl	ENSG00000147419	ENSMUSG00000022035
UniProt	Q86WR0	Q78PG9
RefSeq (mRNK)	NM_001304529 NM_001304530 NM_001304532 NM_018246	NM_145944
RefSeq (bjelančevina)	NP_001291458 NP_001291459 NP_001291461 NP_060716	NP_666056
Lokacija (UCSC)	Chr 8: 27.73 – 27.77 Mb	Chr 14: 66.07 – 66.1 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 208 aminokiselina, а molekulska težina 24.479 Da.

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MVFYFTSSSV		NSSAYTIYMG		KDKYENEDLI		KHGWPEDIWF		HVDKLSSAHV
YLRLHKGENI		EDIPKEVLMD		CAHLVKANSI		QGCKMNNVNV		VYTPWSNLKK
TADMDVGQIG		FHRQKDVKIV		TVEKKVNEIL		NRLEKTKVER		FPDLAAEKEC
RDREERNEKK		AQIQEMKKRE		KEEMKKKREM		DELRSYSSLM		KVENMSSNQD
GNDSDEFM

Gen

Gen koji kodira protein CCDC25 nalazi se na lokusu 8p21.1, na kratkom kraku hromosoma 8, i transkribira se u proizvod iRNK približne dužine 3.583 nukleotida.

Protein

Opća svojstva

Protein je visoko konzerviran među sisarima kao i eukariotima, tako raznolikim kao što je Arabidopsis thaliana. CCDC25 sastoji se od jednog polipeptidnog lanca dužine 208 aminokiselina i eksprimiran je na visokom nivou, skoro 4,2 puta većem od prosječnog ljudskog proteina. Njegova ekspresija je gotovo sveprisutna u ljudskim tkivima, s malim naznakama da se njegov nivo ekspresije drastično mijenja u oboljelim tkivima. Unatoč tome što još nema dobro razumljivu funkciju, predviđa se da se CCDC25 n alazi u jedru i pokazano je mikromrežnim eksperimentom da se regulira u metafazi II oocita.

Interakcije

CCDC25 je pokazao da stupa u interakciju dvohibridni kvascem, test sa SMAD2, latentnim transkripcijskim faktorom koji je dio TGF-β signalnog puta. Protein je predviđeni supstrat kazein-kinaze 1, kazein-kinaze 2, cGMP zavisne protein-kinaze i insulinskog receptora ; svi oni imaju dobro definirane uloge u ćelijskoj signalizaciji.

Dopunska literatura

• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
• Rose JE, Behm FM, Drgon T, et al. (2010). "Personalized smoking cessation: interactions between nicotine dose, dependence and quit-success genotype score". Mol. Med. 16 (7–8): 247–53. doi:10.2119/molmed.2009.00159. PMC 2896464. PMID 20379614.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, et al. (2004). "Phosphoproteomic analysis of the developing mouse brain". Mol. Cell. Proteomics. 3 (11): 1093–101. doi:10.1074/mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
• Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.