Mitohondrijska podjedinica beta 2-oksoizovalerat-dehidrogenaze jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom BCKDHB.[5]

BCKDHB
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1DTW, 1OLS, 1OLU, 1OLX, 1U5B, 1V11, 1V16, 1V1M, 1V1R, 1WCI, 1X7W, 1X7X, 1X7Y, 1X7Z, 1X80, 2BEU, 2BEV, 2BEW, 2BFB, 2BFC, 2BFD, 2BFE, 2BFF, 2J9F

Identifikatori
AliasiBCKDHB
Vanjski ID-jeviOMIM: 248611 MGI: 88137 HomoloGene: 39 GeneCards: BCKDHB
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za BCKDHB
Genomska lokacija za BCKDHB
Bend6q14.1Početak80,106,647 bp[1]
Kraj80,346,270 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za BCKDHB
Genomska lokacija za BCKDHB
Bend9|9 E2Početak83,807,198 bp[2]
Kraj84,006,293 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija oxidoreductase activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (2-methylpropanoyl-transferring) activity
catalytic activity
Ćelijska komponenta mitochondrial matrix
mitochondrial alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex
mitohondrija
Biološki proces metabolizam
branched-chain amino acid catabolic process
response to nutrient
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_000056
NM_183050
NM_001318975

NM_199195
NM_001305935

RefSeq (bjelančevina)

NP_000047
NP_001305904
NP_898871

NP_001292864
NP_954665

Lokacija (UCSC)Chr 6: 80.11 – 80.35 MbChr 9: 83.81 – 84.01 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 392 aminokiseline, а molekulska težina 43 122 Da.[6]

1020304050
MAVVAAAAGWLLRLRAAGAEGHWRRLPGAGLARGFLHPAATVEDAAQRRQ
VAHFTFQPDPEPREYGQTQKMNLFQSVTSALDNSLAKDPTAVIFGEDVAF
GGVFRCTVGLRDKYGKDRVFNTPLCEQGIVGFGIGIAVTGATAIAEIQFA
DYIFPAFDQIVNEAAKYRYRSGDLFNCGSLTIRSPWGCVGHGALYHSQSP
EAFFAHCPGIKVVIPRSPFQAKGLLLSCIEDKNPCIFFEPKILYRAAAEE
VPIEPYNIPLSQAEVIQEGSDVTLVAWGTQVHVIREVASMAKEKLGVSCE
VIDLRTIIPWDVDTICKSVIKTGRLLISHEAPLTGGFASEISSTVQEECF
LNLEAPISRVCGYDTPFPHIFEPFYIPDKWKCYDALRKMINY

Funkcija

uredi

Dehidrogenaza keto kiseline s razgranatim lancem je multienzimski kompleks povezan sa unutrašnjom mitohondrijskom membranom, a funkcionira u katabolizmu aminokiselina razgranatog lanca. Kompleks se sastoji od više kopija tri komponente: dekarboksilaze razgranatog lanca alfa-keto kiseline (E1), lipoamid aciltransferaze (E2) i lipoamid dehidrogenaze (E3). Ovaj gen kodira podjedinicu E1 beta, a njegove mutacije su povezane s bolest mokraće s mirisom javorovog sirupa (MSUD), tip 1B. Alternativna prerada na ovom mjestu rezultira varijantama transkripta s tri različita nekodirajuća područja, ali kodiraju iste izoforme.[5]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000083123 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032263 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: BCKDHB branched chain keto acid dehydrogenase E1, beta polypeptide (maple syrup urine disease)".
  6. ^ "UniProt, P21953" (jezik: engleski). Pristupljeno 6. 10. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi

Šablon:Aldehid/Okso-oksidoreduktaze