A lanac koagulacijskog faktora XIII

A lanac koagulacijskog faktora XIII je protein koji je kod ljudi kodiran genom F13A1 sa hromosoma 6.

F13A1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1EVU, 1EX0, 1F13, 1FIE, 1GGT, 1GGU, 1GGY, 1QRK, 4KTY

Identifikatori
AliasiF13A1
Vanjski ID-jeviOMIM: 134570 MGI: 1921395 HomoloGene: 20077 GeneCards: F13A1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za F13A1
Genomska lokacija za F13A1
Bend6p25.1Početak6,144,084 bp[1]
Kraj6,321,013 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za F13A1
Genomska lokacija za F13A1
Bend13|13 A3.3Početak37,051,152 bp[2]
Kraj37,234,220 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein-glutamine gamma-glutamyltransferase activity
acyltransferase activity
vezivanje iona metala
aktivnost sa transferazom
Ćelijska komponenta citoplazma
platelet alpha granule lumen
blood microparticle
extracellular region
collagen-containing extracellular matrix
Biološki proces GO:0051357, GO:0051358, GO:0051359 peptide cross-linking
blood coagulation, fibrin clot formation
platelet degranulation
Hemostaza
Koagulacija (krv)
cytokine-mediated signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_000129

NM_001166391
NM_028784

RefSeq (bjelančevina)

NP_000120

NP_001159863
NP_083060

Lokacija (UCSC)Chr 6: 6.14 – 6.32 MbChr 13: 37.05 – 37.23 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 102 aminokiseline, a molekulska težina 11 262 — Da .[5]

1020304050
XAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPA
RIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWYPSIPAAGMSPK
SA

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira podjedinicu A faktor koagulacije XIII . Koagulacijski faktor XIII je posljednji zimogen koji se aktivira u kaskadi koagulacije krvi. Faktor plazme XIII je heterotetramer sastavljen od po dvije A i 2 B podjedinice. A podjedinice imaju katalitsku funkciju, a B podjedinice nemaju enzimsku aktivnost i mogu služiti kao molekulski nosači plazme. Faktor trombocita XIII sastoji se od samo dvije A podjedinice, koje su identične onima iz plazme. Nakon cijepanja aktivacionog peptida trombinom i u prisustvu iona kalcija, faktor u plazmi XIII razdvoji svoje B podjedinice i daje isti aktivni enzim, faktor XIIIa, kao trombocitni faktor XIII. Ovaj enzim djeluje kao transglutaminaza da katalizuje stvaranje umreženog gama-glutamil-epsilon-lizina između molekula fibrina, čime se stabilizira fibrinski ugrušak. Također povezuje inhibitor alfa-2-plazmina, ili fibronektin, sa alfa lancima fibrina. Nedostatak faktora XIII je klasifikovan u dvije kategorije: nedostatak tipa I, karakteriziran nedostatkom i A i B podjedinica i nedostatak tipa II, karakteriziran nedostatkom same A podjedinice. Ovi defekti mogu dovesti do doživotne sklonosti krvarenju, neispravnog zacjeljivanja rana i uobičajenog pobačaja.[6]

Interakcije

uredi

Pokazalo se da polipeptid faktora koagulacije XIII, A1 reaguje sa F13B.[7][8]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124491 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039109 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "UniProt, H0Y4W5" (jezik: engleski). Arhivirano s originala, 30 -09- 2021. Pristupljeno 20-11- 2017. Provjerite vrijednost datuma u parametru: |access-date= i |archive-date= (pomoć)
  6. ^ "Entrez Gene: F13A1 coagulation factor XIII, A1 polypeptide".
  7. ^ Carrell NA, Erickson HP, McDonagh J (Jan 1989). "Electron microscopy and hydrodynamic properties of factor XIII subunits". J. Biol. Chem. 264 (1): 551–6. doi:10.1016/S0021-9258(17)31294-2. PMID 2491853.
  8. ^ Achyuthan KE, Rowland TC, Birckbichler PJ, Lee KN, Bishop PD, Achyuthan AM (Sep 1996). "Hierarchies in the binding of human factor XIII, factor XIIIa, and endothelial cell transglutaminase to human plasma fibrinogen, fibrin, and fibronectin". Mol. Cell. Biochem. 162 (1): 43–9. doi:10.1007/bf00250994. PMID 8905624. S2CID 23583301.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi