Unc-13 homolog C (C. elegans) je protein koji je kod ljudi kodiran genom UNC13C.[5]

UNC13C
Identifikatori
AliasiUNC13C
Vanjski ID-jeviOMIM: 614568 MGI: 2149021 HomoloGene: 45443 GeneCards: UNC13C
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 15 (čovjek)
Hrom.Hromosom 15 (čovjek)[1]
Hromosom 15 (čovjek)
Genomska lokacija za UNC13C
Genomska lokacija za UNC13C
Bend15q21.3Početak53,978,201 bp[1]
Kraj54,628,707 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za UNC13C
Genomska lokacija za UNC13C
Bend9 D|9 40.8 cMPočetak73,386,704 bp[2]
Kraj73,876,248 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija diacylglycerol binding
vezivanje iona metala
calcium ion binding
phospholipid binding
calmodulin binding
syntaxin-1 binding
Ćelijska komponenta citoplazma
presynaptic active zone
međućelijske veze
ćelijska membrana
sinapsa
presynaptic membrane
membrana
terminal bouton
calyx of Held
presynapse
parallel fiber to Purkinje cell synapse
synaptic vesicle membrane
Nervno-mišićna veza
presynaptic active zone cytoplasmic component
Biološki proces GO:0007243 intracellular signal transduction
Egzocitoza
chemical synaptic transmission
synaptic vesicle exocytosis
negative regulation of synaptic plasticity
neuromuscular junction development
synaptic vesicle docking
synaptic vesicle priming
synaptic vesicle maturation
synaptic transmission, glutamatergic
dense core granule priming
presynaptic dense core vesicle exocytosis
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001080534
NM_001329919

NM_001081153
NM_153531

RefSeq (bjelančevina)

NP_001074003
NP_001316848

NP_001074622

Lokacija (UCSC)Chr 15: 53.98 – 54.63 MbChr 9: 73.39 – 73.88 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

UNC13 proteini, poput UNC13C, dijele homologiju sa Unc13 C. elegans i pretežno se eksprimiraju u mozgu. UNC13 proteini sadrže forbol, ester vezujući C1 domen i dva C2 domena

Hartz (2012) je mapirala gen UNC13C na hromosomu 15, sekvence q21.3, na osnovu poravnanja sekvence UNC13C (GenBank AK054981) sa genomskom sekvencom (GRCh37). Može imati ulogu u sazrijevanju vezikula tokom egzocitoze, kao meta puta drugog glasnika diacilglicerola. Može biti uključen u regulaciju sinaptsnog prenosa na paralelnim sinapsama vlakna – Purkinjeove ćelije (po sličnosti).

Kod sisara, proteini Munc13 tvore porodicu od tri receptora forbol-estera, prvenstveno specifičnih za mozak receptora forbol estera (Munc13-1/2/3) . Munc13-1 je komponenta presinapsnih aktivnih zona u kojima djeluje kao osnovni protein sinapse, koji puni vezikulu. Za razliku od Munc13-1, koji je prisutan u većini neurona u CNS-u pacova i miša, Munc13-3 je gotovo isključivo eksprimiran u malom mozgu. iRNK Munc13-3 je prisutna u granulama i Purkinjeovim ćelijama, ali nema je u ćelijama glije. Protein Munc13-3 lokaliziran je u sinapsnom neuropilu molekulskog sloja malog mozga, ali ga nema u dendritima Purkinjeovih ćelija, što ukazuje na to da je Munc13-3, poput Munc13-1, presinapsnii protein u paralelnim sinapsama vlakna – Purkinjeovih ćelija. Da bi se ispitala ulogu Munc13-3 u cerebelarnoj fiziologiji, generirani su mutirani miševi s nedostatkom Munc13-3. Delecijski mutanti Munc13-3 pokazuju povećanu olakšanost uparenog pulsa u paralelnim sinapsama vlakna-Purkinjeove ćelije. Pored toga, mutirani miševi pokazuju normalnu spontanu motornu aktivnost, ali imaju oštećenu sposobnost učenja složenih motornih zadataka. Ti podaci pokazuju da Munc13-3 regulira sinapanii prenos u paralelnim sinapsama vlakno – Purkinjeove ćelije. Predloženo je da Munc13-3 djeluje u sličnom koraku ciklusa sinapsnih vezikula kao i Munc13-1, iako s manje efikasnosti. S obzirom na sadašnje podatke i dobro uspostavljenu funkciju punjenja vezikula Munc13-1, vjerovatno je da gubitak Munc13-3 dovodi do smanjenja vjerovatnoće oslobađanja u paralelnim sinapsama vlakno – Purkinjeova ćelija, ometajući prajmeriranje vezikula. To bi zauzvrat dovelo do povećanja olakšavanja uparenog pulsa i moglo bi doprinijeti uočenom deficitu u učenju motornih funkcija.[6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 2.214 aminokiselina, a molekulska težina 250 911 Da.[7].

1020304050
MVANFFKSLILPYIHKLCKGMFTKKLGNTNKNKEYRQQKKDQDFPTAGQT
KSPKFSYTFKSTVKKIAKCSSTHNLSTEEDEASKEFSLSPTFSYRVAIAN
GLQKNAKVTNSDNEDLLQELSSIESSYSESLNELRSSTENQAQSTHTMPV
RRNRKSSSSLAPSEGSSDGERTLHGLKLGALRKLRKWKKSQECVSSDSEL
STMKKSWGIRSKSLDRTVRNPKTNALEPGFSSSGCISQTHDVMEMIFKEL
QGISQIETELSELRGHVNALKHSIDEISSSVEVVQSEIEQLRTGFVQSRR
ETRDIHDYIKHLGHMGSKASLRFLNVTEERFEYVESVVYQILIDKMGFSD
APNAIKIEFAQRIGHQRDCPNAKPRPILVYFETPQQRDSVLKKSYKLKGT
GIGISTDILTHDIRERKEKGIPSSQTYESMAIKLSTPEPKIKKNNWQSPD
DSDEDLESDLNRNSYAVLSKSELLTKGSTSKPSSKSHSARSKNKTANSSR
ISNKSDYDKISSQLPESDILEKQTTTHYADATPLWHSQSDFFTAKLSRSE
SDFSKLCQSYSEDFSENQFFTRTNGSSLLSSSDRELWQRKQEGTATLYDS
PKDQHLNGGVQGIQGQTETENTETVDSGMSNGMVCASGDRSHYSDSQLSL
HEDLSPWKEWNQGADLGLDSSTQEGFDYETNSLFDQQLDVYNKDLEYLGK
CHSDLQDDSESYDLTQDDNSSPCPGLDNEPQGQWVGQYDSYQGANSNELY
QNQNQLSMMYRSQSELQSDDSEDAPPKSWHSRLSIDLSDKTFSFPKFGST
LQRAKSALEVVWNKSTQSLSGYEDSGSSLMGRFRTLSQSTANESSTTLDS
DVYTEPYYYKAEDEEDYTEPVADNETDYVEVMEQVLAKLENRTSITETDE
QMQAYDHLSYETPYETPQDEGYDGPADDMVSEEGLEPLNETSAEMEIRED
ENQNIPEQPVEITKPKRIRPSFKEAALRAYKKQMAELEEKILAGDSSSVD
EKARIVSGNDLDASKFSALQVCGGAGGGLYGIDSMPDLRRKKTLPIVRDV
AMTLAARKSGLSLAMVIRTSLNNEELKMHVFKKTLQALIYPMSSTIPHNF
EVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMKCLECGVKCHEKCQDLLNADCLQR
AAEKSSKHGAEDKTQTIITAMKERMKIREKNRPEVFEVIQEMFQISKEDF
VQFTKAAKQSVLDGTSKWSAKITITVVSAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVG
KNKRRTKTIFGNLNPVWDEKFYFECHNSTDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQH
FKKESDDFLGQTIVEVRTLSGEMDVWYNLEKRTDKSAVSGAIRLKINVEI
KGEEKVAPYHIQYTCLHENLFHYLTEVKSNGGVKIPEVKGDEAWKVFFDD
ASQEIVDEFAMRYGIESIYQAMTHFSCLSSKYMCPGVPAVMSTLLANINA
FYAHTTVSTNIQVSASDRFAATNFGREKFIKLLDQLHNSLRIDLSKYREN
FPASNTERLQDLKSTVDLLTSITFFRMKVLELQSPPKASMVVKDCVRACL
DSTYKYIFDNCHELYSQLTDPSKKQDIPREDQGPTTKNLDFWPQLITLMV
TIIDEDKTAYTPVLNQFPQELNMGKISAEIMWTLFALDMKYALEEHENQR
LCKSTDYMNLHFKVKWFYNEYVRELPAFKDAVPEYSLWFEPFVMQWLDEN
EDVSMEFLHGALGRDKKDGFQQTSEHALFSCSVVDVFAQLNQSFEIIKKL
ECPNPEALSHLMRRFAKTINKVLLQYAAIVSSDFSSHCDKENVPCILMNN
IQQLRVQLEKMFESMGGKELDSEASTILKELQVKLSGVLDELSVTYGESF
QVIIEECIKQMSFELNQMRANGNTTSNKNSAAMDAEIVLRSLMDFLDKTL
SLSAKICEKTVLKRVLKELWKLVLNKIEKQIVLPPLTDQTGPQMIFIAAK
DLGQLSKLKEHMIREDARGLTPRQCAIMEVVLATIKQYFHAGGNGLKKNF
LEKSPDLQSLRYALSLYTQTTDALIKKFIDTQTSQSRSSKDAVGQISVHV
DITATPGTGDHKVTVKVIAINDLNWQTTAMFRPFVEVCILGPNLGDKKRK
QGTKTKSNTWSPKYNETFQFILGKENRPGAYELHLSVKDYCFAREDRIIG
MTVIQLQNIAEKGSYGAWYPLLKNISMDETGLTILRILSQRTSDDVAKEF
VRLKSETRSTEESA
Simboli

Kloniranje i ekspresija

uredi

Augustin et al. (2001) klonirali su mišji Unc13c, kojeg su nazvali Munc13-3. Hibridizacija in situ otkrila je istaknutu ekspresiju Unc13c samo u malom mozgu, sa najvećom obiljem u sloju zrnastih ćelija. Imunohistohemijska analiza otkrila je protein Unc13c gotovo isključivo u molekulskom sloju, u kojem paralelna aksonaka vlakana granulastih ćelija završavaju na dendritima neurona Purkinjeovih ćelija. Western blot analizom mišjeg mozga, otkriven je Unc13c pri prividnoj molekulskoj masi od preko 200 kD

Životinjski model

uredi

Augustin i dr. (2001) dobili su Munc13-3 miševe genotipa – /– u očekivanom mendelovskom omjeru. Miševi M unc13-3 – /– nisu pokazivali očite fizičke abnormalnosti ili poremećaje u ponašanju, bili su plodni i imali su normalan životni vijek. Anatomske, morfološke i ultrastrukturne analize cerebeluma Munc13-3 – /– otkrile su normalnu raspodjelu i gustinu nervnih ćelija, sa ukupnom strukturom koja se ne razlikuje od kontrola divljeg tipa. Snimke spojnog sloja otkrile su samo značajan porast olakšavanja uparenih impulsa na Munc13-3 –/– paralelnim sinapsama vlakno-Purkinjeova ćelija, sa normalnom amplitudom, vremenom porasta i učestalošću spontanih inhibitornih postsinapsnih odgovora. Detaljna analiza motornog učenja otkrila je značajan deficit motoričkog kod Munc13-3 –/– miševa, u poređenju sa divljim tipom, tek kada je zadatak postajao sve teži. Zaključili su da je MUNC13-3 regulator paralelnih sinapsi Purkinjeovih ćelija.[8]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137766 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062151 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Unc-13 homolog C (C. elegans)". Pristupljeno 11. 4. 2016.
  6. ^ Iris Augustin, Stefan Korte, Michael Rickmann, Hans A. Kretzschmar, Thomas C. Südhof, Jochen W. Herms, Nils Brose (2001): The Cerebellum-Specific Munc13 Isoform Munc13-3 Regulates Cerebellar Synaptic Transmission and Motor Learning in Mice. Journal of Neuroscience 1 January 2001, 21 (1) 10-17; DOI: https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.21-01-00010.2001
  7. ^ "UniProt, Q8NB66". Pristupljeno 17. 7. 2021.
  8. ^ Augustin, I., Korte, S., Rickmann, M., Kretzschmar, H. A., Sudhof, T. C., Herms, J. W., Brose, N. The cerebellum-specific Munc13 isoform Munc13-3 regulates cerebellar synaptic transmission and motor learning in mice. J. Neurosci. 21: 10-17, 2001. PubMed: 11150314

Dopunska literatura

uredi