Ubikvitinu-pridruženi protein 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom UBAP2.[5][6]

UBAP2
Identifikatori
AliasiUBAP2
Vanjski ID-jeviMGI: 1916176 HomoloGene: 73649 GeneCards: UBAP2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za UBAP2
Genomska lokacija za UBAP2
Bend9p13.3Početak33,921,693 bp[1]
Kraj34,048,949 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 4 (miš)
Hrom.Hromosom 4 (miš)[2]
Hromosom 4 (miš)
Genomska lokacija za UBAP2
Genomska lokacija za UBAP2
Bend4|4 A5Početak41,194,313 bp[2]
Kraj41,275,144 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa RNK
cadherin binding
Ćelijska komponenta jedro
citoplazma
Biološki proces GO:1901313 positive regulation of gene expression
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_020867
NM_001282529
NM_001282530
NM_018449

NM_026872

RefSeq (bjelančevina)
NP_001269459
NP_060919
NP_001356988
NP_001356991
NP_001356993

NP_001356995
NP_001356996
NP_001356997

NP_081148

Lokacija (UCSC)Chr 9: 33.92 – 34.05 MbChr 4: 41.19 – 41.28 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.119 aminokiselina, a molekulska težina 117.116 Da[7]

1020304050
MMTSVSSDHCRGAREKPQISAAQSTQPQKQVVQATAEQMRLAQVIFDKND
SDFEAKVKQLMEVTGKNQDECIVALHDCNGDVNKAINILLEGNSDTTSWE
TVGCKKKNFAKENSENKENREKKSEKESSRGRGNNNRKGRGGNRGREFRG
EENGIDCNQVDKPSDRGKRARGRGFGRGRGRGAGRFSTQGMGTFNPADYS
DSTSTDVCGTKLVVWEAAQNGADEGTELASNTHNIAQDLSNKSSYGLKGA
WKNSVEEWTTEDWTEDLSETKVFTASSAPAENHILPGQSIDLVALLQKPV
PHSQASEANSFETSQQQGFGQALVFTNSQHNNQMAPGTGSSTAVNSCSPQ
SLSSVLGSGFGELAPPKMANITSSQILDQLKAPSLGQFTTTPSTQQNSTS
HPTTTTSWDLKPPTSQSSVLSHLDFKSQPEPSPVLSQLSQRQQHQSQAVT
VPPPGLESFPSQAKLRESTPGDSPSTVNKLLQLPSTTIENISVSVHQPQP
KHIKLAKRRIPPASKIPASAVEMPGSADVTGLNVQFGALEFGSEPSLSEF
GSAPSSENSNQIPISLYSKSLSEPLNTSLSMTSAVQNSTYTTSVITSCSL
TSSSLNSASPVAMSSSYDQSSVHNRIPYQSPVSSSESAPGTIMNGHGGGR
SQQTLDTPKTTGPPSALPSVSSLPSTTSCTALLPSTSQHTGDLTSSPLSQ
LSSSLSSHQSSLSAHAALSSSTSHTHASVESASSHQSSATFSTAATSVSS
SASSGASLSSSMNTANSLCLGGTPASASSSSSRAAPLVTSGKAPPNLPQG
VPPLLHNQYLVGPGGLLPAYPIYGYDELQMLQSRLPVDYYGIPFAAPTAL
ASRDGSLANNPYPGDVTKFGRGDSASPAPATTPAQPQQSQSQTHHTAQQP
FVNPALPPGYSYTGLPYYTGMPSAFQYGPTMFVPPASAKQHGVNLSTPTP
PFQQASGYGQHGYSTGYDDLTQGTAAGDYSKGGYAGSSQAPNKSAGSGPG
KGVSVSSSTTGLPDMTGSVYNKTQTFDKQGFHAGTPPPFSLPSVLGSTGP
LASGAAPGYAPPPFLHILPAHQQPHSQLLHHHLPQDAQSGSGQRSQPSSL
QPKSQASKPAYGNSPYWTN

Funkcija

uredi

Ovaj gen je novi gen izoliran na osnovu njegove ekspresije u ljudskojk nadbubrežnoj žlijezdi. Protein cijele dužine kodiran ovim genom sadrži UBA-domen (domen povezan sa ubikvitinom), koji je motiv u nekoliko proteina koji imaju veze sa ubikvitinskim putem sveprisutnosti. Osim toga, protein sadrži područje slično domenu u članovima porodice atrofin-1. Funkcija ovog proteina nije utvrđena. Mogu postojati I dodatne alternativno prerađene varijante, ali njihova puna dužina nije utvrđena.[6]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137073 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028433 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Hofmann K, Bucher P (maj 1996). "The UBA domain: a sequence motif present in multiple enzyme classes of the ubiquitination pathway". Trends in Biochemical Sciences. 21 (5): 172–3. doi:10.1016/S0968-0004(96)30015-7. PMID 8871400.
  6. ^ a b "Entrez Gene: UBAP2 ubiquitin associated protein 2".
  7. ^ "UniProt, Q5T6F2". Pristupljeno 10. 9. 2021.

Dopunska literatura

uredi