Wikipedia

TTC37

(Preusmjereno sa Tetratrikopeptidni ponavljajući domen 37)

Tetratrikopeptidni ponavljajući domen 37 (TTC37) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom sa hromosoma 5.[5][6]

TTC37
Identifikatori
AliasiTTC37
Vanjski ID-jeviOMIM: 614589 MGI: 2679923 HomoloGene: 40966 GeneCards: TTC37
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za TTC37
Genomska lokacija za TTC37
Bend5q15Početak95,461,755 bp[1]
Kraj95,554,977 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za TTC37
Genomska lokacija za TTC37
Bend13|13 C1Početak76,246,853 bp[2]
Kraj76,338,435 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta• Ski complex
• nukleoplazma
• jedro
• citoplazma
• citosol
Biološki proces• exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA
• RNA catabolic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

9652

218343

Ensembl

ENSG00000198677

ENSMUSG00000033991

UniProt

Q6PGP7

F8VPK0

RefSeq (mRNK)

NM_014639

NM_001081352

RefSeq (bjelančevina)

NP_055454

NP_001074821

Lokacija (UCSC)Chr 5: 95.46 – 95.55 MbChr 13: 76.25 – 76.34 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 1.564 aminokiseline, a molekulska težina 175.486 Da.[6]

1020304050
MSSKEVKTALKSARDAIRNKEYKEALKHCKTVLKQEKNNYNAWVFIGVAA
AELEQPDQAQSAYKKAAELEPDQLLAWQGLANLYEKYNHINAKDDLPGVY
QKLLDLYESVDKQKWCDVCKKLVDLYYQEKKHLEVARTWHKLIKTRQEQG
AENEELHQLWRKLTQFLAESTEDQNNETQQLLFTAFENALGLSDKIPSED
HQVLYRHFIQSLSKFPHESARLKKACEGMINIYPTVQYPLEVLCLHLIES
GNLTDEGQQYCCRLVEMDSKSGPGLIGLGIKALQDKKYEDAVRNLTEGLK
ESPVCTSGWYHLAEAQVKMHRPKEAVLSCSQALKIVDNLGASGNSLYQRN
LCLHLKAEALIKLSDYDSSEEAIRTLDQISDADNIPGLLVLKSLAYRNKG
SFDEAAKIMEDLLSSYPDLAEVHALEALIHFTKKDYLQAEKCFQRALEKD
TEVAEYHYQLGLTYWFMGEETRKDKTKALTHFLKAARLDTYMGKVFCYLG
HYYRDVVGDKNRARGCYRKAFELDDTDAESGAAAVDLSVELEDMEMALAI
LTTVTQKASAGTAKWAWLRRGLYYLKAGQHSQAVADLQAALRADPKDFNC
WESLGEAYLSRGGYTTALKSFTKASELNPESIYSVFKVAAIQQILGKYKE
AVAQYQMIIKKKEDYVPALKGLGECHLMMAKAALVDYLDGKAVDYIEKAL
EYFTCALQHRADVSCLWKLAGDACTCLYAVAPSKVNVHVLGVLLGQKEGK
QVLKKNELLHLGGRCYGRALKLMSTSNTWCDLGINYYRQAQHLAETGSNM
NDLKELLEKSLHCLKKAVRLDSNNHLYWNALGVVACYSGIGNYALAQHCF
IKSIQSEQINAVAWTNLGVLYLTNENIEQAHEAFKMAQSLDPSYLMCWIG
QALIAEAVGSYDTMDLFRHTTELNMHTEGALGYAYWVCTTLQDKSNRETE
LYQYNILQMNAIPAAQVILNKYVERIQNYAPAFTMLGYLNEHLQLKKEAA
NAYQRAILLLQTAEDQDTYNVAIRNYGRLLCSTGEYDKAIQAFKSTPLEV
LEDIIGFALALFMKGLYKESSKAYERALSIVESEQDKAHILTALAITEYK
QGKTDVAKTLLFKCSILKEPTTESLQALCALGLAMQDATLSKAALNELLK
HIKHKDSNYQRCLLTSAIYALQGRSVAVQKQISKAVHSNPGDPALWSLLS
RVVAQYAQRNAKGGVVAGNVAHILDSNHGKKALLYTAVNQLAMGSSSAED
EKNTALKTIQKAALLSPGDPAIWAGLMAACHADDKLALVNNTQPKRIDLY
LALLSAVSASIKDEKFFENYNQSLEKWSLSQAVTGLIDTGRISEAETLCT
KNLKSNPDQPAVILLLRQVQCKPLLESQKPLPDAVLEELQKTVMSNSTSV
PAWQWLAHVYQSQGMMRAAEMCYRKSLQLASQRGSWSGKLSSLLRLALLA
LKVCMANISNDHWPSLVQEATTEALKLCFCPLAVLLQALLQFKRKMGARE
TRRLLERVVYQPGYPKSIASTARWYLLRHLYAKDDYELIDVLVNNAKTHG
DTRALELNQRLSSQ

Funkcija

uredi

Uključen je u takav biološki proces kao što je acetilacija.

Lokaliziran je u citoplazmi ijezdru.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198677 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033991 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23639" (jezik: engleski). Arhivirano s originala, 16. 9. 2017. Pristupljeno 18. 9. 2017.
  6. ^ a b "UniProt, Q6PGP7" (jezik: engleski). Pristupljeno 18. 9. 2017.

Dopunska literatura

uredi
  • NIH (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14: 2121–2127. PubMed doi:10.1101/gr.2596504

Vanjski linkovi

uredi
 Portal Biologija
Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=TTC37&oldid=3576284"