SPIN1

(Preusmjereno sa Spindlin-1)

Spindlin-1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SPIN1.[5][6]

SPIN1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2NS2, 4H75, 4MZF, 4MZG, 4MZH

Identifikatori
AliasiSPIN1
Vanjski ID-jeviOMIM: 609936 MGI: 109242 HomoloGene: 55983 GeneCards: SPIN1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za SPIN1
Genomska lokacija za SPIN1
Bend9q22.1Početak88,388,430 bp[1]
Kraj88,478,694 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za SPIN1
Genomska lokacija za SPIN1
Bend13 A5|13 26.04 cMPočetak51,254,916 bp[2]
Kraj51,306,582 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija methylated histone binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta jedro
Diobeno vreteno
Jedarce
nukleoplazma
citosol
Jedarna membrana
Biološki proces multicellular organism development
Wnt-signalni put
ćelijski ciklus
GO:0007126 Mejoza
rRNA transcription
gamete generation
positive regulation of Wnt signaling pathway
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_006717

NM_001283028
NM_001283029
NM_001283030
NM_011462
NM_146043

RefSeq (bjelančevina)

NP_006708

NP_001269957
NP_001269958
NP_001269959
NP_035592
NP_666155

Lokacija (UCSC)Chr 9: 88.39 – 88.48 MbChr 13: 51.25 – 51.31 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 262 aminokiseline, а molekulska težina 29.601 Da.[7]

1020304050
MKTPFGKTPGQRSRADAGHAGVSANMMKKRTSHKKHRSSVGPSKPVSQPR
RNIVGCRIQHGWKEGNGPVTQWKGTVLDQVPVNPSLYLIKYDGFDCVYGL
ELNKDERVSALEVLPDRVATSRISDAHLADTMIGKAVEHMFETEDGSKDE
WRGMVLARAPVMNTWFYITYEKDPVLYMYQLLDDYKEGDLRIMPDSNDSP
PAEREPGEVVDSLVGKQVEYAKEDGSKRTGMVIHQVEAKPSVYFIKFDDD
FHIYVYDLVKTS

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000106723 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021395 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Gao Y, Yue W, Zhang P, Li L, Xie X, Yuan H, Chen L, Liu D, Yan F, Pei X (Aug 2005). "Spindlin1, a novel nuclear protein with a role in the transformation of NIH3T3 cells". Biochem Biophys Res Commun. 335 (2): 343–50. doi:10.1016/j.bbrc.2005.07.087. PMID 16098913.
  6. ^ "Entrez Gene: SPIN1 spindlin 1".
  7. ^ "UniProt, Q9Y657". Pristupljeno 11. 9. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi