SSC4D
Član skavengerske porodice proteina bogatih cisteinom sa četiri domena jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SSC4D. [5]
| SSC4D | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | SSC4D | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 607639 MGI: 1924709 HomoloGene: 34137 GeneCards: SSC4D | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 7: 76.39 – 76.41 Mb | Chr 5: 135.99 – 136 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Aminokiselinska sekvenca
urediDužina polipeptidnog lanca je 575 aminokiselina, а molekulska težina 60.819 Da.[6]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MHKEAEMLIG | PQLDEKRWGW | RLGDGSAAPP | FLPQALSFLL | LLPLASALQP | ||||
| TPLPFQELRL | VGGPSRCRGR | LEVMHGGSWG | SVCDDDWDVV | DANVVCRQLG | ||||
| CGLALPVPRP | LAFGQGRGPI | LLDNVECRGQ | EAALSECGSR | GWGVHNCFHY | ||||
| EDVAVLCDEF | LPTQPPTRKM | LTSRAPPTTL | PNGKSEGSVR | LVGGANLCQG | ||||
| RVEILHSGLW | GTVCDDDWGL | PDAAVVCRQL | GCGAAMAATT | NAFFGYGTGH | ||||
| ILLDNVHCEG | GEPRLAACQS | LGWGVHNCGH | HEDAGALCAG | LGPPTLTALP | ||||
| SSATREDWAW | QTDPSATGVG | PQPSRETALL | TTAAWAAGKK | SGRLRLVGGP | ||||
| GPCRGRVEVL | HAGGWGTVCD | DDWDFADARV | ACREAGCGPA | LGATGLGHFG | ||||
| YGRGPVLLDN | VGCAGTEARL | SDCFHLGWGQ | HNCGHHEDAG | ALCAGPEELG | ||||
| LQVQQDGSET | TRVPTPRPRD | GHLRLVNGAH | RCEGRVELYL | GQRWGTVCDD | ||||
| AWDLRAAGVL | CRQLGCGQAL | AAPGEAHFGP | GRGPILLDNV | KCRGEESALL | ||||
| LCSHIRWDAH | NCDHSEDASV | LCQPS |
Funkcija
urediProteinski domen skavengerskog receptora bogatog cisteinom (SRCR) je stara i visoko konzervirana grupa površinskih ćelijskih i/ili izlučenih proteina, od kojih su neki uključeni u razvoj imunskog sistema i regulaciju urođenog i adaptivnih imunskih odgovora. SRCR domeni grupe B obično sadrže po osam pravilno raspoređenih cistein,a koji uzrokuju dobro definiran unutardomen disulfidne veze.
Reference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000146700 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029699 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains". Pristupljeno 2016-09-05.
- ^ "UniProt, Q8WTU2" (jezik: engleski). Zanemaren tekst "2021-09-29" (pomoć)
Dopunska literatura
uredi- Padilla O, Pujana MA, López-de la Iglesia A, Gimferrer I, Arman M, Vilà JM, Places L, Vives J, Estivill X, Lozano F (2002). "Cloning of S4D-SRCRB, a new soluble member of the group B scavenger receptor cysteine-rich family (SRCR-SF) mapping to human chromosome 7q11.23". Immunogenetics. 54 (9): 621–34. doi:10.1007/s00251-002-0507-z. PMID 12466895. S2CID 731351.