Protein 1 sa SH3 i SYLF domenom jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SH3YL1 sa hromosoma 2.[5]

SH3YL1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2D8H

Identifikatori
AliasiSH3YL1
Vanjski ID-jeviOMIM: 617314 MGI: 1346118 HomoloGene: 31662 GeneCards: SH3YL1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za SH3YL1
Genomska lokacija za SH3YL1
Bend2p25.3Početak217,730 bp[1]
Kraj266,398 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 12 (miš)
Hrom.Hromosom 12 (miš)[2]
Hromosom 12 (miš)
Genomska lokacija za SH3YL1
Genomska lokacija za SH3YL1
Bend12|12 A2Početak30,961,667 bp[2]
Kraj31,010,161 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija phosphatase binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
phosphatidylinositol binding
Ćelijska komponenta ruffle membrane
Biološki proces phosphatidylinositol biosynthetic process
regulation of ruffle assembly
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001159597
NM_001282682
NM_001282687
NM_015677

NM_001289480
NM_013709

RefSeq (bjelančevina)

NP_001153069
NP_001269611
NP_001269616
NP_056492

NP_001276409
NP_038737

Lokacija (UCSC)Chr 2: 0.22 – 0.27 MbChr 12: 30.96 – 31.01 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Amiokiselininska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 342 aminokiseline, a molekulska težina 37.148 Da.[6]

1020304050
MNNPIPSNLKSEAKKAAKILREFTEITSRNGPDKIIPAHVIAKAKGLAIL
SVIKAGFLVTARGGSGIVVARLPDGKWSAPSAIGIAGLGGGFEIGIEVSD
LVIILNYDRAVEAFAKGGNLTLGGNLTVAVGPLGRNLEGNVALRSSAAVF
TYCKSRGLFAGVSLEGSCLIERKETNRKFYCQDIRAYDILFGDTPRPAQA
EDLYEILDSFTEKYENEGQRINARKAAREQRKSSAKELPPKPLSRPQQSS
APVQLNSGSQSNRNEYKLYPGLSSYHERVGNLNQPIEVTALYSFEGQQPG
DLNFQAGDRITVISKTDSHFDWWEGKLRGQTGIFPANYVTMN

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000035115 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020669 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: SH3 and SYLF domain containing 1".
  6. ^ "UniProt, Q96HL8" (jezik: engleski). Pristupljeno 14. 11. 2021.

Dopunska literatura

uredi