Wikipedia

Protein cinkovog prsta 613

Protein 613 cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZNF613.[5]

Protein cinkovog prsta 613
Identifikatori
AliasiZNF613
Vanjski ID-jeviMGI: 1919404 HomoloGene: 57009 GeneCards: ZNF613
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za Protein cinkovog prsta 613
Genomska lokacija za Protein cinkovog prsta 613
Bend19q13.41Početak51,927,147 bp[1]
Kraj51,948,759 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za Protein cinkovog prsta 613
Genomska lokacija za Protein cinkovog prsta 613
Bend5|5 G2Početak138,441,468 bp[2]
Kraj138,460,694 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• vezivanje sa DNK
• vezivanje iona metala
• nucleic acid binding
• GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta• intracellular anatomical structure
• jedro
• nukleoplazma
Biološki proces• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• transcription, DNA-templated
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

79898

72154

Ensembl

ENSG00000176024

ENSMUSG00000036898

UniProt

Q6PF04

n/a

RefSeq (mRNK)

NM_001031721
NM_024840

NM_028130

RefSeq (bjelančevina)

NP_001026891
NP_079116

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 19: 51.93 – 51.95 MbChr 5: 138.44 – 138.46 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš
Aminokiselinska sekvenca
Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

1020304050
MIKSQESLTLEDVAVEFTWEEWQLLGPAQKDLYRDVMLENYSNLVSVGYQ
ASKPDALFKLEQGEPWTVENEIHSQICPEIKKVDNHLQMHSQKQRCLKRV
EQCHKHNAFGNIIHQRKSDFPLRQNHDTFDLHGKILKSNLSLVNQNKRYE
IKNSVGVNGDGKSFLHAKHEQFHNEMNFPEGGNSVNTNSQFIKHQRTQNI
DKPHVCTECGKAFLKKSRLIYHQRVHTGEKPHGCSICGKAFSRKSGLTEH
QRNHTGEKPYECTECDKAFRWKSQLNAHQKIHTGEKSYICSDCGKGFIKK
SRLINHQRVHTGEKPHGCSLCGKAFSKRSRLTEHQRTHTGEKPYECTECD
KAFRWKSQLNAHQKAHTGEKSYICRDCGKGFIQKGNLIVHQRIHTGEKPY
ICNECGKGFIQKGNLLIHRRTHTGEKPYVCNECGKGFSQKTCLISHQRFH
TGKTPFVCTECGKSCSHKSGLINHQRIHTGEKPYTCSDCGKAFRDKSCLN
RHRRTHTGERPYGCSDCGKAFSHLSCLVYHKGMLHAREKCVGSVKLENPC
SESHSLSHTRDLIQDKDSVNMVTLQMPSVAAQTSLTNSAFQAESKVAIVS
QPVARSSVSADSRICTE

Interakcije uredi

Pokazalo se da proteini cinkovog prsta ulaze u interakciju s nukleinskim kiselinama i imaju različite funkcije. Domen cinkovog prsta je konzervirani motiv aminokiselinske sekvence koji sadrži po dva posebno postavljena cisteina i histidina, koji su uključeni u koordinaciju cinka. Proteini povezani sa Kruppelom čine jednu porodicu proteina cinkovih prstiju.[5]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000176024 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000036898 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: Zinc finger protein 613". Pristupljeno 28. 1. 2016.

Dopunska literatura uredi

Vanjski linkovi uredi

Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=Protein_cinkovog_prsta_613&oldid=3321739"