PDCD5

gen koji kodira protein u vrsti Homo sapiens

Prtein 5 programirane ćelijske smrti je protein koji jr kod ljudi kodiran genom PDCD5.[4][5]

PDCD5
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1YYB, 2CRU, 2K6B

Identifikatori
AliasiPDCD5, TFAR19, protein 5 programirane ćelijske smrti
Vanjski ID-jeviOMIM: 604583 MGI: 3782009 HomoloGene: 10506 GeneCards: PDCD5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za PDCD5
Genomska lokacija za PDCD5
Bend19q13.11Početak32,581,190 bp[1]
Kraj32,587,453 bp[1]
Ontologija gena
Molekularna funkcija DNA binding
heparin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
acetyltransferase activator activity
beta-tubulin binding
Ćelijska komponenta citoplazma
Egzosom
Jedro
citosol
Biološki proces cellular response to transforming growth factor beta stimulus
negative regulation of chaperone-mediated protein folding
positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria
GO:0097285 Apoptoza
positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of protein insertion into mitochondrial outer membrane
negative regulation of cell population proliferation
positive regulation of apoptotic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_004708

XM_001478256

RefSeq (bjelančevina)

NP_004699

NP_062720

Lokacija (UCSC)Chr 19: 32.58 – 32.59 Mbn/a
PubMed pretraga[2][3]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira protein sa ekspresijom u tumorskim ćelijama tokom apoptoze, neovisno od stimulusa koji je induciraju. Prije indukcije apoptoze, ovaj genski proizvod distribuira se i u jedru i citoplazmi.

Kada se inducira apoptoza, nivo ovog proteina raste i prelaskom iz citoplazme akumulira se u jedru. Iako njegova tačna funkcija nije definirana, smatra se da ovaj protein ima ranu i univerzalnu ulogu u apoptozi.[5]

Kloniranje i ekspresija uredi

Koristeći analizu razlika predstavnika cDNK, Liu et al. (1999) identificirali su novi gen, označen kao TFAR19, iz ćelija TF1 (ljudske premeloidne ćelijske linije, uspostavljene od pacijenta sa eritroleukemijom) koje su podvrgnute apoptozi, nakon povlačenja GM-CSF iz medija za kulturu ćelija. Gen TFAR19 kodira protein od 125 aminokiselina, sa ATG inicijacijskim kodonom na nukleotidima 25-27. Sadrži mjesto fosforilacije protein-kinaze ovisne o cAMP-u i cGMP-u, više mjesta fosforilacije protein-kinaze C i mjesto fosforilacije kazein-kinaze II. Dijeli značajnu homologiju s odgovarajućim proteinima nekih vrsta, od kvasaca do miševa. Predviđa se je protein TFAR19 lokaliziran u jedru. Analiza točkastih obojenja pokazala je da se TFAR19 sveprisutno eksprimira, ali je najistaknutiji u srcu, sjemenici, bubrezima, hipofizi, [[nadbubrežna žlijezda|nadbubrežnoj žlijezdi i posteljici. Ekspresija u fetusnim tkivima je znatno niža od ekspresije u tkivima odraslih. Ekspresija TFAR19 je pojačano regulirana u ćelijama tumora koje su u apoptozi i pojačava apoptozu izazvanu faktorom rasta ili lišavanjem seruma.[6][7]

Aminokiselinski sastav uredi

Simboli
1020304050
MADEELEALRRQRLAELQAKHGDPGDAAQQEAKHREAEMRNSILAQVLDQ
SARARLSNLALVKPEKTKAVENYLIQMARYGQLSEKVSEQGLIEILKKVS
QQTEKTTTVKFNRRKVMDSDEDDDY

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105185 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ Liu H, Wang Y, Zhang Y, Song Q, Di C, Chen G, Tang J, Ma D (Feb 1999). "TFAR19, a novel apoptosis-related gene cloned from human leukemia cell line TF-1, could enhance apoptosis of some tumor cells induced by growth factor withdrawal". Biochem Biophys Res Commun. 254 (1): 203–10. doi:10.1006/bbrc.1998.9893. PMID 9920759.
  5. ^ a b "Entrez Gene: PDCD5 programmed cell death 5".
  6. ^ Lisitsyn, N., Lisitsyn, N., Wigler, M. Cloning the differences between two complex genomes. Science 259: 946-951, 1993. [PubMed]: 8438152
  7. ^ Liu, H., Wang, Y., Zhang, Y., Song, Q., Di, C., Chen, G., Tang, J., Ma, D. TFAR19, a novel apoptosis-related gene cloned from human leukemia cell line TF-1, could enhance apoptosis of some tumor cells induced by growth factor withdrawal. Biochem. Biophys. Res. Commun. 254: 203-210, 1999. PubMed: 9920759.

Dopunska literatura uredi