OSCAR (gen)

gen koji kodira protein u vrsti Homo sapiens

Osteoklastno pridruženi imunoglobulinoliki receptor je protein koji je kod ljudi kodiran genom OSCAR.[5][6]

OSCAR
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

5EIV, 5EIQ, 5CJB, 5CJ8

Identifikatori
AliasiOSCAR, PIGR3, PIgR-3, osteoklastno pridruženi imunoglobulinoliki receptor
Vanjski ID-jeviOMIM: 606862 MGI: 2179720 HomoloGene: 77042 GeneCards: OSCAR
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za OSCAR
Genomska lokacija za OSCAR
Bend19q13.42Početak54,094,668 bp[1]
Kraj54,102,692 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za OSCAR
Genomska lokacija za OSCAR
Bend7|7 A1Početak3,612,812 bp[2]
Kraj3,619,156 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija collagen receptor activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
extracellular region
ćelijska membrana
Egzosom
membrana
specific granule lumen
tertiary granule lumen
Biološki proces regulation of immune response
neutrophil degranulation
osteoclast differentiation
collagen-activated signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
ENSG00000277088
ENSG00000170909
ENSG00000274703
ENSG00000276982
ENSG00000278533
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001282349
NM_001282350
NM_130771
NM_133168
NM_133169

NM_206817
NM_206818

NM_001290377
NM_175632

RefSeq (bjelančevina)
NP_001269278
NP_001269279
NP_570127
NP_573398
NP_573399

NP_996554

NP_001277306
NP_783440

Lokacija (UCSC)Chr 19: 54.09 – 54.1 MbChr 7: 3.61 – 3.62 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Osteoklasti su multijedarne ćelije koje resorbiraju kosti i ključni su za njihovu homeostazu. Ovaj gen kodira receptor povezan sa osteoklastom (OSCAR), koji je član porodice proteina kompleksa leukocitnih receptora (LRC) koji ima kritičnu ulogu u regulaciji i urođenih i adaptivnih imunskih odgovora. Za razliku od ostalih članova LRC, ekspresija OSCAR-a se posebno otkriva u preosteoklastima ili zrelim osteoklastima. OSCAR može biti važan za kosti kao specifični regulator diferencijacije osteoklasta. Za ovaj gen pronađeno je više varijanti alternativno prerađenog transkripta koje kodiraju različite izoforme..[6]

Aminokliselinska sekvenca uredi

Simboli
1020304050
MALVLILQLLTLWPLCHTDITPSVPPASYHPKPWLGAQPATVVTPGVNVT
LRCRAPQPAWRFGLFKPGEIAPLLFRDVSSELAEFFLEEVTPAQGGIYRC
CYRRPDWGPGVWSQPSDVLELLVTEELPRPSLVALPGPVVGPGANVSLRC
AGRLRNMSFVLYREGVAAPLQYRHSAQPWADFTLLGARAPGTYSCYYHTP
SAPYVLSQRSEVLVISWEGEGPEARPASSAPGMQAPGPPPSDPGAQAPSL
SSFRPRGLVLQPLLPQTQDSWDPAPPPSDPGV

Kloniranje i ekspresija uredi

PCR dedukcijom biblioteka OC miša i cDNK makrofaga, nakon čega slijedi skrining ljudske OC cDNK biblioteke, Kim et al. (2002) dobili su cDNK koje kodiraju OSCAR miša i čovjeka. Izvedeni transmembranski ljudski protein tipa I sa 263 aminokiseline je 73% identičan mišjem proteinu. Sadrži dva vanćelijska domena slična imunoglobulinu, koji su homologni proteinima kompleksa receptora leukocita (npr. NKp46), napunjeni ostatak arg u transmembranskoj regiji i kratki citoplazmatski rep. Northern blot analizom otkrivena je ekspresija transkripata od 1,8 i 1,0 kb u OC-ima i kostiju miša. Nije otkrivena ekspresija u makrofazima, dendritskim ćelijama ili mehkim tkivima, što upućuje na specifičnu ekspresiju OC. Protočne citometrijske i imunohistokemijske analize pokazale su ekspresiju mišjeg Oscara pretežno na zrelim OC-ima, bez ekspresije na makrofazima, dendritskim ćelijama, prirodnim ubicama ili limfocitima.

Funkcija gena uredi

Kim et al. (2002) pokazali su da topivi Oscar inhibira stvaranje OC-a iz prekursorskih ćelija koštane srži, stimulirane osteoblastima, ali ne inhibira stvaranje OC-a iz mijeloidnih ćelijskih linija stimuliranih topljivim TRANCE-om. Protočna citometrijska analiza osteoblasta na ovim ćelijama, sugerirala je prisustvo OSCAR-ovog liganda. Kim et al. (2005) otkrili su da je faktor transkripcije ekspresiju Oscara inducirao Nfatc1, vežući se direktno za određena mjesta u njegovoj promotorskoj regiji tokom diferencijacije mišjih osteoklasta. Nfatc1, Mitf i Pu.1 (SPI1; 165170) djelovali su sinergijski, kako bi stimulirali aktivnost promotora Oscara, uz sudjelovanje Mkk6 (MAP2K6) / p38 (MAPK14) signalnog puta. Barrow et al. (2015) koristili su pristup bioinformatike za identifikaciju kolagenskih molekula s imunskim ulogama, koje sadrže navodni motiv koji veže OSCAR. Autori su na taj način identificirali kolageni domen SPD (SFTPD) i pokazali da je to specifični, OSCAR-ov partner za vezanje s povećanim kalcijem. SPD pune dužine u bronhoalveolskoj tekućini za ispiranje također je vezao OSCAR. Imunofluorescentna mikroskopija pokazala je da su alveolski makrofagi, koji sadrže SPD, vezali OSCAR u unutarćelijskim odjeljcima, dok je OSCAR pretežno eksprimiran na intersticijskoj površini pluća i krvi CCR2 pozitivnih upalnih monocita. Nakon stimulacije SPD-om, ovi monociti luče TNF. OSCAR i SPD su također visoko eksprimirani u aterosklerotskim plakovima u aorti. Barrow et al. (2015) predložili su da interakcija OSCAR/SPD može biti meta kod hroničnih upalnih bolesti pluća.[7][8][9]

Reference uredi

  1. ^ a b c ENSG00000170909, ENSG00000274703, ENSG00000276982, ENSG00000278533, ENSG00000275736, ENSG00000275551, ENSG00000278378, ENSG00000273511, ENSG00000275644 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000277088, ENSG00000170909, ENSG00000274703, ENSG00000276982, ENSG00000278533, ENSG00000275736, ENSG00000275551, ENSG00000278378, ENSG00000273511, ENSG00000275644 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000054594 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Kim N, Takami M, Rho J, Josien R, Choi Y (Jan 2002). "A novel member of the leukocyte receptor complex regulates osteoclast differentiation". J Exp Med. 195 (2): 201–9. doi:10.1084/jem.20011681. PMC 2193610. PMID 11805147.
  6. ^ a b "Entrez Gene: OSCAR osteoclast-associated receptor".
  7. ^ Barrow, A. D., Palarasah, Y., Bugatti, M., Holehouse, A. S., Byers, D. E., Holtzman, M. J., Vermi, W., Skjodt, K., Crouch, E., Colonna, M. OSCAR is a receptor for surfactant protein D that activates TNF-alpha release from human CCR2+ inflammatory monocytes. J. Immun. 194: 3317-3326, 2015. [PubMed]: 25716998
  8. ^ Kim, K., Kim, J. H., Lee, J., Jin, H.-M., Lee, S.-H., Fisher, D. E., Kook, H., Kim, K. K., Choi, Y., Kim, N. Nuclear factor of activated T cells c1 induces osteoclast-associated receptor gene expression during tumor necrosis factor-related activation-induced cytokine-mediated osteoclastogenesis. J. Biol. Chem. 280: 35209-35216, 2005. [PubMed]: 16109714
  9. ^ Kim, N., Takami, M., Rho, J., Josien, R., Choi, Y. A novel member of the leukocyte receptor complex regulates osteoclast differentiation. J. Exp. Med. 195: 201-209, 2002. PubMed: 11805147

Dopunska literatura uredi