Mikrofibrilski-pridruženi protein 5 je protein koji je kod ljudi kodiran genom MFAP5.[5][6][7]

MFAP5
Identifikatori
AliasiMFAP5
Vanjski ID-jeviOMIM: 601103 MGI: 1354387 HomoloGene: 2599 GeneCards: MFAP5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za MFAP5
Genomska lokacija za MFAP5
Bend12p13.31Početak8,637,346 bp[1]
Kraj8,662,888 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za MFAP5
Genomska lokacija za MFAP5
Bend6|6 F1Početak122,482,804 bp[2]
Kraj122,506,249 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija extracellular matrix structural constituent
Ćelijska komponenta extracellular region
Mikrovlakno
GO:0005578 Vanćelijski matriks
collagen-containing extracellular matrix
Biološki proces definitive hemopoiesis
extracellular matrix organization
supramolecular fiber organization
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001297709
NM_001297710
NM_001297711
NM_001297712
NM_003480

NM_015776
NM_001347434

RefSeq (bjelančevina)

NP_001284638
NP_001284639
NP_001284640
NP_001284641
NP_003471

NP_001334363
NP_056591

Lokacija (UCSC)Chr 12: 8.64 – 8.66 MbChr 6: 122.48 – 122.51 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira glikoprotein od 25-kD, povezan s mikrofibrilama koji je bogat ostacima serina i treonina. Nedostaju mu hidrofobne regije C-krajevi bogati prolinom, glutaminom i tirozinom, što je karakteristika srodnog glikoproteina povezanog s mikrofibrilom od 31 kDa (MFAP2). Bliska sličnost između ova dva proteina ograničena je na centralno područje od 60 aminokiselina, gdje dolazi do preciznog poravnanja sedam ostataka cisteina. Strukturne razlike ukazuju na to da ovaj kodirani protein ima neke funkcije koje se razlikuju od funkcija MFAP2.[7]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 173 aminokiseline, a molekulska težina 19.612 Da.[8].

1020304050
MSLLGPKVLLFLAAFIITSDWIPLGVNSQRGDDVTQATPETFTEDPNLVN
DPATDETVLAVLADIAPSTDDLASLSEKNTTAECWDEKFTCTRLYSVHRP
VKQCIHQLCFTSLRRMYIVNKEICSRLVCKEHEAMKDELCRQMAGLPPRR
LRRSNYFRLPPCENVDLQRPNGL
Simboli

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197614 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030116 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Hatzinikolas G, Gibson MA (Dec 1998). "The exon structure of the human MAGP-2 gene. Similarity with the MAGP-1 gene is confined to two exons encoding a cysteine-rich region". J Biol Chem. 273 (45): 29309–14. doi:10.1074/jbc.273.45.29309. PMID 9792630.
  6. ^ Gibson MA, Hatzinikolas G, Kumaratilake JS, Sandberg LB, Nicholl JK, Sutherland GR, Cleary EG (Feb 1996). "Further characterization of proteins associated with elastic fiber microfibrils including the molecular cloning of MAGP-2 (MP25)". J Biol Chem. 271 (2): 1096–103. doi:10.1074/jbc.271.2.1096. PMID 8557636.
  7. ^ a b "Entrez Gene: MFAP5 microfibrillar associated protein 5".
  8. ^ "UniProt, Q13361". Pristupljeno 11. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi