Leucinski zatvarač, navodni član porodice supresora tumora 3 je protein koji je kod ljudi kodiran genom LZTS3.[5]

LZTS3
Identifikatori
AliasiLZTS3
Vanjski ID-jeviOMIM: 610484 MGI: 2656976 HomoloGene: 8824 GeneCards: LZTS3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za LZTS3
Genomska lokacija za LZTS3
Bend20p13Početak3,162,617 bp[1]
Kraj3,173,549 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za LZTS3
Genomska lokacija za LZTS3
Bend2|2 F1Početak130,474,759 bp[2]
Kraj130,484,723 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001282533
NM_014731
NM_001365618
NM_001367609
NM_001388189

NM_001388190
NM_001388191
NM_001388192
NM_001388193

NM_001291027
NM_001291028
NM_197945

RefSeq (bjelančevina)

NP_001269462
NP_001352547
NP_001354538

NP_001277956
NP_001277957
NP_922936

Lokacija (UCSC)Chr 20: 3.16 – 3.17 MbChr 2: 130.47 – 130.48 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Sekvenciranjem klonova dobijenih iz frakcionirane biblioteke cDNK ljudskog mozga, kloniran je KIAA0552, koja sadrži ponavljajući element u svom 3-baznom UTR-u, a izvedeni protein sadrži 673 aminokiselina. Prevedeni protein imao je pretpostavljenu molekulsku masu od 75 kD, pomoću SDS-PAGE. RT-PCR-om je otkrivena visoka ekspresija u mozgu i bubrezima, srednju ekspresiju u srcu, posteljici, jajnicima i tankom crijevu i slabu ekspresiju u plućima, jetri, skeletnim mišićima, gušterači, prostati i sjemenicima. U slezeni i timusu nije otkrivena bilo kakva ekspresija.

Western blot analiza pokazala je da su se nivoi proteina povećali u mozgu pacova nakon rođenja i bili najviši u dobi od tri mjeseca. Najviši nivoi bili su u kori velikog mozga, malom mozgu i hipokampusu. Subćelijska frakcionacija otkrila je obogaćivanje Prosapip1 u postsinapsnim denzitetima (PSD) u primarnim kulturama pacovskog hipokampusnog proteina koji se kolonizirao u PSD s Prosap2 (SHANK3; 606230).

Funkcija

uredi

2-hibridnom analizom kvasaca, otkriveno je da je pacovski Prosapip1 stupio u interakciju s Prosap2. Analiza delecija pokazala je da je motiv vezanja PDZ domena Prosapip1 vezao PDZ domen Prosap2. Testovi koimunoprecipitacije homogenata pacovskog mozga potvrdili su interakciju Prosapip1-Prosap2. Prosapip1 je formirao homodimere i heteromultimere sa PSD-Zip70 (LZTS1; 606551), a oba proteina su u sinapse uključila SPAR (SIPA1L1) [6][7]

Aminokiselinska sekvenca

uredi
1020304050
MAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPDPRLAMGSVGSGVAHAQEF
AMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRGSGSGASRERPGRYPSEDKGLANSLYLN
GELRGSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAPPQYREPSHPPKLLATSGK
LDQCSEPLVRPSAFKPVVPKNFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGPGGLKGGL
DKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTSHINR
IGTASYGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLGSG
EGGGGGLPFAACSPPSPSALIQELEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVA
QVLEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDK
KQLQEEAARLMRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEETKWEVCQKAGEIS
LLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSS
KQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKMRRQAGVA
AAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAE
ERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPT
PQHGEEKKAWTPSRLERIESTEI

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000088899 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037703 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3". Pristupljeno 3. 6. 2013.
  6. ^ Nagase, T., Ishikawa, K., Miyajima, N., Tanaka, A., Kotani, H., Nomura, N., Ohara, O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro. DNA Res. 5: 31-39, 1998. PubMed: 9628581.
  7. ^ Wendholt, D., Spilker, C., Schmitt, A., Dolnik, A., Smalla, K.-H., Proepper, C., Bockmann, J., Sobue, K., Gundelfinger, E. D., Kreutz, M. R., Boeckers, T. M. ProSAP-interacting protein 1 (ProSAPiP1), a novel protein of the postsynaptic density that links the spine-associated Rap-Gap (SPAR) to the scaffolding protein ProSAP2/Shank3. J. Biol. Chem. 281: 13805-13816, 2006. PubMed: 16522626.